More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0624 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0624  aminotransferase, class V  100 
 
 		 385 aa  780    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292698 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1568  cysteine desulfurase  67.3 
 
 		 373 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1755  cysteine desulfurase  67.3 
 
 		 373 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.983783  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0379  cysteine desulfurase  67.3 
 
 		 373 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2865  cysteine desulfurase  67.3 
 
 		 373 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0422  cysteine desulfurase  67.3 
 
 		 373 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1225  cysteine desulfurase  67.3 
 
 		 414 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.738138  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2179  cysteine desulfurase  50.41 
 
 		 373 aa  389  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2808  aminotransferase, class V  53.91 
 
 		 379 aa  387  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  51.06 
 
 		 380 aa  372  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  48.7 
 
 		 393 aa  355  1e-96  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  51.33 
 
 		 379 aa  354  2e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  47.64 
 
 		 392 aa  352  5e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  48.41 
 
 		 382 aa  351  1e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  51.81 
 
 		 399 aa  351  2e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  50.13 
 
 		 400 aa  348  6e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  47.11 
 
 		 394 aa  348  9e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  49.87 
 
 		 392 aa  348  1e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  46.81 
 
 		 382 aa  347  2e-94  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0188  aminotransferase class V  52.88 
 
 		 382 aa  345  6e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.431625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  50 
 
 		 383 aa  342  7e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  50.66 
 
 		 396 aa  342  9e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  47.38 
 
 		 398 aa  341  1e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  47.38 
 
 		 396 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  48.14 
 
 		 403 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  45.81 
 
 		 384 aa  339  4e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  47.27 
 
 		 396 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  45.79 
 
 		 384 aa  335  5.999999999999999e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  48.28 
 
 		 388 aa  334  2e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  49.87 
 
 		 398 aa  334  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  46.23 
 
 		 398 aa  333  4e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  45.45 
 
 		 394 aa  330  2e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  48.82 
 
 		 399 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  45.1 
 
 		 404 aa  330  4e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  46.44 
 
 		 394 aa  329  6e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  48.94 
 
 		 394 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  47.48 
 
 		 400 aa  326  3e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  46.68 
 
 		 414 aa  327  3e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  45.71 
 
 		 405 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  46.93 
 
 		 400 aa  326  4.0000000000000003e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  47.79 
 
 		 398 aa  325  6e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  46.44 
 
 		 384 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  47.48 
 
 		 402 aa  325  1e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2558  cysteine desulfurase NifS  47.64 
 
 		 388 aa  324  1e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.947611  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  46.01 
 
 		 402 aa  324  2e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  48.53 
 
 		 404 aa  324  2e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  48.42 
 
 		 388 aa  323  4e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  46.19 
 
 		 404 aa  322  5e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  46.13 
 
 		 407 aa  322  8e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1360  cysteine desulfurase IscS  46.97 
 
 		 408 aa  322  8e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1487  cysteine desulfurase IscS  46.37 
 
 		 406 aa  321  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000124631  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  45.53 
 
 		 400 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  48.8 
 
 		 401 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  48.17 
 
 		 392 aa  320  3e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2059  cysteine desulfurase IscS  46.48 
 
 		 407 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0733618  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21090  cysteine desulfurase family protein  48.17 
 
 		 392 aa  318  7.999999999999999e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.822345  normal  0.14044 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  45.38 
 
 		 407 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  45.38 
 
 		 407 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  45.67 
 
 		 404 aa  318  9e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  46.34 
 
 		 398 aa  318  1e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  46.34 
 
 		 398 aa  318  1e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  44.94 
 
 		 405 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  44.94 
 
 		 405 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  45.38 
 
 		 407 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  44.59 
 
 		 407 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  44.85 
 
 		 407 aa  317  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  45.12 
 
 		 407 aa  317  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  45.93 
 
 		 404 aa  316  3e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  47.47 
 
 		 401 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  46.13 
 
 		 389 aa  316  3e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  47.47 
 
 		 401 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2317  cysteine desulfurase  46.72 
 
 		 404 aa  316  5e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.459864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  45.38 
 
 		 407 aa  316  5e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  45.38 
 
 		 407 aa  316  5e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  45.38 
 
 		 407 aa  316  5e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  45.41 
 
 		 404 aa  315  6e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  45.24 
 
 		 407 aa  316  6e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1063  aminotransferase class V  47.97 
 
 		 388 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  44.71 
 
 		 407 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  47.62 
 
 		 383 aa  314  9.999999999999999e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0872  cysteine desulfurase  48.02 
 
 		 380 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0149083 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  46.13 
 
 		 396 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  44.71 
 
 		 407 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0808  cysteine desulfurase IscS  45.31 
 
 		 405 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000772731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  44.71 
 
 		 407 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  44.71 
 
 		 407 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  44.88 
 
 		 404 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  44.44 
 
 		 407 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  44.88 
 
 		 404 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  44.71 
 
 		 407 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  44.88 
 
 		 404 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  44.88 
 
 		 404 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  44.88 
 
 		 404 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  44.44 
 
 		 407 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1629  cysteine desulfurase IscS  46.07 
 
 		 408 aa  313  2.9999999999999996e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000331255  hitchhiker  0.0000285871 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  45.36 
 
 		 398 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01055  cysteine desulfurase  46.19 
 
 		 404 aa  312  5.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  45.12 
 
 		 406 aa  312  5.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2424  cysteine desulfurase  45.93 
 
 		 404 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2264  cysteine desulfurase  46.19 
 
 		 404 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>