More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0105 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0105  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 
186 aa  367  1e-101  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl077  peptidyl-tRNA hydrolase  53.76 
 
 
186 aa  217  8.999999999999998e-56  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.464797  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  41.4 
 
 
207 aa  177  8e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  44.39 
 
 
191 aa  176  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  43.55 
 
 
186 aa  174  6e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0270  peptidyl-tRNA hydrolase  45.7 
 
 
185 aa  174  8e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  40.86 
 
 
186 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  40.86 
 
 
186 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  40.86 
 
 
186 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  40.32 
 
 
207 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0140  peptidyl-tRNA hydrolase  40.32 
 
 
190 aa  172  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  40.32 
 
 
210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  40.32 
 
 
186 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  40.32 
 
 
207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  40.32 
 
 
207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  40.32 
 
 
207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  41.05 
 
 
186 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0524  peptidyl-tRNA hydrolase  41.4 
 
 
190 aa  167  6e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0537  peptidyl-tRNA hydrolase  41.4 
 
 
190 aa  167  6e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  45 
 
 
185 aa  165  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0006  peptidyl-tRNA hydrolase  40.32 
 
 
189 aa  161  4.0000000000000004e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  46.24 
 
 
184 aa  161  6e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0175  peptidyl-tRNA hydrolase  48.03 
 
 
182 aa  159  2e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.967698  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  38.71 
 
 
186 aa  157  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0182  peptidyl-tRNA hydrolase  40.11 
 
 
190 aa  157  9e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0010  peptidyl-tRNA hydrolase  41.71 
 
 
188 aa  156  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.64 
 
 
187 aa  155  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0007  peptidyl-tRNA hydrolase  37.97 
 
 
191 aa  153  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0097  peptidyl-tRNA hydrolase  42.86 
 
 
190 aa  153  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000012965  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  41.71 
 
 
196 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2760  peptidyl-tRNA hydrolase  42.31 
 
 
185 aa  152  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  38.5 
 
 
188 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  37.1 
 
 
183 aa  151  5e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03980  peptidyl-tRNA hydrolase  40.59 
 
 
185 aa  150  7e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.469192 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  49.1 
 
 
193 aa  150  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0261  peptidyl-tRNA hydrolase  40.74 
 
 
186 aa  148  3e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0329582  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  40.86 
 
 
188 aa  149  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  40.32 
 
 
188 aa  147  8e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21920  peptidyl-tRNA hydrolase  47.33 
 
 
190 aa  147  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516718 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  37.84 
 
 
194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0954  peptidyl-tRNA hydrolase  41.67 
 
 
188 aa  145  3e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000191784  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  40.49 
 
 
211 aa  144  7.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  40.49 
 
 
211 aa  144  7.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.750534  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1560  peptidyl-tRNA hydrolase  40.33 
 
 
201 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0200988  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1502  peptidyl-tRNA hydrolase  43.32 
 
 
365 aa  144  9e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2121  Aminoacyl-tRNA hydrolase  38.3 
 
 
190 aa  143  1e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.062679 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2056  peptidyl-tRNA hydrolase  38.89 
 
 
214 aa  141  6e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  37.5 
 
 
193 aa  140  9e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0091  peptidyl-tRNA hydrolase  41.9 
 
 
193 aa  140  9.999999999999999e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2128  peptidyl-tRNA hydrolase  38.46 
 
 
201 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000328007  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1595  peptidyl-tRNA hydrolase  34.1 
 
 
192 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4490  Aminoacyl-tRNA hydrolase  43.48 
 
 
210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0949  peptidyl-tRNA hydrolase  36.36 
 
 
216 aa  139  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0109  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.24 
 
 
206 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5435  peptidyl-tRNA hydrolase  37.58 
 
 
207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0637  peptidyl-tRNA hydrolase  46.71 
 
 
189 aa  139  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.205248  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3612  peptidyl-tRNA hydrolase  39.39 
 
 
213 aa  138  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0111  aminoacyl-tRNA hydrolase  37.72 
 
 
191 aa  137  7.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212396  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0897  peptidyl-tRNA hydrolase  41.29 
 
 
230 aa  137  8.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185924  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1073  peptidyl-tRNA hydrolase  38.85 
 
 
199 aa  137  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0489  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 
202 aa  137  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00415538 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf853  peptidyl-tRNA hydrolase  39.78 
 
 
181 aa  136  2e-31  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2631  peptidyl-tRNA hydrolase  38.04 
 
 
196 aa  136  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1291  peptidyl-tRNA hydrolase  38.18 
 
 
204 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3091  peptidyl-tRNA hydrolase  43.31 
 
 
189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3654  peptidyl-tRNA hydrolase  38.16 
 
 
201 aa  135  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000443892  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3654  Aminoacyl-tRNA hydrolase  42.5 
 
 
202 aa  134  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0141  peptidyl-tRNA hydrolase  42.86 
 
 
198 aa  134  7.000000000000001e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3708  peptidyl-tRNA hydrolase  42.5 
 
 
202 aa  134  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219994  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4347  peptidyl-tRNA hydrolase  42 
 
 
210 aa  134  8e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2116  peptidyl-tRNA hydrolase  38.31 
 
 
191 aa  134  8e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4538  peptidyl-tRNA hydrolase  36.32 
 
 
228 aa  134  8e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0234872  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3581  peptidyl-tRNA hydrolase  40.91 
 
 
198 aa  133  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.11 
 
 
187 aa  133  9.999999999999999e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2256  aminoacyl-tRNA hydrolase  36.36 
 
 
205 aa  133  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.281218  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0357  peptidyl-tRNA hydrolase  40.11 
 
 
181 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.52807  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0334  peptidyl-tRNA hydrolase  40.11 
 
 
181 aa  133  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0778  peptidyl-tRNA hydrolase  39.55 
 
 
199 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.881763  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4125  peptidyl-tRNA hydrolase  35.62 
 
 
202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1675  peptidyl-tRNA hydrolase  32.04 
 
 
192 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.224876  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0227  peptidyl-tRNA hydrolase  36.13 
 
 
208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.353061 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2158  peptidyl-tRNA hydrolase  39.07 
 
 
239 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  37.04 
 
 
213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1662  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 
225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.107221  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02721  peptidyl-tRNA hydrolase  42.49 
 
 
200 aa  132  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.778009  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0337  peptidyl-tRNA hydrolase  41.4 
 
 
181 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0071  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.25 
 
 
195 aa  131  5e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.287226  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0265  peptidyl-tRNA hydrolase  33.16 
 
 
205 aa  131  6e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2393  peptidyl-tRNA hydrolase  36.36 
 
 
203 aa  131  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  33.69 
 
 
217 aa  131  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1058  peptidyl-tRNA hydrolase  40.79 
 
 
187 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0054523  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_535  peptidyl-tRNA hydrolase  38.37 
 
 
189 aa  130  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1378  peptidyl-tRNA hydrolase  37.97 
 
 
189 aa  130  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0495277 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1086  peptidyl-tRNA hydrolase  34.73 
 
 
192 aa  130  9e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  40.57 
 
 
189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  35.29 
 
 
197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2818  peptidyl-tRNA hydrolase  35.71 
 
 
203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0122203  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  35.09 
 
 
192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1653  peptidyl-tRNA hydrolase  39.57 
 
 
181 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00866088  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  35.09 
 
 
192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>