108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1983 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1983  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  611  9.999999999999999e-175  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0207  hypothetical protein  53.9 
 
 		 287 aa  294  1e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0206  hypothetical protein  30.18 
 
 		 268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0297191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1982  hypothetical protein  28.36 
 
 		 268 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  31.58 
 
 		 274 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1090  methyltransferase  33.48 
 
 		 283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000294134  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0245  ribosomal RNA adenine dimethylase  35.38 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14559  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1469  methyltransferase type 11  32.72 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000470965  normal  0.0590447 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2016  methyltransferase  31.78 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1471  methyltransferase type 11  25.89 
 
 		 279 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0487894  normal  0.185117 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  25.45 
 
 		 292 aa  99.8  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2033  methyltransferase  31.44 
 
 		 302 aa  96.7  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.931745  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0327  putative SAM-dependent methyltransferase  26.67 
 
 		 323 aa  94  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0058  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 287 aa  92  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1317  ribosomal RNA adenine dimethylase  26.04 
 
 		 279 aa  90.9  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222413  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0369  methyltransferase type 12  30.95 
 
 		 254 aa  90.5  3e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.151072  normal  0.249023 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0046  methyltransferase type 12  24.04 
 
 		 283 aa  88.6  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.165361  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1916  putative SAM-dependent methyltransferase  29 
 
 		 299 aa  87.4  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0005  Methyltransferase type 11  30.69 
 
 		 293 aa  87.4  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0234268 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0235  methyltransferase type 12  30 
 
 		 254 aa  86.3  5e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1924  methyltransferase type 12  28.44 
 
 		 291 aa  85.5  8e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.302412  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  29.64 
 
 		 288 aa  85.9  8e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0122  SAM-binding motif-containing protein  24.38 
 
 		 286 aa  82.8  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1781  SAM (and some other nucleotide) binding motif  26.6 
 
 		 286 aa  82.4  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183763  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1216  hypothetical protein  22.41 
 
 		 286 aa  82.4  0.000000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.43284  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2737  methyltransferase  25.55 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000116085  decreased coverage  0.0000479797 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1672  hypothetical protein  28.57 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.51834  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3103  methyltransferase type 11  27.51 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1588  Methyltransferase type 12  28.29 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0308513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2275  methyltransferase type 12  23.19 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0429  methyltransferase type 12  22.49 
 
 		 275 aa  75.1  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1320  putative methyltransferase  26.77 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2360  methyltransferase type 12  34 
 
 		 319 aa  72.4  0.000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.328542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1288  serine protease  22.48 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00462648  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2002  hypothetical protein  26.14 
 
 		 289 aa  72  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.419802 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1510  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  20.68 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  25.09 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1590  Methyltransferase type 11  36.46 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0369722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3701  methyltransferase type 12  25.44 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0150  methyltransferase  22.55 
 
 		 269 aa  67  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.520005  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1481  hypothetical protein  23.91 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  26.05 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2361  methyltransferase type 12  30.07 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0091  hypothetical protein  30 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0346514  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2505  Methyltransferase type 11  24.31 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618552  normal  0.420988 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  27.06 
 
 		 270 aa  62  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1722  hypothetical protein  23.66 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0040  hypothetical protein  27.21 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.25968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0812  hypothetical protein  21.01 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09260  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  22.16 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.505356  normal  0.0667798 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26420  hypothetical protein  26.58 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0492105  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  24.74 
 
 		 284 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  23.96 
 
 		 275 aa  54.3  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0281  hypothetical protein  22.84 
 
 		 263 aa  55.1  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1447  hypothetical protein  26.53 
 
 		 280 aa  53.9  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.814616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1285  methyltransferase type 12  21.38 
 
 		 273 aa  53.9  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1495  hypothetical protein  21.38 
 
 		 273 aa  53.5  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000420591  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0885  methyltransferase, putative  28.45 
 
 		 214 aa  52.8  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.784579  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1037  methyltransferase type 12  29.09 
 
 		 256 aa  52.4  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1045  hypothetical protein  21.51 
 
 		 277 aa  52.4  0.000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01690  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  19.5 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.160618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0326  hypothetical protein  32.69 
 
 		 276 aa  51.6  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2590  methyltransferase type 11  26.59 
 
 		 260 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04480  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.65 
 
 		 263 aa  50.1  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.110079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  23.67 
 
 		 250 aa  49.3  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0720  hypothetical protein  31.91 
 
 		 234 aa  49.3  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1008  hypothetical protein  25.31 
 
 		 270 aa  49.3  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.823192 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1950  putative methyltransferase  20.24 
 
 		 270 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3030  methyltransferase type 12  23.05 
 
 		 274 aa  48.9  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3852  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.36 
 
 		 212 aa  47.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1127  methyltransferase type 12  20.93 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287777  hitchhiker  0.00000151267 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0543  Methyltransferase type 11  25.41 
 
 		 247 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1749  methyltransferase type 12  26.11 
 
 		 215 aa  47.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.110719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1271  hypothetical protein  22.93 
 
 		 277 aa  47  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000529075  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2658  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 121 aa  46.6  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.774781  normal  0.0322757 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0260  Methyltransferase type 11  27 
 
 		 267 aa  46.2  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00488037  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0758  Methyltransferase type 11  40.38 
 
 		 189 aa  45.8  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00287175  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0992  Methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 255 aa  45.8  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.358942  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4141  putative methyltransferase  36.73 
 
 		 273 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.34511  normal  0.0273084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0064  Methyltransferase type 11  25.95 
 
 		 247 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  22.33 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  25.98 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1594  methyltransferase type 11  28.93 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0599  methyltransferase domain-containing protein  22.86 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.57053  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0204  Methyltransferase type 12  28.72 
 
 		 203 aa  44.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2399  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 210 aa  44.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.521103  normal  0.920683 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3506  methyltransferase type 11  24.32 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1235  RNA methyltransferase, TrmA family  31.94 
 
 		 462 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0817  methyltransferase  34.62 
 
 		 253 aa  43.9  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2323  hypothetical protein  27.54 
 
 		 252 aa  43.5  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.569628  normal  0.0283599 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0250  hypothetical protein  22.69 
 
 		 273 aa  43.5  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  29.07 
 
 		 284 aa  43.5  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0578  methyltransferase, putative  31.65 
 
 		 249 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0960  methyltransferase  26.25 
 
 		 261 aa  43.5  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  24.35 
 
 		 275 aa  43.5  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0617  methyltransferase type 11  31.65 
 
 		 249 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0514794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0514  methyltransferase domain-containing protein  23.64 
 
 		 242 aa  43.1  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2810  methyltransferase type 12  24.14 
 
 		 207 aa  43.1  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1480  RNA methyltransferase, TrmA family  36.54 
 
 		 442 aa  42.7  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2029  Methyltransferase type 12  23.53 
 
 		 215 aa  42.7  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>