More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3761 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3761  isopropylmalate isomerase large subunit  100 
 
 		 466 aa  937    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0695  isopropylmalate isomerase large subunit  69.44 
 
 		 464 aa  650    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5998  isopropylmalate isomerase large subunit  68.47 
 
 		 473 aa  639    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00498287 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1938  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  64.29 
 
 		 468 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2261  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  59.78 
 
 		 472 aa  531  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3280  isopropylmalate isomerase large subunit  58.46 
 
 		 467 aa  530  1e-149  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.215534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0158  isopropylmalate isomerase large subunit  57.14 
 
 		 472 aa  521  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2523  isopropylmalate isomerase large subunit  57.14 
 
 		 475 aa  518  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.520601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0194  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  57.2 
 
 		 469 aa  519  1e-146  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0863  isopropylmalate isomerase large subunit  56.93 
 
 		 475 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28677  predicted protein  54.55 
 
 		 722 aa  512  1e-144  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2149  isopropylmalate isomerase large subunit  56.03 
 
 		 466 aa  514  1e-144  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.754808  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1189  isopropylmalate isomerase large subunit  54.86 
 
 		 472 aa  508  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.672672  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2785  isopropylmalate isomerase large subunit  57.27 
 
 		 468 aa  507  9.999999999999999e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0348  isopropylmalate isomerase large subunit  57.05 
 
 		 470 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2916  isopropylmalate isomerase large subunit  57.27 
 
 		 470 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0363  isopropylmalate isomerase large subunit  57.7 
 
 		 468 aa  506  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.271446  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0240  isopropylmalate isomerase large subunit  56.62 
 
 		 469 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0504  isopropylmalate isomerase large subunit  56.62 
 
 		 470 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1423  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  53.72 
 
 		 473 aa  503  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0216  isopropylmalate isomerase large subunit  56.75 
 
 		 480 aa  499  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.146559 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1245  isopropylmalate isomerase large subunit  56.93 
 
 		 470 aa  499  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.923179  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1705  isopropylmalate isomerase large subunit  55.96 
 
 		 468 aa  501  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0785429  hitchhiker  0.00273209 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3584  isopropylmalate isomerase large subunit  57.48 
 
 		 468 aa  501  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.931395  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02270  3-isopropylmalate dehydratase, putative  51.57 
 
 		 762 aa  496  1e-139  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0205062  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1922  isopropylmalate isomerase large subunit  58.03 
 
 		 467 aa  496  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0227  isopropylmalate isomerase large subunit  56.4 
 
 		 473 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400027 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0861  isopropylmalate isomerase large subunit  53.65 
 
 		 471 aa  496  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0775  isopropylmalate isomerase large subunit  58.28 
 
 		 470 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34280  isopropylmalate isomerase large subunit  56.14 
 
 		 474 aa  493  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1812  isopropylmalate isomerase large subunit  57.2 
 
 		 466 aa  493  9.999999999999999e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.364535  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0135  isopropylmalate isomerase large subunit  55.77 
 
 		 468 aa  493  9.999999999999999e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0383908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2508  isopropylmalate isomerase large subunit  56.75 
 
 		 467 aa  493  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0624  isopropylmalate isomerase large subunit  58.28 
 
 		 470 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0085  isopropylmalate isomerase large subunit  56.29 
 
 		 467 aa  493  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362256  normal  0.223362 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1779  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  55.27 
 
 		 467 aa  494  9.999999999999999e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189563 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2520  isopropylmalate isomerase large subunit  55.39 
 
 		 478 aa  491  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1906  isopropylmalate isomerase large subunit  54.86 
 
 		 469 aa  488  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276241  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0127  isopropylmalate isomerase large subunit  54.62 
 
 		 466 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.03719 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1416  isopropylmalate isomerase large subunit  55.17 
 
 		 470 aa  491  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.941586  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0127  isopropylmalate isomerase large subunit  54.62 
 
 		 466 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3059  isopropylmalate isomerase large subunit  54.64 
 
 		 469 aa  489  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0122  isopropylmalate isomerase large subunit  54.41 
 
 		 466 aa  488  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.924094  normal  0.160243 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1834  isopropylmalate isomerase large subunit  54.86 
 
 		 469 aa  488  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.538456  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0120  isopropylmalate isomerase large subunit  54.62 
 
 		 466 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0123  isopropylmalate isomerase large subunit  54.41 
 
 		 466 aa  488  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.610682  normal  0.713431 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05886  alpha isopropylmalate isomerase (Eurofung)  53.4 
 
 		 772 aa  487  1e-136  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00198619  normal  0.994666 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1985  isopropylmalate isomerase large subunit  54.43 
 
 		 477 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.682408  normal  0.0241842 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2065  isopropylmalate isomerase large subunit  56.68 
 
