More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0014 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0014  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 260 aa  515  1.0000000000000001e-145  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  42.08 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  42.47 
 
 		 270 aa  186  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  43.41 
 
 		 269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  39.76 
 
 		 260 aa  181  8.000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  41.86 
 
 		 285 aa  178  8e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  45.58 
 
 		 266 aa  178  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  45.58 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4475  phosphomethylpyrimidine kinase  44.63 
 
 		 259 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  41.2 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  39.76 
 
 		 268 aa  176  5e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  43.04 
 
 		 268 aa  172  6.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1813  phosphomethylpyrimidine kinase  43.02 
 
 		 275 aa  171  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  40.15 
 
 		 271 aa  170  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0957  phosphomethylpyrimidine kinase  44.12 
 
 		 269 aa  170  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.297451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  40.93 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2627  phosphomethylpyrimidine kinase  39.92 
 
 		 279 aa  170  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  41.04 
 
 		 267 aa  169  4e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  35.8 
 
 		 269 aa  168  6e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  39.6 
 
 		 266 aa  168  7e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  42.08 
 
 		 272 aa  168  7e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  38.82 
 
 		 266 aa  168  9e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  38.82 
 
 		 266 aa  168  9e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  38.82 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3900  phosphomethylpyrimidine kinase  38.08 
 
 		 291 aa  167  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  38.82 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  38.82 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  38.82 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  38.82 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  38.82 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  38.82 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0368  phosphomethylpyrimidine kinase  40.82 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  40.23 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  40.23 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  39.36 
 
 		 266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  39.31 
 
 		 270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  40.38 
 
 		 271 aa  166  4e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  41.89 
 
 		 268 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2399  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 		 287 aa  165  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  38.55 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  41.47 
 
 		 266 aa  162  4.0000000000000004e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  38.46 
 
 		 285 aa  162  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4828  phosphomethylpyrimidine kinase  40.64 
 
 		 273 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  41.83 
 
 		 268 aa  162  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  37.55 
 
 		 290 aa  162  6e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  41.8 
 
 		 492 aa  161  9e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1265  phosphomethylpyrimidine kinase  41.15 
 
 		 267 aa  161  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  41.13 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  41.31 
 
 		 490 aa  160  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  40.32 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  37.65 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  38.04 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  39.92 
 
 		 268 aa  159  4e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  36 
 
 		 270 aa  159  5e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4968  phosphomethylpyrimidine kinase  45.73 
 
 		 267 aa  159  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.949163  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2662  phosphomethylpyrimidine kinase  37.21 
 
 		 281 aa  159  6e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  42.97 
 
 		 497 aa  158  7e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  34.66 
 
 		 267 aa  158  8e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1709  phosphomethylpyrimidine kinase  40.33 
 
 		 271 aa  158  1e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  40.08 
 
 		 270 aa  157  1e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  40 
 
 		 280 aa  157  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  38.85 
 
 		 288 aa  157  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  39.3 
 
 		 277 aa  157  1e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  39.85 
 
 		 265 aa  157  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  39.44 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  41.38 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1958  phosphomethylpyrimidine kinase  45.3 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0610158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  39.04 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  42.79 
 
 		 267 aa  156  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  39.04 
 
 		 266 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  37.21 
 
 		 260 aa  156  4e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  40.08 
 
 		 270 aa  156  4e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  39.04 
 
 		 266 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2555  phosphomethylpyrimidine kinase  36.92 
 
 		 280 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  40.08 
 
 		 270 aa  155  5.0000000000000005e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  41.86 
 
 		 266 aa  155  6e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0134  phosphomethylpyrimidine kinase  39.67 
 
 		 271 aa  155  7e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3651  phosphomethylpyrimidine kinase  42.96 
 
 		 303 aa  155  7e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  36.95 
 
 		 267 aa  155  8e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  43.85 
 
 		 264 aa  155  8e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  36.78 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  37.2 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  36.55 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  37.35 
 
 		 262 aa  153  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2435  phosphomethylpyrimidine kinase  40 
 
 		 285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03951  phosphomethylpyrimidine kinase  37.08 
 
 		 259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.941064  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1361  phosphomethylpyrimidine kinase  40.71 
 
 		 268 aa  152  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3328  phosphomethylpyrimidine kinase  42.01 
 
 		 303 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0042  phosphomethylpyrimidine kinase  40.91 
 
 		 284 aa  152  5e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0834315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  40.32 
 
 		 274 aa  152  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  43.24 
 
 		 297 aa  152  5.9999999999999996e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1281  phosphomethylpyrimidine kinase  39.92 
 
 		 273 aa  152  7e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0223947  normal  0.790704 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4493  phosphomethylpyrimidine kinase  38.61 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0381  phosphomethylpyrimidine kinase  32.55 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03941  phosphomethylpyrimidine kinase  35.83 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0914  phosphomethylpyrimidine kinase  34.77 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  40.78 
 
 		 484 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  34.12 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  36.54 
 
 		 265 aa  150  3e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  33.2 
 
 		 273 aa  149  4e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>