More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0329 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0329  Co/Zn/Cd efflux system component  100 
 
 		 294 aa  591  1e-168  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000706414  hitchhiker  0.000000000000071766 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1507  cation diffusion facilitator family transporter  45.55 
 
 		 306 aa  251  8.000000000000001e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0924835  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0399  cation diffusion facilitator family transporter  41.2 
 
 		 284 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00682032  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  42.91 
 
 		 324 aa  231  1e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0383  cation diffusion facilitator family transporter  40.82 
 
 		 284 aa  229  3e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0330741  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  42.37 
 
 		 311 aa  226  4e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1952  cation diffusion facilitator family transporter  38.25 
 
 		 298 aa  213  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110398  normal  0.0228516 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  38.11 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  36.73 
 
 		 317 aa  185  9e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  35.71 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3964  cation diffusion facilitator family transporter  35.85 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0559635  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3626  cation diffusion facilitator family transporter  35.85 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.89177 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2104  cation diffusion facilitator family transporter  39.43 
 
 		 342 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.20697  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1122  cation diffusion facilitator family transporter  36.09 
 
 		 317 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000327537  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2195  cation diffusion facilitator family transporter  39.78 
 
 		 342 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  34.4 
 
 		 312 aa  172  5.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  35.59 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  32.34 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0712  cation diffusion facilitator family transporter  37.46 
 
 		 301 aa  171  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  37.02 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  35.82 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1735  cation diffusion facilitator family transporter  39.57 
 
 		 342 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.912037  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3275  cation diffusion facilitator family transporter  36.56 
 
 		 302 aa  169  6e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0220502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  37.02 
 
 		 299 aa  169  7e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3467  cation diffusion facilitator family transporter  35.71 
 
 		 300 aa  168  8e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  34.18 
 
 		 306 aa  168  9e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  36.64 
 
 		 299 aa  168  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  32.87 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  35.21 
 
 		 342 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  35.69 
 
 		 299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  35.88 
 
 		 295 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  38.38 
 
 		 325 aa  166  5e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  38.38 
 
 		 325 aa  166  5e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  35.5 
 
 		 299 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  35.5 
 
 		 299 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  33.94 
 
 		 312 aa  165  9e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  34.94 
 
 		 299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0280  cation diffusion facilitator family transporter  33.92 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  37.19 
 
 		 342 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2884  cation diffusion facilitator family transporter  32.38 
 
 		 307 aa  163  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  36.81 
 
 		 312 aa  162  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3476  cation diffusion facilitator family transporter  34.29 
 
 		 328 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.434563  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  30.32 
 
 		 305 aa  162  6e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  35.42 
 
 		 304 aa  162  7e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  34.83 
 
 		 315 aa  162  7e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1796  Co/Zn/Cd efflux system component  34.28 
 
 		 296 aa  162  7e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  33.1 
 
 		 305 aa  162  9e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  33.08 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  35.04 
 
 		 326 aa  159  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  32.96 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  32.96 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  33.71 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  33.71 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1178  cation efflux family protein  33.96 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.349373  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  30.8 
 
 		 331 aa  157  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  36.76 
 
 		 317 aa  156  3e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  33.22 
 
 		 378 aa  156  5.0000000000000005e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1042  cation efflux family protein  33.22 
 
 		 298 aa  155  7e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0815398  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  35.59 
 
 		 312 aa  155  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  35.59 
 
 		 312 aa  155  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  35.59 
 
 		 312 aa  155  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  32.58 
 
 		 307 aa  155  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  34.44 
 
 		 310 aa  155  8e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0020  cation efflux family protein  33.46 
 
 		 314 aa  155  9e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0032  cation efflux family protein  37.69 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1297  cation efflux family protein  33.21 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  33.45 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1284  zinc transporter ZitB  37.01 
 
 		 316 aa  153  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000026139  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 314 aa  152  5e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  34.28 
 
 		 316 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  31.46 
 
 		 309 aa  152  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  34.34 
 
 		 315 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  31.66 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6519  cation diffusion facilitator family transporter  36.54 
 
 		 328 aa  151  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0922  cation efflux protein  32.13 
 
 		 303 aa  151  1e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.134705  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  31.66 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  31.66 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  31.66 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4080  cation diffusion facilitator family transporter  34.66 
 
 		 295 aa  151  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  32.33 
 
 		 304 aa  150  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  32.23 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1852  cation diffusion facilitator family transporter  33.96 
 
 		 311 aa  151  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.63223  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  34.87 
 
 		 327 aa  150  3e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  35.06 
 
 		 306 aa  150  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  36.23 
 
 		 310 aa  149  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  29.79 
 
 		 314 aa  149  4e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  29.09 
 
 		 311 aa  149  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  30.1 
 
 		 326 aa  149  6e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  28.12 
 
 		 334 aa  148  9e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  30.37 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2551  cation diffusion facilitator family transporter  33.21 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1700  cation efflux system protein  33.08 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  31.19 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4666  CDF family cation efflux system protein  34.77 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03787  Co/Zn/Cd efflux system component  31.8 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00228734  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  31.65 
 
 		 302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  31.82 
 
 		 398 aa  146  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  35.25 
 
 		 299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1885  cation diffusion facilitator family transporter  32.2 
 
 		 343 aa  146  5e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2440  cation diffusion facilitator family transporter  31.23 
 
 		 365 aa  145  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516557  normal  0.641383 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>