More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1364 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
441 aa  871    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  30.96 
 
 
420 aa  127  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  28.81 
 
 
420 aa  124  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 
430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  23.9 
 
 
405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  23.9 
 
 
405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  23.66 
 
 
404 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  23.41 
 
 
406 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  29.89 
 
 
414 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  27.89 
 
 
431 aa  107  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  22.71 
 
 
406 aa  106  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  30.17 
 
 
435 aa  105  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  23.17 
 
 
406 aa  103  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  23.17 
 
 
406 aa  103  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  22.93 
 
 
406 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2072  major facilitator transporter  31.27 
 
 
417 aa  100  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  30.47 
 
 
461 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  28.81 
 
 
417 aa  100  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2984  putative permease  22.93 
 
 
404 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000116191 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  23.6 
 
 
406 aa  100  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  28.04 
 
 
420 aa  97.4  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1932  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 
406 aa  97.4  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 
426 aa  96.7  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  28.65 
 
 
408 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  26.53 
 
 
428 aa  94.4  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  29.6 
 
 
427 aa  93.6  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  24.4 
 
 
439 aa  92  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  28.13 
 
 
412 aa  90.9  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  25.54 
 
 
408 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  25.68 
 
 
417 aa  89  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  22.61 
 
 
410 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  27.04 
 
 
420 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  23.56 
 
 
426 aa  88.6  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  26.6 
 
 
420 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  25.76 
 
 
420 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  25.93 
 
 
414 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  25.63 
 
 
420 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  26.6 
 
 
420 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  26.35 
 
 
420 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  27.64 
 
 
432 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  26.35 
 
 
420 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  25.48 
 
 
438 aa  85.5  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 
441 aa  85.5  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  25.18 
 
 
408 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 
415 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  24.82 
 
 
408 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  25.68 
 
 
414 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6079  hypothetical protein  26.48 
 
 
420 aa  84.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.533874  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  25.18 
 
 
408 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 
463 aa  84  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
433 aa  83.6  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  24.82 
 
 
408 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  24.46 
 
 
408 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6800  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 
437 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  25.77 
 
 
436 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  26.8 
 
 
420 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1942  multidrug resistance protein; putative tetracycline resistance determinant  24.07 
 
 
406 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0213e-35 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0174  putative transporter  26.56 
 
 
415 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  25.55 
 
 
424 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  24.64 
 
 
408 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  23.51 
 
 
404 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2289  major facilitator transporter  34.54 
 
 
432 aa  80.1  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.995339  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4496  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 
450 aa  80.1  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239349  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1748  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  23.81 
 
 
406 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000069396  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5073  putative transporter  26.1 
 
 
415 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  25.93 
 
 
418 aa  79.7  0.00000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4800  transporter  26.33 
 
 
415 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5040  putative transporter  26.33 
 
 
415 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4642  transporter  26.33 
 
 
415 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4661  transporter  26.33 
 
 
415 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5163  transporter  26.33 
 
 
415 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4461  H+ antiporter protein  27.78 
 
 
414 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 
432 aa  79  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  24.55 
 
 
404 aa  79  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  28.61 
 
 
424 aa  79  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5069  putative transporter  25.92 
 
 
415 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  23.73 
 
 
413 aa  77.8  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  23.73 
 
 
413 aa  77.8  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  25.06 
 
 
411 aa  78.2  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  24.43 
 
 
404 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  26.68 
 
 
426 aa  77.8  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3353  major facilitator transporter  22.79 
 
 
421 aa  77.8  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  24.43 
 
 
404 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  24.43 
 
 
404 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  21.7 
 
 
422 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4750  major facilitator transporter  25.87 
 
 
415 aa  77  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 
417 aa  77  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  23.96 
 
 
444 aa  77  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2989  putative permease  21.15 
 
 
362 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 
414 aa  76.6  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  22.48 
 
 
436 aa  76.6  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  22.58 
 
 
1833 aa  76.6  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5360  major facilitator superfamily MFS_1  25.31 
 
 
430 aa  76.6  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.261806  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1693  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 
422 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00531073  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 
433 aa  76.3  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 
416 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  29.26 
 
 
431 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1498  enterobactin exporter EntS  25.7 
 
 
432 aa  75.1  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.201643  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1471  major facilitator transporter  27.84 
 
 
420 aa  75.5  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.981301  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  22.33 
 
 
432 aa  75.1  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>