More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2515 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2515  ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 278 aa  545  1e-154  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0427  ABC-2 type transporter  66.55 
 
 		 278 aa  379  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.469533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0242  ABC-2 type transporter  62.23 
 
 		 278 aa  362  3e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0685  ABC transporter, permease protein  55.68 
 
 		 277 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.537478  normal  0.14182 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2794  hypothetical protein  47.17 
 
 		 276 aa  256  4e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  31.25 
 
 		 260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  32.14 
 
 		 255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  35.87 
 
 		 249 aa  124  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  32.37 
 
 		 242 aa  123  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  29.25 
 
 		 289 aa  122  5e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31 
 
 		 249 aa  122  7e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  34.02 
 
 		 290 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.99 
 
 		 254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  34.96 
 
 		 241 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  32.02 
 
 		 251 aa  118  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  37.14 
 
 		 261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  33.33 
 
 		 261 aa  115  6e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.63 
 
 		 249 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  29.86 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  32.19 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  32.19 
 
 		 256 aa  112  5e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.67 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  31.82 
 
 		 250 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  30.63 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  29.52 
 
 		 256 aa  110  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  33.47 
 
 		 249 aa  110  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.3 
 
 		 253 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  29.82 
 
 		 251 aa  109  6e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.3 
 
 		 253 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0176  hypothetical protein  31.72 
 
 		 241 aa  106  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67071  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  29.26 
 
 		 255 aa  106  4e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  36.04 
 
 		 288 aa  105  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.79 
 
 		 253 aa  105  8e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  33.48 
 
 		 252 aa  105  8e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  33.18 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  33.18 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  30.84 
 
 		 254 aa  99.8  5e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.21 
 
 		 249 aa  99.4  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0287  hypothetical protein  31.7 
 
 		 241 aa  99  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.301015  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  32.46 
 
 		 256 aa  98.6  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  27.17 
 
 		 270 aa  97.1  3e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  30.47 
 
 		 254 aa  96.3  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  32.13 
 
 		 284 aa  96.3  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  31.44 
 
 		 281 aa  95.9  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  29.05 
 
 		 257 aa  95.5  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 		 253 aa  92  9e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  28.84 
 
 		 256 aa  89.7  5e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0251  ABC-2 type transporter  29.77 
 
 		 255 aa  89.4  7e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.452318 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  29.73 
 
 		 289 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3931  ABC-2 type transporter  32.23 
 
 		 263 aa  87.8  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1034  ABC-2 type transporter  30.73 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.150436 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0030  ABC-2 type transporter  31.8 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2013  ABC-2 type transporter  30.28 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000119274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1789  ABC-2 type transporter  29.31 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2613  ABC-2 type transporter  27.95 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.937981  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0010  ABC-2 type transporter  31.03 
 
 		 280 aa  81.6  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  25.63 
 
 		 286 aa  80.1  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05121  putative multidrug efflux ABC transporter  29.68 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5948  ABC transporter permease  30.08 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0673459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1245  ABC-2 type transporter  30.38 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0464218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0249  hypothetical protein  30.08 
 
 		 281 aa  79  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2587  ABC multidrug efflux transporter, inner membrane subunit  30.38 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0449  putative multidrug efflux ABC transporter  29.68 
 
 		 274 aa  78.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.603097  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1936  ABC-2 type transporter  29.91 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1796  ABC-2 type transporter  28.7 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000116393 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0192  hypothetical protein  29.06 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3861  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.92497  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1079  ABC-2 type transporter  27.47 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05051  putative multidrug efflux ABC transporter  29.68 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.507008  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2845  ABC-2 type transporter  28.39 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  28.18 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5008  ABC-2 type transporter  29.79 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0701746  normal  0.113041 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04741  putative multidrug efflux ABC transporter  29.22 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3328  ABC-2 type transporter  27.85 
 
 		 281 aa  75.9  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.334159 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5312  ABC-2 type transporter  29.82 
 
 		 292 aa  75.5  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.91396  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2499  ABC-2 transporter component  28.9 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3136  ABC-2 type transporter  31.08 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1750  putative multidrug efflux ABC transporter  29.75 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0190039  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4873  ABC-2 type transporter  29.17 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0010  ABC-2 type transporter  28.33 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0265688  normal  0.974707 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2893  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04481  putative multidrug efflux ABC transporter  29.08 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.86864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  27.41 
 
 		 285 aa  72.8  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2221  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  29.46 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000454003  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  27.63 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1281  ABC transporter, permease protein  28.03 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.640698  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0091  ABC transporter  28.12 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13223 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2667  ABC transporter  31.08 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0137793  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1894  putative daunorubicin resistance ABC transporter, permease protein  27.84 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  26.7 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1861  ABC-2 type transporter  26.56 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  25.44 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 		 266 aa  72  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  28.03 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3096  ABC-2 type transporter  30.63 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  23.62 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.307058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  25.57 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1125  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.24 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.742933  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0215  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716105  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0025  ABC-2 type transporter  27.93 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.792877 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>