More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2373 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  100 
 
 
378 aa  776  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  38.13 
 
 
387 aa  228  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  37.02 
 
 
377 aa  216  4e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  2.23228e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  37.4 
 
 
379 aa  213  4e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  34.04 
 
 
379 aa  206  5e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  37.18 
 
 
411 aa  203  5e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1720  hypothetical protein  39.89 
 
 
401 aa  202  6e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0138813  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  36.61 
 
 
377 aa  201  2e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  37.29 
 
 
377 aa  195  9e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  35.77 
 
 
376 aa  194  2e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2203  hypothetical protein  37.22 
 
 
377 aa  192  8e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15030  cysteine desulfurase protein  36.12 
 
 
377 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  35.53 
 
 
381 aa  190  4e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  32.63 
 
 
387 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  37.46 
 
 
377 aa  181  3e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  31.22 
 
 
368 aa  169  6e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6148  aminotransferase class V  32.02 
 
 
416 aa  166  8e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.922128  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  27.96 
 
 
376 aa  165  1e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3782  aminotransferase class V  29.95 
 
 
384 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1250  aminotransferase class V  37.62 
 
 
372 aa  159  6e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  29.52 
 
 
381 aa  157  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1071  aminotransferase, class V  31.41 
 
 
382 aa  156  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  31.07 
 
 
367 aa  148  2e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  32.73 
 
 
374 aa  146  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  31.71 
 
 
393 aa  146  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  30.67 
 
 
393 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5290  aminotransferase class V  31.48 
 
 
380 aa  143  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00731204  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1308  aminotransferase class V  30.59 
 
 
382 aa  142  1e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  26.75 
 
 
393 aa  140  5e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4777  aminotransferase, class V  27.37 
 
 
391 aa  139  9e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  31.78 
 
 
380 aa  139  9e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  29.53 
 
 
407 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  27.02 
 
 
380 aa  136  8e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4490  aminotransferase class V  31.04 
 
 
389 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0650155 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.46 
 
 
412 aa  132  8e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.86 
 
 
885 aa  132  1e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2945  aminotransferase, class V  29.73 
 
 
381 aa  130  5e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119234  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  26.46 
 
 
392 aa  129  1e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  29.08 
 
 
403 aa  129  1e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4479  aminotransferase class V  31.17 
 
 
384 aa  128  2e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  29.28 
 
 
394 aa  128  2e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  30.14 
 
 
380 aa  127  4e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  29.43 
 
 
380 aa  126  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  28.8 
 
 
372 aa  126  7e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4498  aminotransferase class V  30.6 
 
 
384 aa  126  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2291  cysteine desulfurase family protein  29.43 
 
 
380 aa  126  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  29.53 
 
 
381 aa  125  9e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  27.39 
 
 
401 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  1.72014e-07 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4343  selenocysteine lyase  30.52 
 
 
384 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  26.87 
 
 
393 aa  124  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2304  aminotransferase class V  29.82 
 
 
379 aa  124  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00866664  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  29.58 
 
 
394 aa  122  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  26.26 
 
 
394 aa  122  1e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  26.98 
 
 
401 aa  122  1e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  27 
 
 
880 aa  122  1e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  29.86 
 
 
878 aa  120  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  26.85 
 
 
404 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  30 
 
 
387 aa  120  4e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4802  aminotransferase class V  29.59 
 
 
391 aa  120  5e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1973  aminotransferase class V  28.86 
 
 
388 aa  120  5e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  5.51025e-06  unclonable  4.45037e-08 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  26.42 
 
 
393 aa  120  5e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  28.13 
 
 
879 aa  118  2e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  28.57 
 
 
382 aa  117  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  27.63 
 
 
404 aa  117  3e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.82 
 
 
409 aa  117  4e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5187  class-V aminotransferase  28.83 
 
 
395 aa  117  4e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4543  aminotransferase class V  27.06 
 
 
391 aa  116  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1204  cysteine desulfurase family protein  28.61 
 
 
381 aa  116  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.515711 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  26.27 
 
 
429 aa  116  7e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  28.14 
 
 
896 aa  115  1e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  25.22 
 
 
408 aa  115  1e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  26 
 
 
394 aa  115  1e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.31 
 
 
421 aa  115  1e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  7.71215e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2495  cysteine desulfurase family protein  30.68 
 
 
385 aa  115  1e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123711  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  29.71 
 
 
400 aa  114  2e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.91 
 
 
433 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.97 
 
 
410 aa  114  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  27.44 
 
 
381 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  2.09414e-05 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  26.4 
 
 
393 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.01 
 
 
408 aa  113  4e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  31.06 
 
 
408 aa  113  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0084  aminotransferase, class V superfamily protein  25.29 
 
 
422 aa  113  6e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.153468  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.71 
 
 
406 aa  112  7e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2207  aminotransferase, class V  27.79 
 
 
381 aa  112  8e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02090  hypothetical protein  26.02 
 
 
380 aa  112  1e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.468544  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2736  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.25 
 
 
415 aa  112  1e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0250  cysteine desulfurase family protein  28.42 
 
 
387 aa  112  1e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0295  aminotransferase, class V  28.3 
 
 
373 aa  112  1e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.86273e-05 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2386  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.46 
 
 
426 aa  111  2e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168267  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  25.77 
 
 
392 aa  110  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  29.1 
 
 
414 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.3 
 
 
413 aa  110  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.3 
 
 
413 aa  110  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.75 
 
 
443 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  27.57 
 
 
406 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  7.37026e-08 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  26.41 
 
 
413 aa  110  5e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  32.04 
 
 
415 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  30.26 
 
 
417 aa  109  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3802  putative aminotransferase  27.7 
 
 
437 aa  109  7e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161541  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3040  aminotransferase, class V  29.5 
 
 
381 aa  109  7e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>