206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0221 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0221  permease YjgP/YjgQ  100 
 
 
361 aa  730    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3081  permease YjgP/YjgQ  46.42 
 
 
360 aa  330  2e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.770978  normal  0.0713723 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0581  hypothetical protein  43.97 
 
 
359 aa  295  8e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.201151  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2680  permease YjgP/YjgQ family protein  42.26 
 
 
372 aa  292  7e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2220  permease YjgP/YjgQ family protein  41.67 
 
 
372 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2416  hypothetical protein  41.96 
 
 
372 aa  286  5e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1234  permease YjgP/YjgQ family protein  39.38 
 
 
371 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132199  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0822  permease, putative  37.25 
 
 
365 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2226  permease YjgP/YjgQ family protein  38.94 
 
 
370 aa  278  9e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754034  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1014  hypothetical protein  36.41 
 
 
365 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.146018  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0671  permease, putative  36.41 
 
 
365 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1174  permease, putative  36.41 
 
 
365 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2340  hypothetical protein  36.41 
 
 
365 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2945  hypothetical protein  36.41 
 
 
365 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1021  hypothetical protein  36.41 
 
 
365 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1654  hypothetical protein  36.41 
 
 
365 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.398552  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0827  permease YjgP/YjgQ family protein  37.82 
 
 
364 aa  277  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.249961  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0622  permease YjgP/YjgQ family protein  40.51 
 
 
371 aa  276  5e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0271293  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2684  permease YjgP/YjgQ  39.03 
 
 
373 aa  275  7e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2786  permease YjgP/YjgQ family protein  43.09 
 
 
360 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2384  permease YjgP/YjgQ family protein  38.1 
 
 
363 aa  272  7e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3639  membrane protein, YjgP/YjgQ like  38.38 
 
 
365 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2808  permease YjgP/YjgQ  38 
 
 
372 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.94667  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0983  permease YjgP/YjgQ family protein  38.38 
 
 
365 aa  270  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5798  YjgP/YjgQ like transporter  37.25 
 
 
363 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.159259 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1856  permease YjgP/YjgQ  38.06 
 
 
364 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2472  permease YjgP/YjgQ family protein  38.06 
 
 
364 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2467  permease YjgP/YjgQ family protein  38.06 
 
 
364 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2516  permease YjgP/YjgQ family protein  39.2 
 
 
363 aa  262  8e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2407  permease YjgP/YjgQ  35.51 
 
 
376 aa  219  6e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.481022  normal  0.64368 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1910  permease YjgP/YjgQ  35.12 
 
 
381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2170  permease YjgP/YjgQ family protein  34.57 
 
 
373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.233438 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2729  permease YjgP/YjgQ family protein  36.2 
 
 
379 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2115  permease YjgP/YjgQ  36.5 
 
 
373 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2100  hypothetical protein  36.22 
 
 
339 aa  212  7e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0377846  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3538  permease YjgP/YjgQ family protein  34.04 
 
 
375 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0147965 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4923  permease YjgP/YjgQ family protein  33.53 
 
 
372 aa  195  9e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2596  permease YjgP/YjgQ family protein  33.33 
 
 
364 aa  194  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0445451 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1272  hypothetical protein  30.99 
 
 
375 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1943  putative transmembrane protein  34.66 
 
 
363 aa  192  6e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.729281  normal  0.0884093 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1092  permease YjgP/YjgQ  30.99 
 
 
375 aa  190  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14500  hypothetical protein  31.53 
 
 
372 aa  190  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1724  permease YjgP/YjgQ family protein  33.74 
 
 
363 aa  187  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0962  permease YjgP/YjgQ family protein  30.72 
 
 
367 aa  187  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1920  permease YjgP/YjgQ family protein  33.74 
 
 
363 aa  187  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.960962 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0559  permease YjgP/YjgQ family protein  34.12 
 
 
372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.298895  hitchhiker  0.00000418027 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2139  permease YjgP/YjgQ family protein  31.85 
 
 
367 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3163  permease YjgP/YjgQ family protein  31.08 
 
 
365 aa  181  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0990  permease YjgP/YjgQ  29.55 
 
