More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2097 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2097  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 
164 aa  328  3e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0862483  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0395  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.06 
 
 
151 aa  104  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30482  hitchhiker  0.000338676 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4033  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.1 
 
 
158 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439813  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4176  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.48 
 
 
158 aa  95.5  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0919098  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4149  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.97 
 
 
159 aa  94  8e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0136307  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2392  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.49 
 
 
133 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.791616 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  32.65 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  32.45 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.11 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2977  TolR protein  34.27 
 
 
144 aa  72  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
140 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0330  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.93 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175992  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2118  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.65 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5877  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2200  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5529  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.97 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1114  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.39 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.809728  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1370  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.97 
 
 
140 aa  67  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  29.52 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2091  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.57 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0833564  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0281  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.34 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149561  hitchhiker  0.000106063 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.94 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  31.51 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0219  putative transport-related membrane protein  31.68 
 
 
145 aa  63.5  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.748949  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5307  biopolymer transport protein ExbD  26.97 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.153689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5216  biopolymer transport protein ExbD  26.97 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2024  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.62 
 
 
155 aa  62  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.34025 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2305  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32 
 
 
134 aa  61.6  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3630  biopolymer ExbD/TolR family transporter  28.97 
 
 
146 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.7 
 
 
155 aa  61.6  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0861  protein TolR  29.86 
 
 
152 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000417761  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5355  biopolymer transport protein ExbD  26.97 
 
 
142 aa  62  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610359  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0564  protein TolR  30.61 
 
 
150 aa  61.6  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.434395  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  28.99 
 
 
147 aa  61.6  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.53 
 
 
147 aa  61.6  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.8 
 
 
139 aa  61.2  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2026  biopolymer ExbD/TolR family transporter  30.72 
 
 
142 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.597145  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0234  TonB system transport protein ExbD  29.66 
 
 
177 aa  60.5  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0166  biopolymer transport protein ExbD  26.32 
 
 
142 aa  60.8  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0981914 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1803  biopolymer ExbD/TolR family transporter  30.07 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.831218  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.07 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1930  biopolymer ExbD/TolR family transporter  30.07 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0617  ExbD/TolR family transport energizing protein  30.07 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2064  ExbD/TolR family transport energizing protein  30.07 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132783  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0800  ExbD/TolR family transport energizing protein  30.07 
 
 
140 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0684  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.34 
 
 
154 aa  60.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.508331  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1092  ExbD/TolR family transport energizing protein  30.07 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.19 
 
 
137 aa  60.5  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0536  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.19 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000196939  hitchhiker  0.000000905807 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2418  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.57 
 
 
144 aa  60.1  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2529  biopolymer transport EXBD-like transmembrane protein  35.37 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.161438  normal  0.0831127 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2674  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.28 
 
 
140 aa  59.3  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3007  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.72 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.17 
 
 
149 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  28.57 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0520  ExbD/TolR family transport energizing protein  29.66 
 
 
142 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2806  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.65 
 
 
142 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.0047121  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0612  ExbD/TolR family protein  26.03 
 
 
143 aa  58.9  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  26.35 
 
 
138 aa  58.9  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3239  tolR protein  30.92 
 
 
148 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1400  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.29 
 
 
130 aa  58.5  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.377979  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1015  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.58 
 
 
150 aa  58.5  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  31.51 
 
 
146 aa  58.2  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1509  biopolymer transport exbD-related transmembrane protein  32.87 
 
 
138 aa  58.2  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.171101  normal  0.278773 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0661  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.03 
 
 
150 aa  58.2  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602006  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0696  protein TolR  28.03 
 
 
150 aa  58.2  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1947  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.07 
 
 
139 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81805  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1698  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.17 
 
 
250 aa  58.2  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2987  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.46 
 
 
133 aa  58.2  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.369399  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0695  protein TolR  28.03 
 
 
150 aa  58.2  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0705  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.47 
 
 
152 aa  58.2  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105618  normal  0.350278 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0358  biopolymer ExbD/TolR family transporter  27.52 
 
 
135 aa  57.8  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0309097 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2363  protein TolR  27.08 
 
 
139 aa  57.8  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372464 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0105  TonB system transport protein ExbD, putative  27.34 
 
 
129 aa  57.8  0.00000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.664696  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0594  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.82 
 
 
143 aa  57.8  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395657  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0145  TonB system transport protein ExbD, putative  27.34 
 
 
129 aa  57.8  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000057869  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4892  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.56 
 
 
144 aa  57.8  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.310639 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0840  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.56 
 
 
137 aa  57.8  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0352738 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1522  ExbDTolR family transport protein  28.37 
 
 
130 aa  57.4  0.00000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1255  TonB system transport protein ExbD type-1  28.21 
 
 
169 aa  57.4  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.51439  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0745  protein TolR  27.78 
 
 
140 aa  57.4  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000786072  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3142  biopolymer transport transmembrane protein, ExbD/TolR like  28.28 
 
 
139 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421775  normal  0.0460891 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3216  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.69 
 
 
141 aa  57.4  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300081  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1667  TonB system transport protein ExbD  28.85 
 
 
164 aa  57  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0711  putative biopolymer transport protein  28.22 
 
 
140 aa  57  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0310861 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1805  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.83 
 
 
137 aa  57.4  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.06 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529067  hitchhiker  0.000695312 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0937  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.67 
 
 
145 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0857  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.49 
 
 
139 aa  57  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.345374  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0117  TonB system transport protein ExbD, putative  26.62 
 
 
129 aa  57.4  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000384782  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2229  inner membrane protein  28.12 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243191  normal  0.205918 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1613  TonB system transport protein ExbD  28.85 
 
 
164 aa  57  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  29.09 
 
 
153 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02811  Biopolymer transport protein  26.24 
 
 
132 aa  56.2  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0477065  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3209  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.03 
 
 
137 aa  56.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537129  normal  0.265512 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2145  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.78 
 
 
167 aa  56.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4003  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.17 
 
 
145 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0748  protein TolR  25.85 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.031429  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1109  biopolymer transport TolR  28.97 
 
 
134 aa  56.6  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00176605  normal  0.311844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>