58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0533 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0533  phage DNA primase-like protein  100 
 
 		 636 aa  1310    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0606801  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0622  P4 family phage/plasmid primase  32.29 
 
 		 477 aa  231  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.77951  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0946  D5 family nucleoside triphosphatase  27.33 
 
 		 605 aa  228  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  31.18 
 
 		 775 aa  219  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  30.37 
 
 		 775 aa  219  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  32.75 
 
 		 777 aa  211  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273638 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  31.8 
 
 		 777 aa  211  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.382888 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  31.87 
 
 		 777 aa  211  4e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  31.55 
 
 		 776 aa  206  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  31.07 
 
 		 777 aa  204  6e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  31.31 
 
 		 777 aa  203  8e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  31.31 
 
 		 777 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0890  D5 family nucleoside triphosphatase  30.18 
 
 		 763 aa  198  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3860  D5 family nucleoside triphosphatase  29.35 
 
 		 763 aa  194  4e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.503803  normal  0.0447982 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2662  Phage/plasmid primase P4-like protein  29.93 
 
 		 632 aa  97.4  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5628  P4 family phage/plasmid primase  29.65 
 
 		 1145 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000865428 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4492  phage/plasmid primase, P4 family  28.53 
 
 		 1172 aa  94.7  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4533  P4 family phage/plasmid primase  29.25 
 
 		 1172 aa  94.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1052  plasmid/phage primase  26.49 
 
 		 828 aa  93.2  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0990831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1734  P4 family phage/plasmid primase  27.96 
 
 		 624 aa  83.6  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5581  primase P4  25.65 
 
 		 1000 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  24.66 
 
 		 717 aa  77  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  24.86 
 
 		 717 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  24.38 
 
 		 717 aa  74.7  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2258  phage DNA polymerase  22.53 
 
 		 542 aa  71.2  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  24.22 
 
 		 746 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  24.22 
 
 		 746 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0490  phage/plasmid primase, P4 family  25.36 
 
 		 882 aa  67.4  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.958319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2363  P4 family phage/plasmid primase  23.48 
 
 		 900 aa  67  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  26.16 
 
 		 857 aa  65.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2797  P4 family phage/plasmid primase  25.5 
 
 		 782 aa  64.7  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0564  ATPase-like  24.06 
 
 		 902 aa  63.5  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0661178  normal  0.572377 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  25.13 
 
 		 695 aa  63.5  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  24.76 
 
 		 755 aa  62  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  23.79 
 
 		 760 aa  61.2  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  23.06 
 
 		 738 aa  60.8  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0564  P4 family phage/plasmid primase  23.59 
 
 		 739 aa  60.8  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.68492  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0665  P4 family phage/plasmid primase  27.33 
 
 		 463 aa  60.8  0.00000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013749  Htur_5275  phage/plasmid primase, P4 family  23.01 
 
 		 1285 aa  59.7  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.413265  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  27.66 
 
 		 765 aa  60.1  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  27.66 
 
 		 759 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0819  phage DNA polymerase  26.61 
 
 		 501 aa  59.7  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.020371  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1315  Phage/plasmid primase P4-like  21.96 
 
 		 771 aa  58.2  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2911  P4 family phage/plasmid primase  20.44 
 
 		 769 aa  57  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0983  P4 family phage/plasmid primase  25.62 
 
 		 612 aa  56.2  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4888  P4 family phage/plasmid primase  23.16 
 
 		 697 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100684  normal  0.121248 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5359  P4 family phage/plasmid primase  21.24 
 
 		 531 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00485157  hitchhiker  0.00000000000000190106 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3437  hypothetical protein  27.64 
 
 		 462 aa  52.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1166  hypothetical protein  22.71 
 
 		 467 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  20.98 
 
 		 798 aa  49.3  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1367  P4 family phage/plasmid primase  25.86 
 
 		 524 aa  49.7  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.357272  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  22.54 
 
 		 749 aa  49.3  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1180  P4 family phage/plasmid primase  21.76 
 
 		 843 aa  48.9  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000898776  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0022  ATPase-like protein  23.08 
 
 		 548 aa  48.1  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5782  P4 family phage/plasmid primase  24.64 
 
 		 978 aa  46.6  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1465  hypothetical protein  21.76 
 
 		 770 aa  45.8  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.237309  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2199  P4 family phage/plasmid primase  21.46 
 
 		 554 aa  45.4  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8782  hypothetical protein  24.33 
 
 		 482 aa  43.9  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>