More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2899 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2899  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  100 
 
 
228 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1209  response regulator  52.73 
 
 
228 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000538312  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1864  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  51.8 
 
 
230 aa  227  1e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.134891  normal  0.12527 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2186  HTH-type transcriptional regulator, two-component response regulator  50.22 
 
 
224 aa  226  3e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3992  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  51.53 
 
 
231 aa  225  5.0000000000000005e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000025564  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2788  response regulator receiver and unknown domain protein  50.43 
 
 
230 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003320  transcriptional regulatory protein CitB  49.55 
 
 
228 aa  219  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2442  response regulator receiver and unknown domain protein  53.6 
 
 
227 aa  219  3e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02430  response regulator  47.98 
 
 
228 aa  218  7.999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0930  response regulator receiver  45.5 
 
 
226 aa  192  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0905  response regulator receiver  45.25 
 
 
226 aa  190  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3095  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  45.25 
 
 
226 aa  191  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0654926  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0939  response regulator receiver  45.25 
 
 
226 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0896662 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3431  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  45.29 
 
 
226 aa  188  8e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0471  response regulator  44.25 
 
 
230 aa  187  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0616  response regulator  44.69 
 
 
230 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0689  response regulator  44.69 
 
 
230 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0877  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  44.8 
 
 
226 aa  185  5e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0473  response regulator receiver  43.05 
 
 
230 aa  185  7e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0621  DNA-binding response regulator  43.81 
 
 
230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0596  response regulator  42.67 
 
 
230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4743  response regulator  41.85 
 
 
230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1376  response regulator receiver and unknown domain protein  42.73 
 
 
226 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0514  response regulator receiver and unknown domain protein  42.22 
 
 
227 aa  178  7e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0317  transcriptional regulator CitB  41.3 
 
 
230 aa  177  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0835  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  43.42 
 
 
233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.256612  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0354  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  45.09 
 
 
217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.435973 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3002  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  42.92 
 
 
221 aa  164  8e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4345  response regulator  40.09 
 
 
225 aa  162  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158783  hitchhiker  0.00000000000467704 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00590  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with citA  39.19 
 
 
226 aa  160  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3005  response regulator receiver and unknown domain protein  39.19 
 
 
226 aa  160  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3024  two-component response regulator DpiA  39.19 
 
 
226 aa  160  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.284092  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00579  hypothetical protein  39.19 
 
 
226 aa  160  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0838  response regulator  39.19 
 
 
225 aa  160  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.873813  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0639  two-component response regulator DpiA  39.19 
 
 
226 aa  160  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0671  two-component response regulator DpiA  39.19 
 
 
226 aa  160  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00334128  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0643  two-component response regulator DpiA  39.19 
 
 
226 aa  160  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0236338  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0708  two-component response regulator DpiA  39.19 
 
 
226 aa  160  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.767771  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0535  two-component response regulator DpiA  39.19 
 
 
226 aa  160  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1090  response regulator  39.64 
 
 
225 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1005  response regulator  39.64 
 
 
225 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.38637e-62 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3504  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  42.99 
 
 
221 aa  159  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0894605 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3172  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  39.82 
 
 
228 aa  159  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00871756  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0812  response regulator receiver  39.19 
 
 
225 aa  159  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4644  response regulator receiver and unknown domain protein  38.6 
 
 
231 aa  159  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210142  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0870  response regulator  39.19 
 
 
225 aa  158  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0924  response regulator  39.19 
 
 
225 aa  158  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0966  response regulator  40.09 
 
 
225 aa  158  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1010  response regulator  38.74 
 
 
225 aa  158  7e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0501  two-component response regulator  37.61 
 
 
222 aa  156  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0056  transcriptional regulator CitB  38.22 
 
 
228 aa  155  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.993904  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0058  transcriptional regulatory protein CitB  38.22 
 
 
228 aa  155  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.440261  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0059  transcriptional regulatory protein CitB  38.22 
 
