More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0277 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0277  ABC transporter related  100 
 
 		 511 aa  1001    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.277921  normal  0.268674 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01050  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  52.69 
 
 		 526 aa  491  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.552248  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0046  sugar ABC transporter ATPase  47.12 
 
 		 513 aa  472  1e-132  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0138528  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0279  ABC transporter related  49.7 
 
 		 526 aa  474  1e-132  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.60123  normal  0.12609 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01030  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  47.24 
 
 		 522 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3040  ABC transporter related protein  48.92 
 
 		 529 aa  442  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0420  ABC transporter related protein  50.5 
 
 		 507 aa  444  1e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1854  ABC transporter related  48.52 
 
 		 505 aa  424  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.99038  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1048  ABC transporter related  47.22 
 
 		 506 aa  410  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2119  ABC transporter related  44 
 
 		 504 aa  408  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.307687  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6222  sugar ABC transporter ATP-binding protein  45.49 
 
 		 503 aa  408  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.597291 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5517  ABC transporter related  45.08 
 
 		 516 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422457  normal  0.0683787 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1224  ABC transporter related  40.91 
 
 		 510 aa  397  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4809  ABC transporter related  44.92 
 
 		 549 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0173038  hitchhiker  0.00297179 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2251  ABC transporter-related protein  45.82 
 
 		 511 aa  392  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687423  hitchhiker  0.00000468234 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6482  ABC transporter related  45.11 
 
 		 504 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.611957  normal  0.251961 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5626  ABC transporter related  45.11 
 
 		 504 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000841006  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5991  ABC transporter related  45.11 
 
 		 504 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122815  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5962  ABC transporter related  44.98 
 
 		 503 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0248969 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4096  ABC transporter related  44.18 
 
 		 525 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4208  ABC transporter related  44.18 
 
 		 525 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.577364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1721  ABC transporter related  44.27 
 
 		 507 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0492105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6194  ABC transporter related  44.51 
 
 		 504 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4909  ABC transporter related  45.82 
 
 		 505 aa  382  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.368986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5925  ABC transporter related  44.31 
 
 		 504 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.737944  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5049  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  41.55 
 
 		 512 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1905  ABC transporter related  43.5 
 
 		 507 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308353  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2343  ATP binding protein of ABC transporter  45.02 
 
 		 502 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1987  ABC transporter related  41.45 
 
 		 499 aa  364  2e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.479214  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3534  ABC transporter related  40.64 
 
 		 523 aa  364  2e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.116696 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1987  ABC transporter related  41.45 
 
 		 500 aa  364  3e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.063033 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2058  ABC transporter related  40.68 
 
 		 499 aa  364  3e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0983  ABC transporter related  42.66 
 
 		 501 aa  362  9e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2148  ABC transporter related  39.96 
 
 		 499 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.123365  normal  0.259949 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2074  ABC transporter related  41.25 
 
 		 499 aa  361  2e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.144534  hitchhiker  0.0000031172 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0476  putative sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  41.63 
 
 		 496 aa  359  7e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.251819  normal  0.0934917 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4067  ABC transporter related  41.63 
 
 		 496 aa  359  7e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4706  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.04 
 
 		 500 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.706122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0148  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  41.43 
 
 		 496 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.361964  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2128  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.12 
 
 		 516 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4482  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.04 
 
 		 500 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4038  ABC transporter related  42.28 
 
 		 506 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4798  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.04 
 
 		 500 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4228  ABC transporter related protein  42.91 
 
 		 506 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04097  predicted sugar transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  41.84 
 
 		 500 aa  355  7.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04061  hypothetical protein  41.84 
 
 		 500 aa  355  7.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0969  ABC transporter related  41.93 
 
 		 500 aa  354  2e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3765  ABC transporter related protein  41.84 
 
 		 500 aa  354  2e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3782  ABC transporter related  41.84 
 
 		 500 aa  354  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0413  ABC transporter related  42.07 
 
 		 500 aa  352  1e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  41 
 
 		 497 aa  351  2e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1417  ABC transporter related  42.57 
 
 		 515 aa  349  7e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.441776  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  43.09 
 
 		 519 aa  348  1e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  37.04 
 
 		 496 aa  344  2.9999999999999997e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  41.48 
 
 		 504 aa  342  1e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4365  ABC transporter related  40.43 
 
 		 585 aa  339  8e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal  0.0851247 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0767  putative sugar uptake ABC transporter ATP-binding protein  40.88 
 
 		 501 aa  338  9.999999999999999e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.162932 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4767  ABC transporter-related protein  41.12 
 
 		 503 aa  337  3.9999999999999995e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.883977 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2447  ABC transporter related protein  39.83 
 
 		 495 aa  336  5.999999999999999e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000548266  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  38.83 
 
 		 503 aa  334  2e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6710  ABC transporter, ATP binding subunit (putative high-affinity D-ribose transport)  41.41 
 
 		 507 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11533  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3784  ABC transporter related  40 
 
 		 506 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4723  ABC transporter related  41.41 
 
 		 506 aa  326  6e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.943494  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  37.52 
 
 		 506 aa  325  8.000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  38.49 
 
 		 495 aa  325  1e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4200  ABC transporter related  41.2 
 
 		 528 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  41.32 
 
 		 499 aa  324  2e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4920  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.84 
 
 		 519 aa  324  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.671617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5219  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.12 
 
 		 515 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  38.37 
 
 		 500 aa  322  9.999999999999999e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5640  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.12 
 
 		 515 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273168  normal  0.0496803 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  36.17 
 
 		 509 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  36.89 
 
 		 499 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.12 
 
 		 515 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0885  ABC sugar transporter, ATPase subunit  39.57 
 
 		 506 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533742  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  36.89 
 
 		 499 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4739  ABC transporter related  38.61 
 
 		 497 aa  320  5e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.383875  hitchhiker  0.00325994 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.92 
 
 		 522 aa  320  5e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3207  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.44 
 
 		 515 aa  319  6e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  36.49 
 
 		 517 aa  319  7e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  35.97 
 
 		 520 aa  318  1e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2787  ABC transporter for sugar (aldose) ATP-binding protein  36.66 
 
 		 495 aa  318  1e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0149064  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0380  ABC transporter related  36.58 
 
 		 544 aa  318  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  36.77 
 
 		 510 aa  317  3e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1627  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.84 
 
 		 525 aa  317  4e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  39.71 
 
 		 509 aa  317  4e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4341  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  36.25 
 
 		 544 aa  317  4e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  36.52 
 
 		 507 aa  316  6e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  39.43 
 
 		 508 aa  316  6e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  37.86 
 
 		 500 aa  316  6e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5475  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.08 
 
 		 520 aa  316  7e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0511877 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  35.76 
 
 		 506 aa  315  8e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  39.71 
 
 		 516 aa  315  9e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  40.08 
 
 		 501 aa  315  9.999999999999999e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2148  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.67 
 
 		 507 aa  315  9.999999999999999e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  36.53 
 
 		 506 aa  315  9.999999999999999e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2246  L-arabinose transporter ATP-binding protein  38.81 
 
 		 511 aa  315  9.999999999999999e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000548441 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2604  ABC transporter related  40.25 
 
 		 522 aa  314  1.9999999999999998e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  38.49 
 
 		 527 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  37.32 
 
 		 501 aa  314  1.9999999999999998e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>