More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0188 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0188  transcriptional regulator  100 
 
 		 232 aa  474  1e-133  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0560306 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0249  GntR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 234 aa  178  5.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0255  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  39.74 
 
 		 234 aa  178  5.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3530  GntR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 235 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.814628  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4671  trehalose operon repressor  34.56 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.38863e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0666  trehalose operon repressor  34.56 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0543  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0597  trehalose operon transcriptional repressor  34.1 
 
 		 236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.464881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0630  trehalose operon transcriptional repressor  34.1 
 
 		 236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0541  trehalose operon transcriptional repressor  34.1 
 
 		 236 aa  113  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0541  trehalose operon transcriptional repressor  34.1 
 
 		 236 aa  113  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0685  trehalose operon repressor  34.1 
 
 		 236 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.327487 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0698  trehalose operon transcriptional repressor  32.72 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0759  trehalose operon repressor  32.72 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2998  transcriptional regulator, GntR family  30.38 
 
 		 239 aa  102  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1622  transcriptional regulator, GntR family  29.47 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  30.14 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2666  transcriptional regulator, GntR family  28.51 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0191  transcriptional regulator  31.31 
 
 		 241 aa  95.9  5e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.168496 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1211  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 241 aa  94.4  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  29.72 
 
 		 247 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1687  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 243 aa  93.6  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2016  transcriptional regulator, GntR family  28.24 
 
 		 242 aa  93.2  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.47195  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2552  transcriptional regulator, GntR family  27.05 
 
 		 237 aa  92.4  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1472  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 238 aa  92  7e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000013898  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3873  transcriptional regulator, GntR family  30.63 
 
 		 244 aa  90.9  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1962  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 242 aa  90.5  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00453299  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0559  transcriptional regulator  30.29 
 
 		 242 aa  89  6e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000128597  hitchhiker  0.00000147754 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  27.31 
 
 		 240 aa  88.6  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3397  GntR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 250 aa  87.8  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  26.55 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0076  transcriptional regulator, GntR family  26.76 
 
 		 235 aa  87.4  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.15859  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  26.55 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  26.55 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  26.55 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  26.55 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0016  GntR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 248 aa  86.7  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  26.55 
 
 		 240 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  28.37 
 
 		 235 aa  85.9  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1309  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 238 aa  85.1  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0077  transcriptional regulator, GntR family  29.39 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  26.03 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 225 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  27.54 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0020  transcriptional regulator, GntR family  29.15 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4049  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.855147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3895  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5116  transcriptional regulator, GntR family  29.15 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0019  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4235  transcriptional regulator, GntR family  29.15 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4192  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0776  transcriptional regulator, GntR family  27.43 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3202  transcriptional regulator, GntR family  28.86 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  26.85 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3593  transcriptional regulator, GntR family  27.62 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0156  putative transcriptional regulator, GntR family  25.74 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  27.32 
 
 		 249 aa  72  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  25.57 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1632  GntR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.367647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9128  putative transcriptional regulator, GntR family  23.25 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.783412  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  26.74 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5259  transcriptional regulator, GntR family  25.68 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3472  transcriptional regulator, GntR family  25.49 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00483129  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2760  GntR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0304853  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0527  trehalose operon transcriptional repressor  25.12 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1740  GntR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.40989  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04070  transcriptional regulator, GntR family  24.04 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1898  GntR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000197182  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4520  transcriptional regulator, GntR family  25.93 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0836  GntR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.840865  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1334  transcriptional regulator, GntR family  27.75 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  decreased coverage  0.000248139 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3995  putative GntR-family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.963661 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 232 aa  67  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4116  putative GntR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4011  putative GntR-family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2822  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  28.22 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1621  GntR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 239 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00823964  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4066  putative GntR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.980684 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0763  GntR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237996 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0376  transcriptional regulator, GntR family  22.94 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2024  transcriptional regulator, GntR family  25.12 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.205752  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0958  transcriptional regulator, GntR family  26.41 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1446  transcriptional regulator, GntR family  25.12 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0543  trehalose operon repressor  24.64 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.405615  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3559  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  26.98 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  27.01 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15390  transcriptional regulator  24.16 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.457467 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2580  GntR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496201  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0480  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00570822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>