234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2649 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2649  heme exporter protein CcmC  100 
 
 		 247 aa  494  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00358111  normal  0.0120286 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1001  heme exporter protein CcmC  77.08 
 
 		 244 aa  375  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.114267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1803  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmC  76.35 
 
 		 242 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0461  heme exporter protein CcmC  77.18 
 
 		 242 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.530136  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0449  heme exporter protein CcmC  76.35 
 
 		 244 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1853  heme exporter protein C  74.27 
 
 		 243 aa  365  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.024303  normal  0.648082 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1411  heme exporter protein CcmC  74.16 
 
 		 241 aa  304  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.11561  normal  0.597775 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0320  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  47.44 
 
 		 243 aa  199  3e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0522  heme exporter protein CcmC  46.75 
 
 		 244 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.897478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0366  heme exporter protein CcmC  46.32 
 
 		 244 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0411  heme exporter protein CcmC  45.89 
 
 		 243 aa  195  7e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5342  heme exporter protein CcmC  43.93 
 
 		 265 aa  189  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3651  heme exporter protein CcmC  39.66 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2852  heme exporter protein CcmC  40.09 
 
 		 270 aa  186  4e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2959  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  40 
 
 		 251 aa  185  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3660  heme exporter protein CcmC  42.98 
 
 		 254 aa  185  7e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38552  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1579  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  39.66 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.9226  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1643  heme exporter protein C  42.04 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961001  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0108  heme exporter protein CcmC  42.42 
 
 		 265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3391  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  41.41 
 
 		 267 aa  182  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0094  heme exporter protein CcmC  43.29 
 
 		 262 aa  182  5.0000000000000004e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0096  heme exporter protein CcmC  43.29 
 
 		 261 aa  182  6e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30430  cytochrome c-type biogenesis protein  39.66 
 
 		 250 aa  182  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0229  heme exporter protein CcmC  41.15 
 
 		 248 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162177  unclonable  0.000000000040148 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0229  heme exporter protein CcmC  41.15 
 
 		 248 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0706055  unclonable  0.0000000000357328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0224  heme exporter protein CcmC  41.15 
 
 		 248 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3360  heme exporter protein CcmC  43.72 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.855911  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3022  heme exporter protein CcmC  42.48 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3571  heme exporter protein CcmC  42.92 
 
 		 248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0874951  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0261  heme exporter protein CcmC  41.15 
 
 		 248 aa  179  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3850  heme exporter protein CcmC  39.24 
 
 		 252 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218387  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45350  heme exporter protein CcmC  39.24 
 
 		 252 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0202  heme exporter protein CcmC  48.05 
 
 		 244 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.375034  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2789  heme exporter protein CcmC  40.43 
 
 		 251 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.396306  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0711  heme exporter protein CcmC  43.72 
 
 		 251 aa  178  8e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.704774 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4191  ABC transporter membrane spanning protein (heme)  43.88 
 
 		 260 aa  178  9e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897881  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0379  heme ABC transporter (heme exporter protein C), permease protein (cytochrome c biogenesis)  43.98 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3729  heme exporter protein CcmC  41.15 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0988482  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002843  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  43.36 
 
 		 247 aa  177  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1032  heme exporter protein CcmC  43.23 
 
 		 248 aa  176  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.756263  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03133  hypothetical protein  43.36 
 
 		 247 aa  176  4e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3894  heme exporter protein CcmC  39.66 
 
 		 255 aa  175  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141709  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4325  heme exporter protein CcmC  39.66 
 
 		 255 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.102702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1406  heme exporter protein CcmC  48.2 
 
 		 255 aa  175  6e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2279  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  42.48 
 
 		 250 aa  175  6e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1542  heme exporter protein CcmC  39.66 
 
 		 255 aa  175  7e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4026  heme exporter protein CcmC  40.27 
 
 		 248 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205609  hitchhiker  0.00000231937 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0229  heme exporter protein CcmC  40.27 
 
 		 248 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.052714  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0226  heme exporter protein CcmC  40.27 
 
 		 248 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0392942  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0226  heme exporter protein CcmC  39.82 
 
 		 248 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0290205  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4661  heme exporter protein CcmC  44.05 
 
 		 248 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.727875  hitchhiker  0.000000192901 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0178  heme exporter protein CcmC  44.21 
 
 		 254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0177  heme exporter protein CcmC  43.17 
 
 		 248 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3086  heme exporter protein CcmC  43.16 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0188  heme exporter protein CcmC  43.61 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000216474  hitchhiker  0.00157389 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3633  heme exporter protein CcmC  40 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2935  heme exporter protein CcmC  39.74 
 
 		 269 aa  170  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.405955 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0243  heme exporter protein CcmC  41.15 
 
 		 248 aa  169  5e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00291797  hitchhiker  0.000734181 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03072  heme exporter protein C  40.35 
 
 		 260 aa  168  7e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3254  heme exporter protein CcmC  39.91 
 
 		 248 aa  168  7e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2642  heme exporter protein CcmC  42.92 
 
 		 268 aa  168  7e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2612  heme exporter protein CcmC  43.28 
 
 		 268 aa  167  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.342181 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02126  heme exporter subunit  42.15 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1460  heme exporter protein CcmC  42.15 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02085  hypothetical protein  42.15 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.903399  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1451  heme exporter protein CcmC  42.15 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2498  heme exporter protein C  42.15 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3336  heme exporter protein C  42.15 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2835  heme exporter protein CcmC  42.79 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2347  heme exporter protein C  42.15 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.700588 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0742  heme exporter protein C  42.15 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.248881  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1286  heme exporter protein CcmC  40.95 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2337  heme exporter protein C  42.15 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  41.99 
 
 		 239 aa  166  4e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.56272  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3389  heme exporter protein CcmC  39.21 
 
 		 245 aa  165  5e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4130  heme exporter protein CcmC  43.97 
 
 		 243 aa  165  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.237334 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0207  heme exporter protein CcmC  45.45 
 
 		 250 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0307586 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0946  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  40.89 
 
 		 250 aa  164  8e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3741  heme exporter protein CcmC  41.28 
 
 		 253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4064  heme exporter protein CcmC  41.56 
 
 		 253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.890751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2422  heme exporter protein CcmC  37.9 
 
 		 246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2726  heme exporter protein CcmC  38.53 
 
 		 246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0395  heme ABC transporter, permease (heme exporter protein C)  40.26 
 
 		 243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.536077  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1498  heme exporter protein CcmC  38.12 
 
 		 245 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.743155  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0393  heme exporter protein CcmC  38.12 
 
 		 245 aa  160  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.341263 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1389  heme exporter protein CcmC  38.12 
 
 		 245 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2436  ABC superfamily  39.22 
 
 		 248 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.236791  normal  0.749794 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4100  ABC superfamily  39.22 
 
 		 248 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1212  heme exporter protein CcmC  39.33 
 
 		 246 aa  159  5e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4207  ABC family protein  38.79 
 
 		 248 aa  158  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.51668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2595  ABC family protein  38.79 
 
 		 248 aa  158  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.402873 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2478  ABC superfamily  38.79 
 
 		 248 aa  158  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4028  ABC superfamily  38.79 
 
 		 248 aa  158  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3505  heme exporter protein CcmC  41.26 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0026692 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4149  ABC superfamily  38.79 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2492  ABC superfamily  38.79 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0102012 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4045  ABC superfamily  38.79 
 
 		 248 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4058  cytochrome c heme exporter protein  40.44 
 
 		 259 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2387  heme exporter protein C  38.79 
 
 		 248 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2858  heme exporter protein CcmC  39.92 
 
 		 249 aa  156  4e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.295334 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>