More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1478 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 254 aa  493  9.999999999999999e-139  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  41.02 
 
 		 256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  44.34 
 
 		 261 aa  202  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  37.56 
 
 		 252 aa  167  1e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.86 
 
 		 254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  36.65 
 
 		 260 aa  146  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  30.56 
 
 		 261 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  33.61 
 
 		 249 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  34.68 
 
 		 253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.51 
 
 		 249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  27.5 
 
 		 251 aa  126  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.51 
 
 		 249 aa  125  5e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.74 
 
 		 253 aa  123  3e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  33.73 
 
 		 253 aa  122  4e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.16 
 
 		 255 aa  122  4e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  31.17 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.83 
 
 		 249 aa  119  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  29.33 
 
 		 289 aa  119  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  27.39 
 
 		 251 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  31.11 
 
 		 270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  33.82 
 
 		 242 aa  118  9e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  31.51 
 
 		 249 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  32.93 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  29.72 
 
 		 259 aa  115  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  28.97 
 
 		 288 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.84 
 
 		 264 aa  115  7.999999999999999e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1125  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.88 
 
 		 260 aa  115  7.999999999999999e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.742933  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  29.03 
 
 		 289 aa  115  8.999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  31.65 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  31.34 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  32.85 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  32.85 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  27.46 
 
 		 256 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  27.03 
 
 		 284 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  28.79 
 
 		 290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  30.66 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0242  ABC-2 type transporter  31.34 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  30.2 
 
 		 250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  30.62 
 
 		 241 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0685  ABC transporter, permease protein  33.48 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.537478  normal  0.14182 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  30.73 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  27.69 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  30.73 
 
 		 256 aa  102  4e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0427  ABC-2 type transporter  26.04 
 
 		 278 aa  102  6e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.469533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0176  hypothetical protein  29.27 
 
 		 241 aa  102  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67071  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2794  hypothetical protein  28.19 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  26.64 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  26.45 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2515  ABC transporter, permease protein  30.84 
 
 		 278 aa  99.8  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1750  putative multidrug efflux ABC transporter  29.63 
 
 		 277 aa  95.5  8e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0190039  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0010  ABC-2 type transporter  27.06 
 
 		 280 aa  94.7  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  29.9 
 
 		 284 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  27.16 
 
 		 270 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04481  putative multidrug efflux ABC transporter  31.13 
 
 		 284 aa  92.8  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.86864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  25.21 
 
 		 304 aa  92.4  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0449  putative multidrug efflux ABC transporter  28.64 
 
 		 274 aa  92.4  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.603097  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0287  hypothetical protein  30.2 
 
 		 241 aa  92  8e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.301015  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05121  putative multidrug efflux ABC transporter  28.99 
 
 		 274 aa  92  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2221  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  25.63 
 
 		 273 aa  91.3  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000454003  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2261  ABC-2 type transporter  26.96 
 
 		 260 aa  91.3  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0251  ABC-2 type transporter  28.84 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.452318 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2893  ABC-2 type transporter  23.61 
 
 		 270 aa  91.3  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1079  ABC-2 type transporter  30.74 
 
 		 296 aa  90.5  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04741  putative multidrug efflux ABC transporter  28.23 
 
 		 274 aa  90.9  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  27.96 
 
 		 286 aa  89.7  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6126  ABC-2 type transporter  27.09 
 
 		 275 aa  89.7  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0365687  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0025  ABC-2 type transporter  26.61 
 
 		 290 aa  89.7  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3931  ABC-2 type transporter  26.61 
 
 		 263 aa  89.4  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0612  putative multidrug efflux ABC transporter  30.09 
 
 		 284 aa  89  6e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1796  ABC-2 type transporter  24.8 
 
 		 280 aa  89.4  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000116393 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1034  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 		 256 aa  88.6  8e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.150436 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4873  ABC-2 type transporter  28.16 
 
 		 298 aa  88.6  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 254 aa  88.6  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05051  putative multidrug efflux ABC transporter  28.36 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.507008  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3137  ABC-2 type transporter  27.93 
 
 		 277 aa  87.4  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.428202  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2186  ABC-2 type transporter  25.22 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2588  ABC-2 type transporter  27.4 
 
 		 298 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0192  hypothetical protein  28.5 
 
 		 295 aa  87.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3861  ABC-2 type transporter  27.4 
 
 		 291 aa  87.4  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.92497  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1851  ABC-2 type transporter  25.22 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.894723 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1802  ABC-2 type transporter  24.78 
 
 		 293 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.454939 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2013  ABC-2 type transporter  28.05 
 
 		 256 aa  87.8  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000119274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3518  ABC-2 type transporter  27.4 
 
 		 298 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2613  ABC-2 type transporter  25.82 
 
 		 270 aa  86.7  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.937981  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5948  ABC transporter permease  25.46 
 
 		 284 aa  87  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0673459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3547  ABC-2 type transporter  28 
 
 		 259 aa  86.3  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  27.98 
 
 		 282 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  27.98 
 
 		 282 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  27.98 
 
 		 282 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1861  ABC-2 type transporter  24 
 
 		 258 aa  85.9  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1894  putative daunorubicin resistance ABC transporter, permease protein  26.82 
 
 		 260 aa  85.5  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0249  hypothetical protein  25.23 
 
 		 281 aa  85.1  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  27.53 
 
 		 284 aa  85.1  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1936  ABC-2 type transporter  24.43 
 
 		 286 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0723  ABC-2 type transporter  22.09 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0756908 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1281  ABC transporter, permease protein  25.86 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.640698  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5312  ABC-2 type transporter  25.57 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.91396  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5008  ABC-2 type transporter  25.69 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0701746  normal  0.113041 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  25.68 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2668  putative ABC-2 type transporter  25.85 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.149875  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>