More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0050 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  100 
 
 
360 aa  733    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3748  glycosyl transferase  65.63 
 
 
358 aa  489  1e-137  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.985214  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2023  glycosyl transferase, group 1  42.51 
 
 
401 aa  223  4e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.334553  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  40.34 
 
 
394 aa  211  1e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  38.85 
 
 
395 aa  211  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  40.07 
 
 
396 aa  206  4e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  36.21 
 
 
386 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1746  glycosyl transferase, group 1  35.43 
 
 
421 aa  194  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  32.04 
 
 
386 aa  178  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  35.51 
 
 
401 aa  133  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1306  glycosyl transferase group 1  30.85 
 
 
403 aa  122  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  32.05 
 
 
360 aa  120  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0309  glycosyl transferase group 1  30.52 
 
 
396 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  32.84 
 
 
426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  23.12 
 
 
377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0579  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 
398 aa  113  5e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1354  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.1 
 
 
382 aa  113  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 
390 aa  112  8.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3112  group 1 glycosyl transferase  32.51 
 
 
390 aa  112  9e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1181  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 
395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192716  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.5 
 
 
419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 
399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  31.37 
 
 
380 aa  110  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3572  glycosyl transferase, group 1  30.92 
 
 
389 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  normal  0.0128829 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  25.16 
 
 
409 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  23.45 
 
 
348 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  26.01 
 
 
391 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  29.77 
 
 
414 aa  107  4e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 
382 aa  106  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0285  glycosyl transferase group 1  30.42 
 
 
389 aa  106  6e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1151  glycosyl transferase group 1  29 
 
 
395 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  25.65 
 
 
413 aa  106  7e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 
417 aa  106  7e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  29.28 
 
 
416 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0569  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 
394 aa  105  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 
371 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  22.28 
 
 
437 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  28.86 
 
 
394 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  24.5 
 
 
396 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3880  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 
455 aa  104  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  22.28 
 
 
437 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  32.22 
 
 
377 aa  105  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  33.91 
 
 
405 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  33.91 
 
 
405 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
385 aa  103  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  23.77 
 
 
386 aa  103  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  24.73 
 
 
372 aa  102  7e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  28.41 
 
 
383 aa  102  8e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  28.52 
 
 
383 aa  102  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 
355 aa  102  9e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4910  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 
388 aa  102  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.314758  hitchhiker  0.000347122 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  27.39 
 
 
394 aa  102  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 
390 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  26.17 
 
 
404 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 
388 aa  102  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 
398 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  27.79 
 
 
388 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0028  LPS glycosyltransferase  39.26 
 
 
373 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  hitchhiker  0.00835571 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  23.02 
 
 
439 aa  101  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1401  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 
426 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 
379 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  28.01 
 
 
375 aa  100  3e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 
380 aa  100  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 
435 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4016  glycosyl transferase, group 1  27.69 
 
 
378 aa  100  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  27 
 
 
407 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0506  glycosyl transferase, group 1  22.88 
 
 
425 aa  100  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1456  glycosyl transferase, group 1  27.71 
 
 
409 aa  99.8  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3829  glycosyl transferase, group 1  28.77 
 
 
388 aa  99.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00562518  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3695  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 
388 aa  99.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166947  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4534  glycosyl transferase, group 1  28.77 
 
 
388 aa  99.4  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429646  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02589  Glycosyltransferase  28 
 
 
403 aa  99  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.147496  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  26.22 
 
 
446 aa  99  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1581  glycosyl transferase, group 1  25.67 
 
 
359 aa  99  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 
355 aa  99  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  33.02 
 
 
384 aa  98.6  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  29.13 
 
 
373 aa  98.6  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  29.83 
 
 
351 aa  98.6  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  31.82 
 
 
415 aa  97.8  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  32.8 
 
 
377 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  27.66 
 
 
374 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  33.12 
 
 
360 aa  98.6  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0307  glycosyl transferase, group 1  28.98 
 
 
396 aa  97.8  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.813373  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  31.98 
 
 
374 aa  97.8  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3732  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 
388 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.775732  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
364 aa  97.4  3e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5555  glycosyl transferase, group 1  26.53 
 
 
388 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  26.37 
 
 
439 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  31.31 
 
 
425 aa  97.4  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 
381 aa  97.1  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  24.04 
 
 
410 aa  97.1  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  25.53 
 
 
382 aa  96.7  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0840  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
398 aa  96.7  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.755568 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0207  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 
398 aa  96.3  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.41 
 
 
366 aa  96.3  7e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  24.52 
 
 
419 aa  96.3  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0552  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  24.02 
 
 
388 aa  96.3  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.284297  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0144  glycosyltransferase-like protein  27.16 
 
 
368 aa  96.3  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  24.62 
 
 
415 aa  96.3  8e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  24.55 
 
 
389 aa  95.5  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>