More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1403 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1403  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  100 
 
 
368 aa  739    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00336342 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3045  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  44.48 
 
 
374 aa  296  4e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6162  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.1 
 
 
357 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.427854 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3912  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  42.33 
 
 
401 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0136  S-mandelate dehydrogenase (MdlB)  40.17 
 
 
394 aa  260  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3706  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.33 
 
 
409 aa  245  6.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.267728  normal  0.192703 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03020  alpha-hydroxyacid dehydrogenase, FMN-dependent L-lactate dehydrogenase  37.36 
 
 
409 aa  241  1e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6258  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  40 
 
 
390 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3143  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  35.57 
 
 
380 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.325182  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2875  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  35.81 
 
 
380 aa  238  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.189587  normal  0.0992837 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6402  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.13 
 
 
402 aa  238  9e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1041  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.5 
 
 
458 aa  238  1e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1020  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  41.85 
 
 
372 aa  238  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168014  normal  0.586617 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3174  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.67 
 
 
399 aa  237  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.898854  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0758  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.01 
 
 
417 aa  236  4e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.693198  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1661  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.79 
 
 
415 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.448458  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3293  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.5 
 
 
403 aa  236  6e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0836045  hitchhiker  0.00293755 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12000  alpha-hydroxyacid dehydrogenase, FMN-dependent L-lactate dehydrogenase  38.31 
 
 
418 aa  235  8e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1384  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.59 
 
 
411 aa  235  9e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0607996  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0228  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  37.67 
 
 
439 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11900  L-lactate dehydrogenase (cytochrome) lldD2  39.5 
 
 
414 aa  233  3e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.877385 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2484  cytochrome containing L-lactate dehydrogenase  39.52 
 
 
389 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6013  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  35.91 
 
 
397 aa  232  9e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0169115 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2778  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  38.48 
 
 
384 aa  231  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.985117 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2026  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.45 
 
 
389 aa  231  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7084  dehydrogenase  38.08 
 
 
392 aa  230  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5297  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.62 
 
 
422 aa  230  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4115  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.6 
 
 
379 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.105278  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2083  FMN-dependent dehydrogenase  34.7 
 
 
381 aa  227  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.443709  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0762  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.18 
 
 
400 aa  228  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.109477  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3410  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.89 
 
 
435 aa  226  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.194367  hitchhiker  0.0000661899 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0280  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  38.37 
 
 
410 aa  225  7e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3343  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.6 
 
 
417 aa  225  9e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.326898  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2622  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  39.11 
 
 
398 aa  225  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.737171  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33860  L-lactate dehydrogenase  34.23 
 
 
383 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.14557 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2879  L-lactate dehydrogenase  34.23 
 
 
383 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6648  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  34.07 
 
 
391 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0123873 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5045  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  40.98 
 
 
394 aa  223  4e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1448  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  33.61 
 
 
381 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1565  FMN-dependent family dehydrogenase  39.11 
 
 
407 aa  222  8e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0604  putative L(+)-mandelate dehydrogenase  39.11 
 
 
441 aa  222  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0717  FMN-dependent family dehydrogenase  39.11 
 
 
447 aa  222  8e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2112  FMN-dependent family dehydrogenase  39.11 
 
 
447 aa  222  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2038  FMN-dependent family dehydrogenase  39.11 
 
 
441 aa  222  9e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2199  FMN-dependent family dehydrogenase  39.11 
 
 
441 aa  222  9e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258331  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1654  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.8 
 
 
402 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7392  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  34.63 
 
 
405 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0187555  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5062  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.43 
 
 
385 aa  221  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.926259  normal  0.580751 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1816  putative L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.35 
 
 
378 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1384  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.3 
 
 
411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5475  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.91 
 
 
396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0813  FMN-dependent family dehydrogenase  38.61 
 
 
407 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.407969  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4132  L-lactate dehydrogenase  35.48 
 
 
386 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2436  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  35.47 
 
 
427 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.689603  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0920  L-lactate dehydrogenase  32.7 
 
 
381 aa  219  6e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451732  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0219  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.35 
 
 
387 aa  219  6e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0862  L-lactate dehydrogenase  32.7 
 
 
381 aa  219  6e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.27299  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1682  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  33.15 
 
 
403 aa  219  7e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000210752  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4230  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.73 
 
 
389 aa  218  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4493  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.6 
 
 
378 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.14596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4852  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  36.11 
 
 
440 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00125514  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1305  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.33 
 
 
379 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2651  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.7 
 
 
390 aa  218  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1889  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.26 
 
 
402 aa  218  2e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0450886 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4469  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.29 
 
 
395 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0508385 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1708  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.57 
 
 
395 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80121  normal  0.602463 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5798  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.68 
 
 
415 aa  216  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.100702 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3298  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  32.43 
 
 
390 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.355781  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3154  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.26 
 
 
381 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3141  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.42 
 
 
410 aa  216  4e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.4786 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5754  L-lactate dehydrogenase  33.43 
 
 
386 aa  216  5.9999999999999996e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.202266  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4800  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.7 
 
 
379 aa  216  7e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700364  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4075  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.98 
 
 
387 aa  216  7e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.72179  normal  0.076317 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4413  L-lactate dehydrogenase  35.48 
 
 
386 aa  215  8e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1959  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.97 
 
 
386 aa  215  9e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.548069  normal  0.0478 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3845  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  34.97 
 
 
397 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0404  L-lactate dehydrogenase  36.02 
 
 
392 aa  215  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3859  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.81 
 
 
390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3368  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.88 
 
 
406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000428393  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1371  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.22 
 
 
381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.75122  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0908  L-lactate dehydrogenase  33.87 
 
 
380 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5795  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  32.15 
 
 
383 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.821423 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3929  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  35.42 
 
 
388 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0176319  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0789  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  35.79 
 
 
431 aa  213  4.9999999999999996e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4638  L-lactate dehydrogenase  37.57 
 
 
384 aa  212  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.76191  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1112  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.61 
 
 
381 aa  211  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5491  L-lactate dehydrogenase  35.83 
 
 
381 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316989  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3678  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.06 
 
 
383 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0259066  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3916  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.55 
 
 
379 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3635  L-lactate dehydrogenase  35.66 
 
 
379 aa  210  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63090  L-lactate dehydrogenase  35.83 
 
 
381 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0242094  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1331  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.79 
 
 
385 aa  209  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1075  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  33.7 
 
 
399 aa  208  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3942  L-lactate dehydrogenase  33.6 
 
 
396 aa  207  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3817  L-lactate dehydrogenase  33.6 
 
 
396 aa  207  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03463  L-lactate dehydrogenase, FMN-linked  33.6 
 
 
396 aa  207  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0100  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  33.6 
 
 
396 aa  207  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4031  L-lactate dehydrogenase  33.6 
 
 
396 aa  207  3e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4978  L-lactate dehydrogenase  33.6 
 
 
396 aa  207  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4109  L-lactate dehydrogenase  33.6 
 
 
396 aa  207  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>