More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4016 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4016  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
171 aa  344  3e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0056672 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2356  AsnC family transcriptional regulator  87.97 
 
 
157 aa  281  4e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0125137 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2151  AsnC family transcriptional regulator  78.95 
 
 
180 aa  278  3e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.132892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2105  AsnC family transcriptional regulator  78.95 
 
 
180 aa  278  3e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166182  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2088  AsnC family transcriptional regulator  78.36 
 
 
180 aa  275  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12792  Lrp/Asn family transcriptional regulator  75.44 
 
 
179 aa  263  8e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.580591 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2171  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  60.26 
 
 
157 aa  192  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  54.97 
 
 
169 aa  184  4e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4086  putative transcriptional regulator, AsnC family  56.1 
 
 
169 aa  178  3e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.934568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5540  transcriptional regulator, AsnC family  54.19 
 
 
203 aa  165  3e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2018  transcriptional regulator, AsnC family  55.63 
 
 
171 aa  160  7e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0609925  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0907  transcriptional regulator, AsnC family  54.05 
 
 
168 aa  150  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3154  AsnC/Lrp family regulatory protein  51.3 
 
 
159 aa  145  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140742  normal  0.198737 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19900  transcriptional regulator, AsnC family  46.62 
 
 
157 aa  140  6e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.578374  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3379  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 
159 aa  140  1e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2850  AsnC family transcriptional regulator  44.31 
 
 
167 aa  136  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.353617  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6556  transcriptional regulator, AsnC family  49.32 
 
 
158 aa  134  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.604564  normal  0.177628 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2562  transcriptional regulator, AsnC family  41.92 
 
 
167 aa  132  2e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.73379e-07 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3951  transcriptional regulator, AsnC family  41.61 
 
 
174 aa  129  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4274  transcriptional regulator, AsnC family  42.66 
 
 
153 aa  122  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365421  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3944  AsnC family transcriptional regulator  41.89 
 
 
168 aa  116  2e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.134648  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3819  AsnC family transcriptional regulator  36.55 
 
 
155 aa  115  2e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2159  transcriptional regulator, AsnC family  40.67 
 
 
157 aa  114  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.106753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4349  transcriptional regulator, AsnC family  40.82 
 
 
152 aa  114  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0499883  normal  0.877565 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0512  AsnC family transcriptional regulator  38.3 
 
 
165 aa  109  2e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4335  transcriptional regulator, AsnC family  37.32 
 
 
173 aa  108  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 
156 aa  108  4e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2542  transcriptional regulator, AsnC family  38.89 
 
 
155 aa  107  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.44011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8185  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.54 
 
 
165 aa  107  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  40.58 
 
 
166 aa  107  8e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  40.58 
 
 
166 aa  107  8e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 
152 aa  107  9e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  40.58 
 
 
166 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4327  transcriptional regulator, AsnC family  38.03 
 
 
154 aa  106  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  38.85 
 
 
164 aa  105  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
152 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
154 aa  104  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
152 aa  104  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
152 aa  104  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
152 aa  104  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  34.46 
 
 
154 aa  104  7e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
177 aa  103  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  31.08 
 
 
157 aa  103  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1963  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
160 aa  103  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  27.33 
 
 
157 aa  103  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37580  putative leucine-responsive regulatory protein  34.46 
 
 
158 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.777021  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3679  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 
152 aa  102  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 
166 aa  103  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  36.49 
 
 
152 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  35.76 
 
 
154 aa  102  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
156 aa  102  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  36.49 
 
 
152 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  36.49 
 
 
152 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  36.49 
 
 
152 aa  102  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  36.73 
 
 
164 aa  101  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 
155 aa  101  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 
154 aa  101  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3205  AsnC family transcriptional regulator  33.78 
 
 
158 aa  100  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1502  leucine-responsive regulatory protein  37.23 
 
 
156 aa  100  7e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  35.81 
 
 
152 aa  100  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1452  leucine-responsive regulatory protein  37.23 
 
 
156 aa  100  7e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2653  putative leucine-responsive regulatory protein  38.62 
 
 
166 aa  100  9e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1662  AsnC family transcriptional regulator  37.23 
 
 
156 aa  100  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.070464  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  39.13 
 
 
166 aa  100  9e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  40.3 
 
 
156 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  40.3 
 
 
156 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2886  AsnC family transcriptional regulator  37.16 
 
 
156 aa  100  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
156 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 
156 aa  99.8  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3542  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 
157 aa  99.4  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  6.09578e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  39.55 
 
 
156 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 
157 aa  99.4  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  32.67 
 
 
154 aa  98.6  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  38.81 
 
 
156 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  32.17 
 
 
175 aa  98.2  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 
152 aa  98.2  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  32.17 
 
 
175 aa  98.2  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  1.70709e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  32.17 
 
 
175 aa  98.2  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  32.17 
 
 
175 aa  98.2  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  2.32797e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  34.9 
 
 
166 aa  97.8  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  32.17 
 
 
229 aa  97.8  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  1.64018e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 
202 aa  97.4  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 
154 aa  97.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  33.77 
 
 
156 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 
175 aa  97.1  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 
202 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  1.30465e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
156 aa  97.1  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2822  AsnC family transcriptional regulator  34.19 
 
 
158 aa  95.9  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217238  normal  0.448359 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  32.67 
 
 
155 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0065  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 
155 aa  96.3  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0481565  normal  0.0654338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 
158 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 
159 aa  96.3  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  32.67 
 
 
155 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1249  AsnC family transcriptional regulator  35.81 
 
 
156 aa  96.3  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518927  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  31.72 
 
 
154 aa  95.9  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1513  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 
176 aa  96.3  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  34.29 
 
 
153 aa  96.3  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  38.14 
 
 
153 aa  95.5  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 
162 aa  95.5  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  34.69 
 
 
159 aa  95.5  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>