More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2509 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2509  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  657    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126674  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  40.56 
 
 
320 aa  181  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  31.61 
 
 
311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  35.2 
 
 
281 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  30.82 
 
 
295 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.17 
 
 
314 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.52 
 
 
313 aa  119  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  28.03 
 
 
331 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  29.62 
 
 
315 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  30.82 
 
 
288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  30.87 
 
 
324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  33.54 
 
 
318 aa  113  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  33.23 
 
 
318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0156  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.9 
 
 
301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310951  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  29.04 
 
 
292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1004  putative transmembrane protein  31.41 
 
 
301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.583779  hitchhiker  0.00109211 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  33.03 
 
 
313 aa  110  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  28.79 
 
 
310 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  29.91 
 
 
317 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  33.97 
 
 
314 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  28.44 
 
 
306 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  28.84 
 
 
319 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1711  RhaT family protein  28.99 
 
 
308 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466454  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  29.65 
 
 
317 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  28.62 
 
 
317 aa  106  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  30.92 
 
 
331 aa  106  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  28.53 
 
 
292 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0341  hypothetical protein  29.41 
 
 
308 aa  106  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.514286 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0355  hypothetical protein  29.41 
 
 
308 aa  106  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  27.69 
 
 
317 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3465  hypothetical protein  30.56 
 
 
305 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.354024  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28664  DMT family transporter: drug/metabolite  29.72 
 
 
309 aa  104  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  28.76 
 
 
285 aa  103  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0858  RhaT family transporter  28.81 
 
 
317 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  27.94 
 
 
307 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2517  hypothetical protein  28.81 
 
 
317 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2540  hypothetical protein  30.82 
 
 
308 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  31.56 
 
 
317 aa  101  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  27.27 
 
 
299 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.97 
 
 
325 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  28.97 
 
 
292 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  28.53 
 
 
301 aa  100  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  27.54 
 
 
289 aa  98.6  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0035  hypothetical protein  30.86 
 
 
284 aa  97.4  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  31.1 
 
 
304 aa  97.4  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  29.28 
 
 
302 aa  96.7  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2291  hypothetical protein  30.91 
 
 
313 aa  96.7  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695659  normal  0.288428 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.07 
 
 
298 aa  95.9  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  30.87 
 
 
285 aa  95.5  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  27.39 
 
 
292 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3870  hypothetical protein  31.29 
 
 
309 aa  95.1  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.320842 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.59 
 
 
318 aa  93.6  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  28.57 
 
 
313 aa  93.6  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0229  hypothetical protein  27.82 
 
 
298 aa  92.8  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  28.97 
 
 
294 aa  92.8  7e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1965  hypothetical protein  30.94 
 
 
324 aa  92.8  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124551  normal  0.159447 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  28.03 
 
 
342 aa  92.8  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2883  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.04 
 
 
318 aa  92.4  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750898  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4941  hypothetical protein  28.53 
 
 
327 aa  92  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2148  putative S-adenosylmethionine uptake transporter  30.23 
 
 
296 aa  91.7  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.820998 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0424  DMT family permease  28.43 
 
 
305 aa  92  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  26.93 
 
 
318 aa  92  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0929  hypothetical protein  30.29 
 
 
297 aa  92  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0374563 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.08 
 
 
305 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1093  integral membrane protein  27.94 
 
 
294 aa  91.3  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.536997  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  27.21 
 
 
292 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  30.32 
 
 
307 aa  90.5  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  26.97 
 
 
309 aa  90.9  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  27.01 
 
 
309 aa  90.5  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0250  hypothetical protein  26.06 
 
 
304 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  29.19 
 
 
317 aa  90.1  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  25.95 
 
 
291 aa  90.5  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0373  hypothetical protein  28.16 
 
 
295 aa  90.1  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.91 
 
 
305 aa  90.1  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1083  integral membrane domain-containing protein  26.62 
 
 
290 aa  90.1  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.739829  normal  0.417186 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  28.35 
 
 
297 aa  90.1  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  29.84 
 
 
294 aa  89.7  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  29.84 
 
 
294 aa  89.7  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  27.21 
 
 
292 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0573  hypothetical protein  28.01 
 
 
288 aa  89.4  8e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  28.35 
 
 
309 aa  89.4  9e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3275  hypothetical protein  26.3 
 
 
301 aa  88.6  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.83 
 
 
295 aa  88.6  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0758833  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0931  hypothetical protein  29.62 
 
 
294 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  28.75 
 
 
307 aa  89  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4970  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.89 
 
 
333 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  27.21 
 
 
311 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0237  hypothetical protein  30.17 
 
 
279 aa  88.2  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.52 
 
 
307 aa  86.3  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3194  hypothetical protein  30.94 
 
 
310 aa  86.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0080  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.9 
 
 
328 aa  86.7  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.109193 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38160  hypothetical protein  27.45 
 
 
288 aa  86.3  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.863568  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1857  hypothetical protein  29.7 
 
 
300 aa  86.3  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0328691  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  27.68 
 
 
300 aa  85.5  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04178  drug/metabolite transporter superfamily protein  26.2 
 
 
291 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  27.27 
 
 
312 aa  84.7  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1160  hypothetical protein  30.74 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.565662  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2492  RhaT family protein  30.74 
 
 
294 aa  84  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.738577  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.81 
 
 
312 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0751  hypothetical protein  29.26 
 
 
313 aa  83.6  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.27541 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>