More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0457 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1416  DNA topoisomerase IV subunit B  55.34 
 
 
665 aa  707    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0092743  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3285  DNA topoisomerase IV subunit B  55.24 
 
 
654 aa  715    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014971  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0925  DNA topoisomerase IV subunit B  54.78 
 
 
666 aa  691    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.305492  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3617  DNA topoisomerase IV subunit B  55.24 
 
 
654 aa  716    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000282926  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1154  DNA topoisomerase IV subunit B  55.64 
 
 
653 aa  698    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1617  DNA topoisomerase IV subunit B  57.82 
 
 
656 aa  725    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000200667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3392  DNA topoisomerase IV subunit B  55.4 
 
 
654 aa  717    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00614907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3355  DNA topoisomerase IV subunit B  55.4 
 
 
654 aa  717    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000033182  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl309  DNA topoisomerase IV subunit B  75.62 
 
 
647 aa  1010    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.747062  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3304  DNA topoisomerase IV subunit B  55.4 
 
 
654 aa  717    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418623  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3706  DNA topoisomerase IV subunit B  55.56 
 
 
654 aa  712    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3624  DNA topoisomerase IV subunit B  55.24 
 
 
654 aa  716    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000439989  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3657  DNA topoisomerase IV subunit B  55.4 
 
 
654 aa  717    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000134084  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0523  DNA topoisomerase IV subunit B  54.4 
 
 
642 aa  676    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0457  DNA topoisomerase IV, B subunit  100 
 
 
643 aa  1303    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.576082  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf020  topoiosmerase IV subunit B  53.49 
 
 
637 aa  657    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2558  DNA topoisomerase IV subunit B  56.87 
 
 
645 aa  715    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3608  DNA topoisomerase IV subunit B  55.4 
 
 
654 aa  717    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.88333e-33 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2247  DNA topoisomerase IV subunit B  54.93 
 
 
654 aa  714    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000227299  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1065  DNA topoisomerase IV subunit B  55.36 
 
 
644 aa  691    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0137081  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1026  DNA topoisomerase IV subunit B  54.42 
 
 
674 aa  653    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0999  DNA topoisomerase IV subunit B  55.52 
 
 
661 aa  694    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1364  DNA topoisomerase IV subunit B  53.05 
 
 
687 aa  664    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0683915  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0633  DNA topoisomerase IV subunit B  55.75 
 
 
649 aa  691    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.144503  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1443  DNA topoisomerase IV subunit B  55.05 
 
 
663 aa  705    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0710964  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0782  DNA topoisomerase IV subunit B  54.45 
 
 
674 aa  686    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000186449  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1609  DNA topoisomerase IV subunit B  55.4 
 
 
654 aa  709    Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000967673  decreased coverage  0.000000000000694445 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  50.08 
 
 
650 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  50 
 
 
644 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  49.06 
 
 
640 aa  598  1e-169  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0006  DNA gyrase, B subunit  48.84 
 
 
647 aa  596  1e-169  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2676  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  49.38 
 
 
638 aa  594  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000429732  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  47.47 
 
 
649 aa  595  1e-168  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  48.9 
 
 
636 aa  593  1e-168  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0005  DNA gyrase subunit B  52.37 
 
 
640 aa  592  1e-168  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  48.9 
 
 
636 aa  593  1e-168  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  48.42 
 
 
635 aa  589  1e-167  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  52.54 
 
 
640 aa  587  1e-166  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  49.29 
 
 
633 aa  586  1e-166  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  50.56 
 
 
640 aa  585  1e-166  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0087  DNA gyrase subunit B  49.07 
 
 
650 aa  585  1e-166  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  48.09 
 
 
634 aa  582  1.0000000000000001e-165  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  48.64 
 
 
632 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  47.55 
 
 
633 aa  584  1.0000000000000001e-165  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  46.25 
 
 
628 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  50.24 
 
 
641 aa  579  1e-164  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  50.63 
 
