76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1978 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1978  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 274 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0530  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  53.58 
 
 		 273 aa  276  2e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1892  xylose isomerase domain-containing protein  50 
 
 		 275 aa  273  2.0000000000000002e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.230832 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3010  xylose isomerase-like TIM barrel  47.04 
 
 		 281 aa  256  4e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1279  hypothetical protein  41.39 
 
 		 280 aa  217  2e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.393575 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0270  xylose isomerase domain-containing protein  28.99 
 
 		 269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.757164  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0984  xylose isomerase domain-containing protein  28.99 
 
 		 269 aa  142  6e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.221697  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1494  xylose isomerase domain-containing protein  32.84 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.747131  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1644  xylose isomerase domain-containing protein  28.47 
 
 		 269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.960602 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  27.73 
 
 		 264 aa  72.4  0.000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  25.79 
 
 		 268 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  25.4 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  25.4 
 
 		 268 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0779  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.68 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4928  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.41 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  24.81 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3410  xylose isomerase domain-containing protein  29 
 
 		 272 aa  62  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.498178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3842  fructoselysine 3-epimerase  23.7 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17470  sugar phosphate isomerase/epimerase  28.63 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.105049  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9139  Sugar phosphate isomerase/epimerase-like protein  29.76 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4684  fructoselysine 3-epimerase  23.62 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3568  fructoselysine 3-epimerase  23.13 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3750  fructoselysine 3-epimerase  23.33 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238004  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0340  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.25 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03175  hypothetical protein  23.25 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03223  predicted isomerase  23.25 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.31 
 
 		 286 aa  55.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0394614 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5464  xylose isomerase domain-containing protein  24.61 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448037  normal  0.953141 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0531  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.41 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0473  xylose isomerase-like  25.9 
 
 		 308 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00570  sugar phosphate isomerase/epimerase  24.1 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0511  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.71 
 
 		 258 aa  53.9  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0659  xylose isomerase domain-containing protein  24.15 
 
 		 281 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.748247 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1512  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.24 
 
 		 263 aa  53.1  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0666  xylose isomerase-like TIM barrel  24.15 
 
 		 281 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2704  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.24 
 
 		 263 aa  53.1  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000134824 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0476  xylose isomerase domain-containing protein  27.13 
 
 		 262 aa  53.5  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0679  xylose isomerase domain-containing protein  24.15 
 
 		 281 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.419765 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0658  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.34 
 
 		 280 aa  52.4  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1364  hypothetical protein  25.76 
 
 		 256 aa  52.8  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000110599  hitchhiker  0.0000000254981 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0340  fructoselysine 3-epimerase  22.96 
 
 		 276 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.452792 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0835  xylose isomerase domain-containing protein  23.89 
 
 		 281 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.279878  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3128  hypothetical protein  25.81 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0247  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  29.27 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5002  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.03 
 
 		 312 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0821356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0077  xylose isomerase domain-containing protein  23.39 
 
 		 281 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6143  xylose isomerase domain-containing protein  26.69 
 
 		 288 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.536999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0474  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.69 
 
 		 256 aa  49.7  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3351  xylose isomerase domain-containing protein  24.71 
 
 		 278 aa  49.3  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8356  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.18 
 
 		 305 aa  48.9  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10507  hypothetical protein  24.92 
 
 		 280 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0480257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2709  hypothetical protein  26.41 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320407  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3029  xylose isomerase-like TIM barrel  25.95 
 
 		 265 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.599496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1458  xylose isomerase domain-containing protein  26.27 
 
 		 255 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  24.78 
 
 		 256 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0249  xylose isomerase domain-containing protein  26.61 
 
 		 265 aa  47.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.273491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1398  xylose isomerase-like TIM barrel  26.36 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.4 
 
 		 264 aa  47  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  31.61 
 
 		 253 aa  47.4  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1143  xylose isomerase domain-containing protein  28.3 
 
 		 243 aa  46.6  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4464  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.34 
 
 		 294 aa  46.2  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0516  hypothetical protein  26.89 
 
 		 263 aa  45.8  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0218037  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0185  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.88 
 
 		 284 aa  45.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1001  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.78 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0600  xylose isomerase domain-containing protein  31.97 
 
 		 244 aa  45.4  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1263  hypothetical protein  25.58 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6746  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.69 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249045  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2326  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.83 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00147679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3037  apurinic endonuclease Apn1  25.86 
 
 		 286 aa  43.9  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0174  xylose isomerase domain-containing protein  26.96 
 
 		 236 aa  43.5  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1123  endonuclease IV  23.28 
 
 		 296 aa  43.5  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.212537  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0407  xylose isomerase domain-containing protein  27.54 
 
 		 295 aa  42.7  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3944  AP endonuclease  24.28 
 
 		 285 aa  42.7  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0718494  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1814  apurinic endonuclease Apn1  17.84 
 
 		 287 aa  42.4  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.602458  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2906  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.42 
 
 		 291 aa  42.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4472  Hydroxypyruvate isomerase  24.14 
 
 		 250 aa  42.4  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0435966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>