94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1268 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1268  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  412  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1168  Carboxymuconolactone decarboxylase  86.87 
 
 		 236 aa  355  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0594  hypothetical protein  77.66 
 
 		 211 aa  299  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1399  hypothetical protein  69.15 
 
 		 207 aa  273  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0802655  normal  0.0447539 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1334  hypothetical protein  68.09 
 
 		 207 aa  270  9e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.256445 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3981  hypothetical protein  51.46 
 
 		 195 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.354663  decreased coverage  0.000440982 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1143  hypothetical protein  42.77 
 
 		 185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1625  hypothetical protein  40.32 
 
 		 217 aa  143  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5467  Carboxymuconolactone decarboxylase  40.36 
 
 		 184 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3497  carboxymuconolactone decarboxylase  41.08 
 
 		 184 aa  137  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2050  hypothetical protein  36.36 
 
 		 216 aa  137  7.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.562513  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5221  carboxymuconolactone decarboxylase  39.2 
 
 		 184 aa  136  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520498  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3980  carboxymuconolactone decarboxylase  41.08 
 
 		 184 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395763  normal  0.33482 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  40.44 
 
 		 191 aa  136  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1956  hypothetical protein  40.54 
 
 		 184 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0715147  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4087  carboxymuconolactone decarboxylase  40.54 
 
 		 184 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4279  carboxymuconolactone decarboxylase  40.54 
 
 		 184 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.445226  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3436  hypothetical protein  40 
 
 		 184 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41770  hypothetical protein  43.75 
 
 		 149 aa  133  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285503  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4499  carboxymuconolactone decarboxylase  39.46 
 
 		 184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2352  hypothetical protein  40 
 
 		 187 aa  124  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1482  hypothetical protein  39.44 
 
 		 187 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2093  hypothetical protein  39.44 
 
 		 187 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0291682  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2386  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.44 
 
 		 193 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3153  hypothetical protein  39.44 
 
 		 193 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1401  hypothetical protein  39.44 
 
 		 187 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1121  hypothetical protein  39.44 
 
 		 187 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0701  hypothetical protein  34.88 
 
 		 181 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3267  hypothetical protein  38.89 
 
 		 187 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5881  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.71 
 
 		 190 aa  119  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7432  hypothetical protein  36.26 
 
 		 182 aa  119  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4676  carboxymuconolactone decarboxylase  35.43 
 
 		 181 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4385  hypothetical protein  34.3 
 
 		 181 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.275783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5286  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.9 
 
 		 181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0750237  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0028  carboxymuconolactone decarboxylase  35.2 
 
 		 185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0805  carboxymuconolactone decarboxylase  33.15 
 
 		 188 aa  108  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0484  hypothetical protein  35.37 
 
 		 192 aa  105  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3269  hypothetical protein  31.95 
 
 		 220 aa  90.9  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290598 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1611  hypothetical protein  29.38 
 
 		 189 aa  86.7  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0145659 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3819  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.65 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0712  hypothetical protein  28.65 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0886  hypothetical protein  25.42 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0928  carboxymuconolactone decarboxylase  29.61 
 
 		 859 aa  81.3  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1494  carboxymuconolactone decarboxylase  27.53 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  27.68 
 
 		 176 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  30.23 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  25.99 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  25.99 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  25.99 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.88 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2958  carboxymuconolactone decarboxylase  27.95 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0231766 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  29.33 
 
 		 173 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  30.23 
 
 		 176 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  34.17 
 
 		 173 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  26.97 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3707  carboxymuconolactone decarboxylase  26.97 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.75 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3720  carboxymuconolactone decarboxylase  26.97 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  27.5 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  29.08 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  27.85 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3226  carboxymuconolactone decarboxylase  26.88 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3288  carboxymuconolactone decarboxylase  26.88 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3237  carboxymuconolactone decarboxylase  26.88 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0525831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3805  carboxymuconolactone decarboxylase  28.17 
 
 		 179 aa  53.9  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  24.86 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  24.86 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  24.86 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  26.34 
 
 		 187 aa  52  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3952  hypothetical protein  22.29 
 
 		 180 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  26.88 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2839  carboxymuconolactone decarboxylase  29.52 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.242216  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  24.41 
 
 		 174 aa  49.3  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2405  carboxymuconolactone decarboxylase  26.81 
 
 		 184 aa  50.1  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.315014 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1658  carboxymuconolactone decarboxylase  31.31 
 
 		 187 aa  48.5  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565944  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  25.14 
 
 		 217 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  26.61 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04023  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G03690)  24.56 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2075  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.03 
 
 		 180 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2330  carboxymuconolactone decarboxylase  25.95 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7422  hypothetical protein  28.28 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.752552  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1176  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.58 
 
 		 180 aa  46.2  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05232  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11590)  26.67 
 
 		 234 aa  45.8  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0846359 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4627  carboxymuconolactone decarboxylase  27.74 
 
 		 183 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0319  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.71 
 
 		 186 aa  45.1  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0965  hypothetical protein  27.03 
 
 		 180 aa  44.7  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2233  Carboxymuconolactone decarboxylase  24.55 
 
 		 193 aa  44.7  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  22.36 
 
 		 180 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0015  carboxymuconolactone decarboxylase  24.77 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00130633  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1801  carboxymuconolactone decarboxylase  26.32 
 
 		 189 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  29.9 
 
 		 178 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6226  carboxymuconolactone decarboxylase  25.64 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  28.83 
 
 		 229 aa  42.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>