59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1073 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1073  fatty acid desaturase  100 
 
 
362 aa  734    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000383129  normal  0.912357 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2289  fatty acid desaturase  79.22 
 
 
359 aa  550  1e-155  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.345103  hitchhiker  0.00338003 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0342  fatty acid desaturase  42.35 
 
 
360 aa  296  5e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3401  fatty acid desaturase  42.4 
 
 
372 aa  292  7e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180374  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2886  fatty acid desaturase  45.7 
 
 
372 aa  290  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4904  fatty acid desaturase  41.14 
 
 
361 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0414  fatty acid desaturase  41.14 
 
 
361 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0351  fatty acid desaturase  42.65 
 
 
361 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0462  fatty acid desaturase  42.65 
 
 
361 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0346  fatty acid desaturase  40.6 
 
 
361 aa  281  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0400  fatty acid desaturase  42.65 
 
 
361 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0337  fatty acid desaturase  42.65 
 
 
361 aa  281  1e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000637477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0366  fatty acid desaturase  42.65 
 
 
361 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0466  fatty acid desaturase  42.65 
 
 
361 aa  281  1e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0334  fatty acid desaturase  42.36 
 
 
361 aa  280  3e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1829  fatty acid desaturase  33.13 
 
 
349 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.44967  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2215  fatty acid desaturase  35.84 
 
 
362 aa  183  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  29 
 
 
342 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2979  fatty acid desaturase  25.85 
 
 
366 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0222947  hitchhiker  0.00177715 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0898  Linoleoyl-CoA desaturase  26.07 
 
 
366 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  23.53 
 
 
352 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  23.46 
 
 
352 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1748  linoleoyl-CoA desaturase  25.26 
 
 
365 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07355  linoleoyl-CoA desaturase  26.77 
 
 
366 aa  55.5  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.163467  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3762  fatty acid desaturase  23.13 
 
 
356 aa  55.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761835  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1964  fatty acid desaturase  24.7 
 
 
374 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.171868  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1632  fatty acid desaturase  24.7 
 
 
374 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000412854  decreased coverage  0.00000000182174 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0032  fatty acid desaturase  37.36 
 
 
346 aa  54.3  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.925733  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48423  precursor of desaturase omega-6 desaturase  34.71 
 
 
495 aa  52.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0142  fatty acid desaturase  25.09 
 
 
351 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0617716 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2952  fatty acid desaturase  26.79 
 
 
361 aa  49.7  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15110  predicted protein  24.72 
 
 
498 aa  48.9  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.779867  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0028  fatty acid desaturase  34.67 
 
 
344 aa  48.9  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00913756  hitchhiker  0.0000248871 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46830  delta 5 fatty acid desaturase  23.33 
 
 
469 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243609  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3555  fatty acid desaturase  22.79 
 
 
352 aa  47.8  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.362287  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5677  Linoleoyl-CoA desaturase  23.21 
 
 
365 aa  47  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0897314  normal  0.221692 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1929  fatty acid desaturase  27.88 
 
 
320 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0147771  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3204  Linoleoyl-CoA desaturase  24.22 
 
 
360 aa  46.6  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  25.08 
 
 
349 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3380  Linoleoyl-CoA desaturase  23.85 
 
 
362 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2776  fatty acid desaturase family protein  34.33 
 
 
424 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.758903  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22459  delta 5 fatty acid desaturase  24.6 
 
 
455 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4881  fatty acid desaturase  26.05 
 
 
346 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2878  fatty acid desaturase  30.89 
 
 
286 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.435135  normal  0.310027 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1727  fatty acid desaturase family protein  34.33 
 
 
424 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2718  fatty acid desaturase family protein  34.33 
 
 
426 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2875  fatty acid desaturase domain-containing protein  34.33 
 
 
424 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.181755  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2837  fatty acid desaturase domain-containing protein  34.33 
 
 
410 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2415  fatty acid desaturase family protein  34.33 
 
 
424 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.240382  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  24.35 
 
 
360 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1784  fatty acid desaturase domain-containing protein  34.33 
 
 
454 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0650  fatty acid desaturase  22.48 
 
 
339 aa  43.9  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000871112  normal  0.375264 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3070  fatty acid desaturase  22.02 
 
 
357 aa  43.9  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115925  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5632  Linoleoyl-CoA desaturase  24.65 
 
 
371 aa  43.5  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.537677  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3596  putative fatty acid desaturase  34.25 
 
 
364 aa  43.5  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.843258  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2414  fatty acid desaturase  25.38 
 
 
321 aa  43.5  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5461  fatty acid desaturase  22.66 
 
 
376 aa  43.1  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  0.189601 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4211  Fatty acid desaturase  21.74 
 
 
350 aa  43.1  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1476  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  29.36 
 
 
391 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.265666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>