More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1735 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1735  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
261 aa  512  1e-144  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1326  alpha/beta hydrolase fold protein  43.75 
 
 
279 aa  158  7e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  41.87 
 
 
248 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10250  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  44.22 
 
 
289 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1087  alpha/beta hydrolase fold protein  41.53 
 
 
245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0523898  normal  0.954451 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0986  prolyl aminopeptidase  33.94 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.298096  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6107  alpha/beta hydrolase fold protein  44.12 
 
 
231 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.519556  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  39.76 
 
 
263 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 
264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  36.13 
 
 
265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  35.74 
 
 
265 aa  126  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0670  alpha/beta hydrolase fold  41.43 
 
 
254 aa  123  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2426  alpha/beta hydrolase fold protein  34.75 
 
 
267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.423437  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  38.11 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  39.29 
 
 
255 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  38.11 
 
 
263 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  33.2 
 
 
266 aa  119  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  37.04 
 
 
265 aa  118  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  37.3 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  32.41 
 
 
264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  39.29 
 
 
263 aa  115  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  33.2 
 
 
266 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  32.53 
 
 
265 aa  113  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 
266 aa  112  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 
264 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  34.65 
 
 
237 aa  106  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.809032  normal  0.841425 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  31.98 
 
 
264 aa  105  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3108  alpha/beta hydrolase fold protein  35.86 
 
 
248 aa  99.8  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962894  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  29.76 
 
 
263 aa  98.2  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  24.39 
 
 
283 aa  95.5  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2174  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 
261 aa  92.8  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  25.49 
 
 
277 aa  92.8  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 
263 aa  92  9e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  19.84 
 
 
262 aa  90.5  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03993  putative bioH protein  29.67 
 
 
269 aa  89  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.39714  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1471  alpha/beta hydrolase fold  31.76 
 
 
234 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  29.69 
 
 
280 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2276  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.253162  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1738  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 
241 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.44874  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  27.47 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5034  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 
245 aa  82.4  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.246074  normal  0.671643 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  32.16 
 
 
309 aa  82  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  30.04 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  31.37 
 
 
259 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  28.94 
 
 
262 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1989  alpha/beta hydrolase fold  32.37 
 
 
235 aa  80.5  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.512291  normal  0.434462 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  26.8 
 
 
263 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  27.04 
 
 
270 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 
265 aa  79  0.00000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0171248  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0874  putative hydrolase  28.63 
 
 
233 aa  77.8  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4141  Alpha/beta hydrolase protein  30 
 
 
233 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04395  hydrolase, alpha/beta fold family protein  24.6 
 
 
263 aa  77.4  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.681804  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1855  alpha/beta hydrolase fold  27.89 
 
 
276 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.121487  decreased coverage  0.00000000112067 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2251  3-oxoadipate enol-lactonase  26.82 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  24.33 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  26.74 
 
 
264 aa  75.5  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0925  3-oxoadipate enol-lactonase  26.44 
 
 
262 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.195291 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  23.32 
 
 
257 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  23.32 
 
 
257 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  23.32 
 
 
257 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 
279 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0327  alpha/beta hydrolase  32.97 
 
 
237 aa  75.1  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1910  alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 
276 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.1426  hitchhiker  0.0000239826 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3629  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030304  hitchhiker  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  25.6 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  25.19 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  24.4 
 
 
257 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 
257 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  25.19 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  24.23 
 
 
264 aa  73.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  30.35 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1692  3-oxoadipate enol-lactonase  31.1 
 
 
269 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1645  alpha/beta hydrolase fold  28.51 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.996172  normal  0.353966 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 
264 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  26.41 
 
 
239 aa  73.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  30 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  26.44 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  29.85 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  29.25 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 
279 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  28.92 
 
 
277 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  28.92 
 
 
292 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  29.07 
 
 
266 aa  72  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  26.92 
 
 
275 aa  71.2  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2123  alpha/beta hydrolase fold  24.8 
 
 
276 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.412554  hitchhiker  0.000231398 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  25.19 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  25.19 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 
256 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  31.76 
 
 
251 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  25.3 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  25.77 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2473  alpha/beta fold family hydrolase  25.9 
 
 
277 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3387  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 
306 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  30.99 
 
 
279 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3642  alpha/beta fold family hydrolase  23.2 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  23.68 
 
 
277 aa  69.7  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
263 aa  69.7  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0123978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>