More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3702 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3702  protease  100 
 
 
878 aa  1789    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204118  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2268  peptidase U32  51.14 
 
 
826 aa  892    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  34.02 
 
 
886 aa  433  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2086  peptidase U32  31.76 
 
 
839 aa  395  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  30.62 
 
 
836 aa  375  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  30.94 
 
 
810 aa  363  1e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1637  peptidase U32  30.06 
 
 
847 aa  356  8.999999999999999e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  32.17 
 
 
835 aa  347  6e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  32.11 
 
 
838 aa  341  4e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2391  peptidase U32  29.69 
 
 
848 aa  339  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.740262  normal  0.817298 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2136  U32 family peptidase  30.73 
 
 
783 aa  333  1e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1848  U32 family peptidase  30.73 
 
 
783 aa  330  5.0000000000000004e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0176  peptidase U32  29.7 
 
 
835 aa  325  2e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02320  collagenase-like protease  30.17 
 
 
828 aa  323  9.000000000000001e-87  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265597  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1712  peptidase U32  29.03 
 
 
862 aa  320  9e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000390003  normal  0.623925 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0229  peptidase U32  28.48 
 
 
872 aa  317  8e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.277324  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0587  peptidase U32  29.52 
 
 
840 aa  306  8.000000000000001e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.684095  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  29.2 
 
 
783 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  37.52 
 
 
783 aa  306  2.0000000000000002e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08360  collagenase-like protease  29.68 
 
 
825 aa  297  5e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.593453 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3761  peptidase U32  29.2 
 
 
835 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0962396  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0917  peptidase U32  28.86 
 
 
835 aa  294  4e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1336  peptidase U32  28.74 
 
 
817 aa  290  1e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0126233  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2966  peptidase U32  29.1 
 
 
877 aa  285  3.0000000000000004e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.484686  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0296  peptidase U32  28.57 
 
 
837 aa  284  4.0000000000000003e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1293  peptidase U32  29.4 
 
 
839 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.461857  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1622  proteinase  34.91 
 
 
823 aa  276  2.0000000000000002e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0350786 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0153  peptidase U32  29.72 
 
 
805 aa  272  2e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1459  peptidase U32  34.15 
 
 
723 aa  271  2.9999999999999997e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1732  peptidase U32  28.98 
 
 
873 aa  268  2e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0024  peptidase U32  28.87 
 
 
792 aa  267  5e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000675639  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3347  U32 family peptidase  35.33 
 
 
790 aa  266  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0064  collagenase-like protease  28.39 
 
 
790 aa  266  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2286  peptidase U32  32.41 
 
 
716 aa  266  1e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1028  peptidase U32  30.4 
 
 
834 aa  263  1e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3618  peptidase U32  28.02 
 
 
790 aa  262  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  33.27 
 
 
767 aa  262  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1337  peptidase U32  31.79 
 
 
736 aa  261  3e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3552  peptidase U32  28.19 
 
 
792 aa  261  3e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0065  peptidase U32  32.6 
 
 
822 aa  259  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0040  peptidase U32  27.73 
 
 
790 aa  258  4e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1237  putative peptidase U32 family protein  32.84 
 
 
851 aa  258  5e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1649  peptidase U32  27.1 
 
 
852 aa  257  7e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0370  peptidase U32  27.55 
 
 
818 aa  254  7e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0699  peptidase U32  31.78 
 
 
722 aa  251  4e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10034  predicted protein  32.62 
 
 
826 aa  249  1e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1572  peptidase U32  28.24 
 
 
832 aa  246  1.9999999999999999e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.812702  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1242  putative peptidase U32 family protein  31.9 
 
 
843 aa  239  2e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.648851 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0995  peptidase U32  28.03 
 
 
876 aa  229  2e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0703  peptidase U32  33.27 
 
 
841 aa  228  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1278  peptidase U32  33.15 
 
 
847 aa  228  5.0000000000000005e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.615717 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0664  peptidase U32  36.41 
 
 
696 aa  228  5.0000000000000005e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317421  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1655  peptidase U32  32.6 
 
 
833 aa  227  7e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296071  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2182  peptidase U32  27.58 
 
 
805 aa  226  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0246456  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  35.05 
 
 
411 aa  224  8e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  33.92 
 
 
430 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  36.01 
 
 
407 aa  221  5e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  39.01 
 
 
411 aa  218  5e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  36.75 
 
 
404 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  34.28 
 
 
420 aa  213  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  35.64 
 
 
419 aa  212  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2093  peptidase U32  32.4 
 
 
413 aa  212  2e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1499  peptidase U32  38.94 
 
 
405 aa  211  4e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  36.49 
 
 
406 aa  211  6e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2502  collagenase-like protein  36.75 
 
 
746 aa  210  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.503721  normal  0.268664 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0547  collagenase  31.21 
 
 
422 aa  210  1e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1925  peptidase U32  31.38 
 
 
414 aa  210  1e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.984732  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  37.54 
 
 
409 aa  209  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  34.54 
 
 
406 aa  208  5e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  37.22 
 
 
409 aa  207  7e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0753  protease  29.87 
 
 
635 aa  206  1e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  35.82 
 
 
439 aa  206  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2165  peptidase U32  35.81 
 
 
420 aa  205  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3270  peptidase U32  39.38 
 
 
413 aa  204  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000903684  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0474  collagenase family protease  38.82 
 
 
411 aa  204  4e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0294  collagenase  32.01 
 
 
420 aa  204  6e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022482 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0071  U32 family peptidase  35.71 
 
 
746 aa  204  8e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2127  peptidase U32  35.58 
 
 
415 aa  204  8e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00706152 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1301  peptidase U32  31.9 
 
 
748 aa  204  8e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.506544  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2495  peptidase U32  35.16 
 
 
413 aa  203  9.999999999999999e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04781  peptidase  37.83 
 
 
663 aa  202  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1526  peptidase U32  35.05 
 
 
412 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31073e-27 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1685  peptidase U32  32.23 
 
 
403 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  38.05 
 
 
439 aa  202  3e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1084  collagenase  38.81 
 
 
548 aa  202  3e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.795762  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  37.1 
 
 
403 aa  202  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001056  peptidase U32  37.91 
 
 
663 aa  200  9e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2291  peptidase U32  36.59 
 
 
426 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3754  peptidase U32  37.75 
 
 
747 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1718  peptidase, U32 family  28.91 
 
 
654 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.378979  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0991  peptidase U32  32.5 
 
 
427 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  34.16 
 
 
404 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1782  peptidase, U32 family  28.73 
 
 
654 aa  199  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1557  peptidase, U32 family  28.73 
 
 
654 aa  199  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01393  predicted peptidase  29.04 
 
 
653 aa  197  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1519  U32 family peptidase  29.04 
 
 
667 aa  197  8.000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1738  peptidase, U32 family  28.55 
 
 
654 aa  197  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2224  peptidase U32  29.04 
 
 
667 aa  197  8.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.787396 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01403  hypothetical protein  29.04 
 
 
653 aa  197  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1614  U32 family peptidase  29.04 
 
 
667 aa  197  8.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>