More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1356 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1356  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 246 aa  501  1e-141  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.688667  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1153  triosephosphate isomerase  52.87 
 
 		 250 aa  262  4e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  54.25 
 
 		 655 aa  245  4.9999999999999997e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  47.35 
 
 		 252 aa  244  8e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  47.77 
 
 		 253 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  50.61 
 
 		 249 aa  241  6e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  46.15 
 
 		 251 aa  237  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  45.75 
 
 		 251 aa  235  4e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  45.75 
 
 		 251 aa  235  4e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  45.75 
 
 		 251 aa  234  6e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  45.75 
 
 		 251 aa  234  6e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  45.75 
 
 		 251 aa  234  6e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  46.61 
 
 		 256 aa  234  8e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  45.75 
 
 		 251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  45.75 
 
 		 251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  45.34 
 
 		 251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  46.75 
 
 		 248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  45.75 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  47.97 
 
 		 253 aa  232  4.0000000000000004e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  45.34 
 
 		 251 aa  232  5e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  45.49 
 
 		 254 aa  229  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  49.36 
 
 		 243 aa  229  4e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  47.97 
 
 		 650 aa  227  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  46.72 
 
 		 254 aa  227  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  48.51 
 
 		 243 aa  226  2e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  42.91 
 
 		 253 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  45.16 
 
 		 250 aa  227  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  48.54 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  45.9 
 
 		 254 aa  226  3e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  45.34 
 
 		 249 aa  224  9e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  43.55 
 
 		 253 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  43.03 
 
 		 251 aa  223  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1264  Triose-phosphate isomerase  48.29 
 
 		 240 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  44.4 
 
 		 250 aa  222  4.9999999999999996e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  41.63 
 
 		 250 aa  221  6e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  44 
 
 		 251 aa  221  6e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  43.09 
 
 		 250 aa  221  7e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  43.72 
 
 		 253 aa  221  8e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  44.08 
 
 		 249 aa  221  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  43.95 
 
 		 250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1989  triosephosphate isomerase  45.2 
 
 		 250 aa  217  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  41.22 
 
 		 251 aa  217  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  45.6 
 
 		 251 aa  218  1e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  44.13 
 
 		 251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  43.44 
 
 		 251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  40.65 
 
 		 257 aa  215  7e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  44.18 
 
 		 252 aa  214  9e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  44.94 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2335  triosephosphate isomerase  42.91 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1023  Triose-phosphate isomerase  44.76 
 
 		 249 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00613564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  43.72 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  42.91 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1176  Triose-phosphate isomerase  44.92 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.46526  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0348  Triose-phosphate isomerase  45.42 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0212974 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1549  triosephosphate isomerase  43.37 
 
 		 252 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.42091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  43.09 
 
 		 251 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  45.71 
 
 		 251 aa  211  7e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1261  triosephosphate isomerase  42.56 
 
 		 263 aa  211  9e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.40678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0891  triosephosphate isomerase  45.1 
 
 		 274 aa  210  1e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.427373  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  45.08 
 
 		 248 aa  211  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  45.08 
 
 		 248 aa  211  1e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  42.86 
 
 		 250 aa  209  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  40.57 
 
 		 251 aa  209  4e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  42.68 
 
 		 251 aa  209  4e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  43.15 
 
 		 253 aa  208  5e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  43.15 
 
 		 253 aa  208  5e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0274  Triose-phosphate isomerase  42.51 
 
 		 265 aa  208  5e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3504  triosephosphate isomerase  42.91 
 
 		 250 aa  208  6e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.449389  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0672  triosephosphate isomerase  45.68 
 
 		 253 aa  207  2e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.649878  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  42.86 
 
 		 249 aa  206  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  41.56 
 
 		 252 aa  206  3e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  42.11 
 
 		 250 aa  206  3e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0880  triosephosphate isomerase  43.43 
 
 		 251 aa  206  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1306  triosephosphate isomerase  42.62 
 
 		 251 aa  205  5e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1410  Triose-phosphate isomerase  43.82 
 
 		 251 aa  205  5e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1236  triosephosphate isomerase  47.56 
 
 		 250 aa  205  6e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000124491  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0738  Triose-phosphate isomerase  46.81 
 
 		 243 aa  204  9e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000147069  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  43.9 
 
 		 252 aa  204  9e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  44.4 
 
 		 254 aa  204  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06900  Triosephosphate isomerase (TIM)(EC 5.3.1.1)(Triose-phosphate isomerase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P04828]  44.76 
 
 		 249 aa  203  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.762723 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2707  triosephosphate isomerase  43.44 
 
 		 249 aa  203  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  40.8 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0497  triosephosphate isomerase  41.7 
 
 		 252 aa  202  3e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  40.82 
 
 		 257 aa  202  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2003  triosephosphate isomerase  40.16 
 
 		 256 aa  202  4e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0534929  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  42.15 
 
 		 654 aa  202  5e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1779  triosephosphate isomerase  41.3 
 
 		 251 aa  202  5e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.906694  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2838  triosephosphate isomerase  44.13 
 
 		 249 aa  202  6e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0604  triosephosphate isomerase  42.39 
 
 		 270 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.783409  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10411  triosephosphate isomerase  43.67 
 
 		 241 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  41.3 
 
 		 252 aa  201  9.999999999999999e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_649  triose-phosphate isomerase  43.85 
 
 		 251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10411  triosephosphate isomerase  44.08 
 
 		 241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  40.64 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl504  triosephosphate isomerase  44 
 
 		 275 aa  199  3e-50  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2199  triosephosphate isomerase  43.44 
 
 		 250 aa  199  3.9999999999999996e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468925  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  41.53 
 
 		 246 aa  199  5e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  43.09 
 
 		 252 aa  198  6e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0693  triosephosphate isomerase  44.44 
 
 		 257 aa  198  7e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.444699  unclonable  0.0000000042345 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2833  triosephosphate isomerase  43.67 
 
 		 251 aa  197  9e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.091999  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>