More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1508 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1508  hypothetical protein  100 
 
 
226 aa  467  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1864  hypothetical protein  51.64 
 
 
221 aa  238  5.999999999999999e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  34.58 
 
 
207 aa  102  6e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1779  Methyltransferase type 11  35.39 
 
 
212 aa  95.1  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1407  hypothetical protein  38.75 
 
 
191 aa  91.3  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.709337  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0487  methyltransferase type 11  34.08 
 
 
215 aa  89.4  5e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1437  methyltransferase type 11  35.96 
 
 
210 aa  82  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00131296  decreased coverage  0.0000500722 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0843  methyltransferase type 11  28.64 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.783173  normal  0.455137 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1459  Methyltransferase type 11  28.81 
 
 
250 aa  73.6  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0579  methyltransferase type 11  34.78 
 
 
339 aa  68.6  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  31.33 
 
 
233 aa  63.2  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  35.19 
 
 
244 aa  62.4  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  25.86 
 
 
221 aa  61.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  28.48 
 
 
236 aa  60.5  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  28.48 
 
 
236 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  28.48 
 
 
222 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  28.48 
 
 
236 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  28.48 
 
 
236 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  28.48 
 
 
236 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0424  methyltransferase type 11  28.21 
 
 
223 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.111322  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  28.48 
 
 
236 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2617  Methyltransferase type 11  31.72 
 
 
228 aa  59.7  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0592  methyltransferase type 11  25.45 
 
 
221 aa  59.3  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.499783  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.64 
 
 
215 aa  58.9  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  32.43 
 
 
251 aa  58.9  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0956  methyltransferase type 11  30.71 
 
 
487 aa  58.9  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  25.75 
 
 
220 aa  58.5  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  33.96 
 
 
238 aa  57.8  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  27.88 
 
 
236 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0178  methyltransferase type 11  24.88 
 
 
265 aa  57.8  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  31.93 
 
 
267 aa  57.8  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  30.98 
 
 
276 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  26.06 
 
 
236 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1612  Methyltransferase type 11  32.26 
 
 
233 aa  57  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4739  Methyltransferase type 11  28.72 
 
 
218 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0105  methyltransferase type 11  33.85 
 
 
247 aa  57.4  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.81 
 
 
258 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  31.93 
 
 
267 aa  57  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  32.32 
 
 
235 aa  57  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  32.14 
 
 
202 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
225 aa  55.8  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  32.14 
 
 
259 aa  55.5  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0673  methyltransferase type 11  38.61 
 
 
253 aa  55.5  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0777  methyltransferase type 11  29.9 
 
 
236 aa  55.1  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.621905  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  31.93 
 
 
319 aa  54.3  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0058  Methyltransferase type 11  35.4 
 
 
354 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  31.06 
 
 
240 aa  53.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  29.46 
 
 
244 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6235  Methyltransferase type 11  27.23 
 
 
206 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.785086  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  29.57 
 
 
241 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2258  methyltransferase type 12  25.41 
 
 
213 aa  53.5  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0351185 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1744  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
208 aa  53.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.370117 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.91 
 
 
224 aa  53.1  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0046  methyltransferase type 11  32.63 
 
 
236 aa  53.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.260962  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  29.63 
 
 
276 aa  52.8  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2233  Methyltransferase type 11  37.23 
 
 
204 aa  52.8  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.569046  hitchhiker  0.00169364 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1625  methyltransferase type 12  25.81 
 
 
229 aa  52.8  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  31.2 
 
 
281 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1141  methyltransferase type 11  31.58 
 
 
236 aa  52.4  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3215  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  30.25 
 
 
320 aa  52.8  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.409549  normal  0.479491 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  29.5 
 
 
261 aa  52.4  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0962  methyltransferase type 11  25.48 
 
 
242 aa  52  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
337 aa  52  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.36 
 
 
258 aa  52  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4088  Methyltransferase type 11  35.14 
 
 
244 aa  51.6  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2191  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
226 aa  51.6  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4520  methyltransferase domain protein  27.95 
 
 
783 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  29.57 
 
 
244 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2359  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.13 
 
 
237 aa  51.6  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4086  methyltransferase type 11  32.67 
 
 
249 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315577  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  30.39 
 
 
210 aa  51.6  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2437  hypothetical protein  26.06 
 
 
236 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000255199  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  27.32 
 
 
267 aa  51.2  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  38.83 
 
 
257 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0994  methyltransferase type 11  25.35 
 
 
204 aa  50.4  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.430888 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0198  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.89 
 
 
251 aa  50.4  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.25 
 
 
230 aa  50.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  32.74 
 
 
239 aa  50.4  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  32.81 
 
 
274 aa  50.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16301  methyltransferase  30.1 
 
 
357 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.346442 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0198  methyltransferase type 11  34.91 
 
 
217 aa  50.1  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0695927  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.78 
 
 
277 aa  50.1  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.466565  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3102  methyltransferase type 11  24.62 
 
 
292 aa  50.1  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  32.08 
 
 
215 aa  49.7  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3033  methyltransferase type 11  29.06 
 
 
304 aa  49.7  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3984  methyltransferase type 11  29.52 
 
 
245 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.237178  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  27.83 
 
 
239 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  31.9 
 
 
242 aa  49.7  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  38.1 
 
 
710 aa  49.3  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0639  Methyltransferase type 11  25.29 
 
 
307 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2210  methyltransferase type 11  26.88 
 
 
203 aa  49.3  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0118  methyltransferase type 12  23.7 
 
 
273 aa  48.9  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  31.73 
 
 
232 aa  48.9  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  29 
 
 
219 aa  48.9  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 
196 aa  48.5  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16281  SAM-binding motif-containing protein  29.46 
 
 
309 aa  48.9  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3809  SAM binding protein  28.33 
 
 
219 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.914048  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  29.82 
 
 
278 aa  48.5  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1989  methyltransferase type 11  25.77 
 
 
218 aa  48.5  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512707  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  36.54 
 
 
341 aa  48.5  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>