 
373 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.171814  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1283  hypothetical protein  31.82 
 
 
372 aa  179  9e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002429  hypothetical protein  28.2 
 
 
366 aa  177  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000155201  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  31.09 
 
 
371 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03634  hypothetical protein  28.2 
 
 
366 aa  177  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0680  permease YjgP/YjgQ family protein  30.75 
 
 
372 aa  176  5e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.519951  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1019  permease YjgP/YjgQ family protein  31.16 
 
 
383 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4236  permease YjgP/YjgQ family protein  29.91 
 
 
371 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275706  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0987  permease YjgP/YjgQ family protein  30.21 
 
 
371 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480786  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3561  permease YjgP/YjgQ  30.59 
 
 
368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000903673  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  30.21 
 
 
369 aa  170  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0527  putative permease  29.94 
 
 
370 aa  169  8e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0167564  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1015  permease YjgP/YjgQ family protein  31.7 
 
 
370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000271858  normal  0.473888 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  30.21 
 
 
370 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0741  putative permease  29.74 
 
 
388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  30.41 
 
 
371 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2082  hypothetical protein  28.19 
 
 
366 aa  162  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000432404  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0925  permease YjgP/YjgQ family protein  30.9 
 
 
370 aa  160  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000914337  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3526  permease YjgP/YjgQ family protein  30.21 
 
 
372 aa  161  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.536872  normal  0.31629 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2114  permease YjgP/YjgQ family protein  31.39 
 
 
386 aa  160  4e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.774642 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  29.26 
 
 
370 aa  159  7e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  29.26 
 
 
370 aa  159  7e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  28.98 
 
 
370 aa  159  8e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2917  permease YjgP/YjgQ  29.91 
 
 
386 aa  159  9e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2683  hypothetical protein  29.05 
 
 
359 aa  158  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2555  hypothetical protein  29.83 
 
 
359 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  28.45 
 
 
370 aa  157  4e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000695544  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11670  permease YjgP/YjgQ family  29.82 
 
 
376 aa  156  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  29.62 
 
 
370 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000110304  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0445  permease YjgP/YjgQ family protein  26.63 
 
 
370 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1747  permease YjgP/YjgQ  29.44 
 
 
369 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2908  permease YjgP/YjgQ family protein  29.11 
 
 
370 aa  151  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000409785  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0396  permease YjgP/YjgQ family protein  28.74 
 
 
358 aa  151  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.167769  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01575  permease YjgP/YjgQ  28.69 
 
 
366 aa  150  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154727  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2826  permease YjgP/YjgQ family protein  29.97 
 
 
370 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00420336  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3005  permease YjgP/YjgQ family protein  29.97 
 
 
370 aa  150  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000818676  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0389  permease YjgP/YjgQ family protein  26.29 
 
 
371 aa  150  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00124488  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1369  hypothetical protein  29.97 
 
 
370 aa  149  6e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1179  permease YjgP/YjgQ family protein  29.55 
 
 
370 aa  149  6e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.301073  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1231  permease YjgP/YjgQ family protein  28.57 
 
 
371 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192979  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0872  permease YjgP/YjgQ  29.55 
 
 
370 aa  146  6e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000506114  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3678  permease YjgP/YjgQ family protein  27.54 
 
 
364 aa  145  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000432318  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3542  putative permease  27.54 
 
 
364 aa  145  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000328546  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4048  hypothetical protein  27.54 
 
 
364 aa  145  9e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000983322  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1373  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.1 
 
 
360 aa  144  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4008  permease YjgP/YjgQ family protein  32.31 
 
 
371 aa  143  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.618501 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0517  permease  29.31 
 
 
367 aa  137  2e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0300348  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3647  permease YjgP/YjgQ family protein  26.24 
 
 
366 aa  136  6.0000000000000005e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000993409  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2743  permease YjgP/YjgQ family protein  27.11 
 
 
367 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.731454  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1374  permease YjgP/YjgQ family protein  27.92 
 
 
363 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04091  hypothetical protein  25.07 
 
 
366 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000267736  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4834  putaitve permease  25.07 
 
 
366 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000998605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>