 
228 aa  155  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0057  transcriptional regulator CitB  38.22 
 
 
228 aa  154  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.743375  normal  0.317361 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0512  two-component response regulator  36.73 
 
 
222 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0057  transcriptional regulator CitB  37.78 
 
 
228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.651756 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0497  response regulator receiver  34.7 
 
 
235 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0615  response regulator  36.07 
 
 
235 aa  151  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1397  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  40.53 
 
 
228 aa  151  7e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.362742  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0598  response regulator receiver and unknown domain protein  41.67 
 
 
223 aa  151  8.999999999999999e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00972259 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0785  two-component response regulator DpiA  38.57 
 
 
226 aa  151  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124053  normal  0.689385 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0667  two-component response regulator DpiA  38.57 
 
 
226 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.182273  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1958  DNA-binding transcriptional activator DcuR  38.16 
 
 
237 aa  150  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0209132 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3239  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  41.7 
 
 
220 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0681  two-component response regulator DpiA  38.57 
 
 
226 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3301  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  41.7 
 
 
220 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0147948 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0741  two-component response regulator DpiA  38.57 
 
 
226 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.21792  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4724  response regulator  35.16 
 
 
235 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.240866  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3250  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  41.26 
 
 
220 aa  149  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237703  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0546  response regulator  35.16 
 
 
235 aa  148  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000213708  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0488  response regulator  35.16 
 
 
235 aa  149  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0633  response regulator  35.16 
 
 
235 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2020  response regulator receiver and unknown domain protein  37.61 
 
 
233 aa  148  8e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.105388  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0490  response regulator  35.16 
 
 
235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00461557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0640  response regulator  34.25 
 
 
235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2556  DNA-binding transcriptional activator DcuR  36.96 
 
 
239 aa  146  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2225  response regulator receiver and unknown domain protein  38.91 
 
 
241 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.381743  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3732  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  34.82 
 
 
229 aa  145  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.655402 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4101  DNA-binding transcriptional activator DcuR  36.56 
 
 
240 aa  145  6e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0039  DNA-binding transcriptional activator DcuR  36.12 
 
 
240 aa  144  9e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0045  DNA-binding transcriptional activator DcuR  36.12 
 
 
240 aa  144  9e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1748  response regulator receiver and unknown domain protein  37.39 
 
 
233 aa  144  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.013924  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1239  response regulator receiver and unknown domain protein  38.7 
 
 
225 aa  143  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0291668  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4310  response regulator receiver and unknown domain protein  36.2 
 
 
241 aa  142  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000453171  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5599  response regulator receiver and unknown domain protein  34.63 
 
 
243 aa  141  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0782544  normal  0.532525 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0491  response regulator receiver  35.14 
 
 
235 aa  141  9e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3909  DNA-binding transcriptional activator DcuR  35.24 
 
 
240 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1163  response regulator receiver and unknown domain protein  36.16 
 
 
231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03995  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with DcuS  35.78 
 
 
239 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3868  response regulator receiver and unknown domain protein  35.78 
 
 
239 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4591  DNA-binding transcriptional activator DcuR  35.78 
 
 
239 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4365  DNA-binding transcriptional activator DcuR  35.78 
 
 
239 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.414132  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4678  DNA-binding transcriptional activator DcuR  35.78 
 
 
239 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3903  DNA-binding transcriptional activator DcuR  35.78 
 
 
239 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.71711  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5638  DNA-binding transcriptional activator DcuR  35.78 
 
 
239 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03956  hypothetical protein  35.78 
 
 
239 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8199  response regulator receiver and unknown domain protein  37.39 
 
 
226 aa  138  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8064  response regulator of citrate/malate metabolism  38.33 
 
 
224 aa  138  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3623  response regulator receiver and unknown domain protein  38.57 
 
 
232 aa  136  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.796239  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4558  DNA-binding transcriptional activator DcuR  37.28 
 
 
239 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>