121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0568 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0568  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 468 aa  916    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3166  major facilitator superfamily MFS_1  50.88 
 
 		 462 aa  392  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3661  major facilitator superfamily MFS_1  47.24 
 
 		 467 aa  360  2e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3874  major facilitator transporter  45.75 
 
 		 467 aa  347  2e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0574  major facilitator superfamily MFS_1  47.82 
 
 		 440 aa  346  6e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2368  major facilitator superfamily MFS_1  42.53 
 
 		 445 aa  334  2e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.854492  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18980  major facilitator superfamily permease  46.09 
 
 		 440 aa  334  2e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.273601  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25210  major facilitator superfamily permease  41.52 
 
 		 449 aa  302  1e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.302409  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1700  major facilitator superfamily MFS_1  40.56 
 
 		 472 aa  295  9e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0635  major facilitator superfamily MFS_1  42.25 
 
 		 456 aa  290  5.0000000000000004e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2937  major facilitator superfamily transporter  37.95 
 
 		 435 aa  274  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3637  major facilitator transporter  39.69 
 
 		 454 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35063  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3710  major facilitator superfamily transporter  39.69 
 
 		 454 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.417195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3642  major facilitator transporter  39.69 
 
 		 454 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.266137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2546  major facilitator transporter  37.99 
 
 		 449 aa  265  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.146508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4097  major facilitator superfamily transporter  38.48 
 
 		 443 aa  232  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1842  major facilitator superfamily MFS_1  33.64 
 
 		 451 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12530  leucine and alanine rich integral membrane protein  36.32 
 
 		 445 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0104482 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1010  major facilitator transporter  33.92 
 
 		 429 aa  219  7.999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3661  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 426 aa  212  9e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2130  major facilitator family transporter  31.91 
 
 		 435 aa  208  1e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0193  transporter, MFS superfamily  32.51 
 
 		 460 aa  205  1e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0334  hypothetical protein  28.97 
 
 		 424 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3914  major facilitator superfamily MFS_1  29.69 
 
 		 462 aa  195  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0315  hypothetical protein  28.74 
 
 		 424 aa  194  3e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0192  major facilitator transporter  31.45 
 
 		 469 aa  193  5e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4238  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 		 462 aa  189  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.239966 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1429  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 466 aa  188  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0160  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 462 aa  187  4e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4369  hypothetical protein  28.75 
 
 		 440 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.486519  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0027  major facilitator superfamily MFS_1  30.04 
 
 		 465 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0022  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 463 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0083  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 462 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.339646  normal  0.26187 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0343  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 454 aa  169  8e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3188  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 463 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.988714 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0322  major facilitator transporter  30.64 
 
 		 467 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0721  major facilitator transporter  29.15 
 
 		 465 aa  161  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1085  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 493 aa  159  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3337  major facilitator superfamily (MFS) transporter  30.21 
 
 		 443 aa  157  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1817  hypothetical protein  26.69 
 
 		 455 aa  156  9e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404559  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1654  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 416 aa  152  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1624  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 		 421 aa  151  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767884  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1472  major facilitator superfamily MFS_1  26.86 
 
 		 419 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.905727  normal  0.384031 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2658  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 469 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.494745  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0936  MFS transporter family protein  27.62 
 
 		 458 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1854  major facilitator superfamily permease/ BtlA-like  27.99 
 
 		 440 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000121925  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2662  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 460 aa  137  5e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1522  major facilitator superfamily MFS_1  24.89 
 
 		 426 aa  136  7.000000000000001e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.101861  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1012  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 		 428 aa  136  7.000000000000001e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.389524 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3421  major facilitator transporter  28.09 
 
 		 466 aa  135  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564111  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1317  major facilitator transporter  26.24 
 
 		 474 aa  133  6.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8065  hitchhiker  0.00000263926 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1324  MFS transporter family protein  27.64 
 
 		 425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1274  putative integral membrane protein  27.17 
 
 		 430 aa  130  7.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0020  major facilitator transporter  29.39 
 
 		 456 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.482167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1316  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 492 aa  119  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.387007  hitchhiker  0.0000142592 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2758  major facilitator transporter  24.88 
 
 		 447 aa  116  7.999999999999999e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1758  putative transporter  27.29 
 
 		 460 aa  113  9e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2301  major facilitator superfamily permease  27.42 
 
 		 453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.334509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3164  major facilitator superfamily permease  27.64 
 
 		 453 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21750  major facilitator superfamily permease  26.43 
 
 		 474 aa  111  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109771  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0458  hypothetical protein  23.62 
 
 		 427 aa  109  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000401747  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22460  major facilitator superfamily MFS_1  24.1 
 
 		 421 aa  109  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3202  major facilitator superfamily MFS_1  23.44 
 
 		 444 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0507  hypothetical protein  23.18 
 
 		 427 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.130258  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0030  major facilitator transporter  28.28 
 
 		 456 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2515  major facilitator superfamily MFS_1  23.21 
 
 		 433 aa  104  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0373  major facilitator transporter  22.96 
 
 		 427 aa  103  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110963  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2044  major facilitator transporter  24.13 
 
 		 436 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0220318 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2708  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 		 450 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342766  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1904  major facilitator superfamily MFS_1  22.89 
 
 		 430 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1362  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 456 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14630  major facilitator superfamily permease  25.93 
 
 		 462 aa  101  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415319 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0507  hypothetical protein  22.96 
 
 		 427 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2277  major facilitator superfamily MFS_1  23.92 
 
 		 469 aa  99.8  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.419016  normal  0.219783 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0379  hypothetical protein  22.96 
 
 		 427 aa  99.8  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000021693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0370  major facilitator superfamily permease  22.96 
 
 		 427 aa  99.8  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.902830000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0367  major facilitator superfamily permease  22.96 
 
 		 427 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000714912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0393  hypothetical protein  22.96 
 
 		 427 aa  99.8  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0437  hypothetical protein  22.96 
 
 		 427 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2972  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 		 442 aa  99  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.737462  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2713  major facilitator superfamily MFS_1  23.95 
 
 		 424 aa  97.4  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1801  major facilitator superfamily protein  27.22 
 
 		 448 aa  97.4  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.640412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4866  hypothetical protein  22.82 
 
 		 427 aa  96.7  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1893  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 		 458 aa  95.9  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0030  permease  24.2 
 
 		 437 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345375  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2328  major facilitator transporter  25.11 
 
 		 465 aa  95.5  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1217  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 432 aa  94.7  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0379  major facilitator transporter  21.59 
 
 		 427 aa  94  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000550837  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2251  major facilitator superfamily MFS_1  22 
 
 		 439 aa  93.2  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2670  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 458 aa  92.8  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.88531  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5507  major facilitator superfamily permease/BtlA- like protein  24.61 
 
 		 451 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.462661  normal  0.0808457 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2003  permease  23.13 
 
 		 435 aa  92  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3411  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 		 469 aa  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0146  major facilitator superfamily MFS_1  22.98 
 
 		 414 aa  91.7  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.243784  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5316  major facilitator superfamily MFS_1  23.97 
 
 		 572 aa  91.3  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1838  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 		 439 aa  90.9  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.047376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4202  hypothetical protein  25.37 
 
 		 479 aa  90.5  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.246317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2014  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 426 aa  88.6  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273868  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0586  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 		 444 aa  87.4  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0406  major facilitator superfamily MFS_1  29.04 
 
 		 404 aa  87  7e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>