More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0944 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0944  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  413  9.999999999999999e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.104305  normal  0.177983 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1206  GrpE protein  49.4 
 
 
180 aa  165  2.9999999999999998e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.390676  hitchhiker  0.00686163 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2350  GrpE protein  50.71 
 
 
185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1062  GrpE protein  43.6 
 
 
169 aa  150  8.999999999999999e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0506342  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0129  GrpE protein  43.54 
 
 
183 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628751  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  38.99 
 
 
222 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  37.09 
 
 
179 aa  107  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_002950  PG1775  grpE protein  37.41 
 
 
194 aa  105  3e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  32.95 
 
 
190 aa  104  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  36.6 
 
 
248 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  34.97 
 
 
195 aa  102  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  36.55 
 
 
204 aa  102  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5051  GrpE protein  37.95 
 
 
192 aa  102  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.845613  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6904  GrpE protein  38.1 
 
 
185 aa  102  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150675  normal  0.298497 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  34.93 
 
 
213 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0849  heat shock protein GrpE  38.15 
 
 
175 aa  100  1e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4181  GrpE protein  38.31 
 
 
286 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321411 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0774  heat shock protein GrpE  40.69 
 
 
176 aa  100  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.142311  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  36.07 
 
 
223 aa  99.8  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  35.42 
 
 
188 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  35.42 
 
 
188 aa  99.4  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  38.69 
 
 
191 aa  99.8  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  35.42 
 
 
188 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  35.42 
 
 
188 aa  99  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  35.42 
 
 
188 aa  99  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  35.42 
 
 
188 aa  99  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  35.42 
 
 
188 aa  99  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  35.42 
 
 
188 aa  99  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1259  heat shock protein GrpE  40.69 
 
 
176 aa  99  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.481119  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  33.94 
 
 
204 aa  98.6  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  39.44 
 
 
230 aa  98.2  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  39.44 
 
 
230 aa  98.2  8e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  36.11 
 
 
198 aa  97.8  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  35.48 
 
 
209 aa  97.8  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  31.15 
 
 
200 aa  97.8  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  33.51 
 
 
261 aa  97.1  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  34.72 
 
 
192 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  34.72 
 
 
192 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  37.5 
 
 
208 aa  97.8  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  33.51 
 
 
261 aa  97.1  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  37.5 
 
 
208 aa  97.8  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0454  GrpE protein  40.38 
 
 
186 aa  96.3  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3004  GrpE protein  38.6 
 
 
210 aa  97.1  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  38.16 
 
 
213 aa  97.1  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  39.73 
 
 
189 aa  97.1  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3208  GrpE protein  37.2 
 
 
204 aa  96.7  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718226  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0188  heat shock protein GrpE  36.31 
 
 
206 aa  96.3  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0002  GrpE protein  35.14 
 
 
206 aa  96.3  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.531723  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  36.84 
 
 
213 aa  95.9  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  38.41 
 
 
208 aa  96.3  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  39.44 
 
 
228 aa  96.3  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1520  GrpE protein  35.8 
 
 
206 aa  95.9  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0812159  normal  0.974035 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0016  GrpE protein  33.81 
 
 
174 aa  95.1  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0339785  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08251  GrpE protein (Hsp-70 cofactor)  40.3 
 
 
191 aa  95.1  5e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.643992  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  32.88 
 
 
208 aa  95.1  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  39.37 
 
 
195 aa  95.1  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0978  hypothetical protein  36.96 
 
 
205 aa  95.1  6e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.115351 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1473  GrpE protein  33.79 
 
 
190 aa  95.1  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00324826  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  34.39 
 
 
210 aa  95.1  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  33.09 
 
 
192 aa  94  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  36.92 
 
 
221 aa  94.4  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  36.88 
 
 
204 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0529  co-chaperone GrpE  33.87 
 
 
187 aa  93.6  2e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.914773  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  36.65 
 
 
194 aa  93.6  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  38.62 
 
 
225 aa  93.2  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1974  GrpE protein  31.46 
 
 
210 aa  93.6  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.26677  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  37.93 
 
 
172 aa  93.6  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00151  heat shock protein GrpE  34.93 
 
 
239 aa  92.4  4e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00526535  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  35.57 
 
 
210 aa  92.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  32.81 
 
 
210 aa  92  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  37.14 
 
 
210 aa  92  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  33.91 
 
 
189 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0936  heat shock protein GrpE  37.42 
 
 
169 aa  91.3  8e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0941203  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3465  protein GrpE  33.76 
 
 
197 aa  91.7  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  32.88 
 
 
247 aa  91.3  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  37.24 
 
 
172 aa  91.3  9e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0016  heat shock protein GrpE  34.25 
 
 
239 aa  90.5  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  31.28 
 
 
193 aa  90.9  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  34.52 
 
 
186 aa  90.5  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  37.23 
 
 
207 aa  90.9  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  31.25 
 
 
187 aa  90.9  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  34.67 
 
 
186 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1459  GrpE protein  32.7 
 
 
184 aa  90.9  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  34.64 
 
 
189 aa  90.5  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  33.91 
 
 
210 aa  90.5  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  37.24 
 
 
226 aa  89.7  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  34.52 
 
 
189 aa  90.1  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  41.35 
 
 
194 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0304  GrpE protein  37.14 
 
 
195 aa  90.5  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  37.31 
 
 
181 aa  90.1  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5482  heat shock protein GrpE  35.15 
 
 
189 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  34.67 
 
 
245 aa  90.5  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  36.03 
 
 
198 aa  89.7  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  34.38 
 
 
187 aa  89.7  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1120  co-chaperone GrpE  38.1 
 
 
194 aa  89.7  3e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0675757  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  37.93 
 
 
242 aa  89.4  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  31.46 
 
 
209 aa  89.4  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1359  GrpE protein  34.44 
 
 
186 aa  89.4  4e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000141941  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 
199 aa  89  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7788  putative heat shock protein (HSP-70 cofactor), grpE  34.59 
 
 
181 aa  89.4  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0272135  normal  0.30698 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>