More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1507 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1507  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 306 aa  622  1e-177  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0924835  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  48.88 
 
 		 311 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0329  Co/Zn/Cd efflux system component  45.55 
 
 		 294 aa  251  8.000000000000001e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000706414  hitchhiker  0.000000000000071766 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0399  cation diffusion facilitator family transporter  41.94 
 
 		 284 aa  248  1e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00682032  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0383  cation diffusion facilitator family transporter  41.58 
 
 		 284 aa  246  4e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0330741  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  44.64 
 
 		 324 aa  236  3e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1952  cation diffusion facilitator family transporter  38.11 
 
 		 298 aa  231  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110398  normal  0.0228516 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  41.4 
 
 		 300 aa  219  6e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3626  cation diffusion facilitator family transporter  37.42 
 
 		 321 aa  211  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.89177 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3964  cation diffusion facilitator family transporter  37.42 
 
 		 321 aa  211  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0559635  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0280  cation diffusion facilitator family transporter  40.51 
 
 		 291 aa  201  9.999999999999999e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2884  cation diffusion facilitator family transporter  36.15 
 
 		 307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  36.43 
 
 		 314 aa  200  3e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3275  cation diffusion facilitator family transporter  35.49 
 
 		 302 aa  198  7.999999999999999e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0220502  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  38.41 
 
 		 294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  32.17 
 
 		 312 aa  189  4e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  33.68 
 
 		 334 aa  188  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  35.07 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3467  cation diffusion facilitator family transporter  36.63 
 
 		 300 aa  187  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  34.88 
 
 		 311 aa  186  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  38.1 
 
 		 305 aa  183  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  39.55 
 
 		 298 aa  183  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  39.11 
 
 		 299 aa  183  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  34.4 
 
 		 298 aa  182  9.000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  33.69 
 
 		 326 aa  181  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  36.13 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  38.77 
 
 		 342 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  35.4 
 
 		 306 aa  176  4e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4080  cation diffusion facilitator family transporter  34.53 
 
 		 295 aa  176  6e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  34.72 
 
 		 304 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  38.55 
 
 		 342 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  34.13 
 
 		 312 aa  173  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  33.58 
 
 		 305 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0712  cation diffusion facilitator family transporter  38.49 
 
 		 301 aa  172  7.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0693  cation diffusion facilitator family transporter  34.91 
 
 		 312 aa  172  9e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1852  cation diffusion facilitator family transporter  34.96 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.63223  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  35.64 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  37.68 
 
 		 315 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1408  CzcD family heavy metal efflux protein  36.33 
 
 		 321 aa  170  3e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.475704 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  35 
 
 		 305 aa  170  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1122  cation diffusion facilitator family transporter  36.57 
 
 		 317 aa  169  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000327537  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  36.79 
 
 		 307 aa  169  8e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  34.91 
 
 		 299 aa  168  9e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  35.27 
 
 		 299 aa  168  9e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  35.27 
 
 		 299 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  35.25 
 
 		 299 aa  167  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3652  cation diffusion facilitator family transporter  36.57 
 
 		 384 aa  168  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1796  Co/Zn/Cd efflux system component  33.94 
 
 		 296 aa  168  1e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03787  Co/Zn/Cd efflux system component  36.98 
 
 		 320 aa  168  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00228734  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  34.72 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  35.63 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  34.84 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  34.84 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  34.28 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  35.25 
 
 		 299 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  35.25 
 
 		 299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4276  cation efflux protein  36.47 
 
 		 325 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  35.25 
 
 		 299 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  34.87 
 
 		 299 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4118  cation diffusion facilitator family transporter  36.47 
 
 		 325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0032  cation efflux family protein  37.59 
 
 		 316 aa  166  4e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  35.53 
 
 		 301 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  35.53 
 
 		 301 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  36.17 
 
 		 310 aa  166  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  35.53 
 
 		 301 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  35.53 
 
 		 301 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  34.87 
 
 		 299 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  35.05 
 
 		 312 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  32.83 
 
 		 313 aa  166  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  34.71 
 
 		 312 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  34.71 
 
 		 312 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  34.52 
 
 		 305 aa  165  6.9999999999999995e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  34.71 
 
 		 312 aa  165  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2300  cation efflux protein  36.19 
 
 		 300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  32.5 
 
 		 309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  35.21 
 
 		 327 aa  163  3e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3234  cation diffusion facilitator family transporter  32.83 
 
 		 323 aa  163  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.34559  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  34.48 
 
 		 312 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  33.67 
 
 		 312 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  33.67 
 
 		 312 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1429  cation diffusion facilitator family transporter  34.88 
 
 		 296 aa  162  6e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4476  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 		 312 aa  162  7e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  33.94 
 
 		 312 aa  162  9e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  32.72 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  36.33 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0672  zinc transporter ZitB  37.79 
 
 		 313 aa  161  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00307439  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  32.73 
 
 		 332 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  32.72 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4665  cation diffusion facilitator family transporter  30.93 
 
 		 336 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0154  cation diffusion facilitator family transporter  36.79 
 
 		 319 aa  160  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.618945  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0159  cation diffusion facilitator family transporter  36.79 
 
 		 319 aa  160  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  32.69 
 
 		 325 aa  160  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  32.08 
 
 		 300 aa  160  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2104  cation diffusion facilitator family transporter  38.71 
 
 		 342 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.20697  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1284  zinc transporter ZitB  36.23 
 
 		 316 aa  159  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000026139  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3476  cation diffusion facilitator family transporter  32.84 
 
 		 328 aa  159  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.434563  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  33.98 
 
 		 326 aa  159  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3688  cation diffusion facilitator family transporter  32.64 
 
 		 335 aa  159  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0974105  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2195  cation diffusion facilitator family transporter  38.71 
 
 		 342 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  34.36 
 
 		 316 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>