 
633 aa  579  1e-164  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  49.46 
 
 
645 aa  579  1e-164  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  50.24 
 
 
644 aa  578  1e-164  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  50.24 
 
 
627 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  51.11 
 
 
640 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  46.86 
 
 
636 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  47.26 
 
 
637 aa  577  1.0000000000000001e-163  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  46.66 
 
 
654 aa  568  1e-161  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  50.94 
 
 
640 aa  571  1e-161  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  51.1 
 
 
640 aa  572  1e-161  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  50.94 
 
 
640 aa  571  1e-161  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  50.94 
 
 
640 aa  571  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl006  DNA gyrase subunit B  47.65 
 
 
635 aa  570  1e-161  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  51.26 
 
 
640 aa  570  1e-161  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  50.94 
 
 
640 aa  571  1e-161  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  50.94 
 
 
640 aa  571  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  49.13 
 
 
638 aa  571  1e-161  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0005  DNA gyrase, B subunit  51.03 
 
 
637 aa  566  1e-160  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  50.94 
 
 
640 aa  567  1e-160  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  50.64 
 
 
642 aa  566  1e-160  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0132  DNA gyrase, B subunit  47.08 
 
 
637 aa  565  1e-160  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.312038  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  49 
 
 
648 aa  566  1e-160  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  50.79 
 
 
640 aa  566  1e-160  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  48.52 
 
 
650 aa  566  1e-160  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0306  DNA gyrase, B subunit  46.42 
 
 
643 aa  562  1.0000000000000001e-159  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337431  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  48.36 
 
 
650 aa  564  1.0000000000000001e-159  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf800  DNA gyrase subunit B  47.3 
 
 
647 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  47.19 
 
 
637 aa  565  1.0000000000000001e-159  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0995  DNA gyrase, B subunit  47.66 
 
 
645 aa  563  1.0000000000000001e-159  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  50.63 
 
 
640 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2271  DNA gyrase, B subunit  47.43 
 
 
644 aa  564  1.0000000000000001e-159  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0041  DNA gyrase, B subunit  47.63 
 
 
634 aa  560  1e-158  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  50 
 
 
638 aa  559  1e-158  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  50.16 
 
 
638 aa  560  1e-158  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0005  DNA gyrase subunit B  48.12 
 
 
652 aa  560  1e-158  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.986745  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0966  DNA gyrase, B subunit  47.15 
 
 
650 aa  558  1e-158  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0005  DNA gyrase subunit B  48.74 
 
 
649 aa  555  1e-157  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0007  DNA gyrase, B subunit  48.37 
 
 
642 aa  558  1e-157  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235506  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  47.12 
 
 
651 aa  558  1e-157  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  46.79 
 
 
651 aa  555  1e-157  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  47.31 
 
 
635 aa  556  1e-157  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  49.37 
 
 
643 aa  553  1e-156  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0005  DNA gyrase, B subunit  45.21 
 
 
686 aa  554  1e-156  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  47.48 
 
 
642 aa  552  1e-156  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0005  DNA gyrase, B subunit  48.26 
 
 
636 aa  553  1e-156  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0006  DNA gyrase, B subunit  48.25 
 
 
635 aa  551  1e-155  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.98095 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  44.71 
 
 
665 aa  550  1e-155  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  47.66 
 
 
648 aa  551  1e-155  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000466462  hitchhiker  0.000000932752 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0296  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  45.72 
 
 
642 aa  550  1e-155  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  47.18 
 
 
642 aa  548  1e-155  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_4  DNA gyrase, B subunit  47.32 
 
 
642 aa  550  1e-155  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  48.42 
 
 
633 aa  547  1e-154  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0005  DNA gyrase subunit B  47.57 
 
 
672 aa  546  1e-154  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.78617  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0006  DNA gyrase subunit B  44.89 
 
 
696 aa  547  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>