 		 470 aa  488  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1516  isopropylmalate isomerase large subunit  54.43 
 
 		 477 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0636  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  54.45 
 
 		 468 aa  485  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0643204 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2723  isopropylmalate isomerase large subunit  55.27 
 
 		 475 aa  487  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00243563  normal  0.0720472 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1343  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  55.29 
 
 		 470 aa  486  1e-136  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.444862 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1889  isopropylmalate isomerase large subunit  54.87 
 
 		 472 aa  486  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.169279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68659  3-isopropylmalate dehydratase  53.38 
 
 		 770 aa  486  1e-136  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4879  isopropylmalate isomerase large subunit  55.91 
 
 		 469 aa  486  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29662  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1548  isopropylmalate isomerase large subunit  54.64 
 
 		 477 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.272021 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0620  isopropylmalate isomerase large subunit  54.19 
 
 		 466 aa  487  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02613  isopropylmalate isomerase large subunit  55.27 
 
 		 482 aa  487  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2129  isopropylmalate isomerase large subunit  56.45 
 
 		 476 aa  488  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3448  isopropylmalate isomerase large subunit  54.6 
 
 		 469 aa  485  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1228  isopropylmalate isomerase large subunit  54.84 
 
 		 469 aa  485  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896395 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0630  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  54.19 
 
 		 466 aa  484  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3463  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  56.33 
 
 		 465 aa  487  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0762821  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3774  isopropylmalate isomerase large subunit  54.43 
 
 		 477 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2173  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  54.56 
 
 		 475 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0764  isopropylmalate isomerase large subunit  54.86 
 
 		 470 aa  482  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.266094 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4355  isopropylmalate isomerase large subunit  55.48 
 
 		 480 aa  482  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1921  isopropylmalate isomerase large subunit  56.1 
 
 		 469 aa  482  1e-135  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.724454  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2103  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  56.24 
 
 		 470 aa  482  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0775087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1170  isopropylmalate isomerase large subunit  54.14 
 
 		 478 aa  484  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.910867  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3550  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  53.55 
 
 		 456 aa  484  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0819  isopropylmalate isomerase large subunit  55.17 
 
 		 470 aa  483  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4757  isopropylmalate isomerase large subunit  55.48 
 
 		 469 aa  482  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0278  isopropylmalate isomerase large subunit  53.51 
 
 		 469 aa  483  1e-135  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4707  isopropylmalate isomerase large subunit  53.62 
 
 		 479 aa  483  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2591  isopropylmalate isomerase large subunit  52.9 
 
 		 471 aa  483  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00933091  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1591  isopropylmalate isomerase large subunit  55.68 
 
 		 473 aa  481  1e-135  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.777227 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0947  isopropylmalate isomerase large subunit  53.66 
 
 		 469 aa  483  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1565  isopropylmalate isomerase large subunit  54.03 
 
 		 472 aa  484  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00074  isopropylmalate isomerase large subunit  53.12 
 
 		 466 aa  481  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3526  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  53.12 
 
 		 466 aa  481  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1549  isopropylmalate isomerase large subunit  54.39 
 
 		 472 aa  480  1e-134  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269438  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4053  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  54.15 
 
 		 474 aa  478  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0079  isopropylmalate isomerase large subunit  53.12 
 
 		 466 aa  481  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1983  isopropylmalate isomerase large subunit  54.24 
 
 		 474 aa  481  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0478435 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0077  isopropylmalate isomerase large subunit  53.12 
 
 		 466 aa  481  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.387894 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3585  isopropylmalate isomerase large subunit  52.9 
 
 		 466 aa  480  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000478946 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0672  isopropylmalate isomerase large subunit  53.1 
 
 		 469 aa  478  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00206744  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1180  isopropylmalate isomerase large subunit  56.06 
 
 		 480 aa  479  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0077  isopropylmalate isomerase large subunit  52.9 
 
 		 466 aa  480  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3586  isopropylmalate isomerase large subunit  53.25 
 
 		 474 aa  479  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4223  isopropylmalate isomerase large subunit  53.78 
 
 		 469 aa  479  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0066  isopropylmalate isomerase large subunit  53.12 
 
 		 466 aa  481  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3797  isopropylmalate isomerase large subunit  53.23 
 
 		 466 aa  479  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00073  hypothetical protein  53.12 
 
 		 466 aa  481  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1149  isopropylmalate isomerase large subunit  55.44 
 
 		 481 aa  480  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000597548 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3759  isopropylmalate isomerase large subunit  53.25 
 
 		 474 aa  479  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.134544 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2453  isopropylmalate isomerase large subunit  53.88 
 
 		 487 aa  477  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.142412  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3407  isopropylmalate isomerase large subunit  53.12 
 
 		 476 aa  476  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>