More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2973 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2973  ABC transporter related  100 
 
 		 246 aa  496  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000014361  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1282  ABC transporter-related protein  74.8 
 
 		 246 aa  383  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000182009 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1888  ABC transporter, ATP-binding protein  76.42 
 
 		 246 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.986838  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3391  ABC transporter related  81.3 
 
 		 245 aa  379  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0868  ABC transporter related protein  80.89 
 
 		 245 aa  376  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463879  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2167  ABC transporter related  70.71 
 
 		 247 aa  342  4e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2070  ABC transporter related  64.58 
 
 		 245 aa  321  8e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0552622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1939  hypothetical protein  65.69 
 
 		 241 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0973  ABC transporter related  65.82 
 
 		 247 aa  314  9e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.059424  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0507  ABC transporter-related protein  64.98 
 
 		 240 aa  311  5.999999999999999e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.302089  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17500  ABC transporter related  60.92 
 
 		 239 aa  306  3e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0533908  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  61.51 
 
 		 243 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  61.16 
 
 		 244 aa  302  3.0000000000000004e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2891  ABC transporter ATP-binding protein  58.4 
 
 		 241 aa  300  2e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.724805  normal  0.0929005 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3335  ABC transporter related  57.02 
 
 		 250 aa  298  5e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  59.49 
 
 		 254 aa  297  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0674  ABC transporter related  61.92 
 
 		 243 aa  297  1e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.120094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3348  ABC transporter related  61.92 
 
 		 243 aa  297  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00159492  normal  0.142579 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0673  ABC transporter related  61.92 
 
 		 243 aa  297  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.207873  normal  0.0972351 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0687  ABC transporter related  61.51 
 
 		 243 aa  295  4e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000839172  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0708  ABC transporter related  61.51 
 
 		 243 aa  295  4e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.658002  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3667  ABC transporter related  61.51 
 
 		 243 aa  295  4e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00165948  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0717  ABC transporter related  61.51 
 
 		 243 aa  295  4e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.759015  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3960  ABC transporter, ATP-binding protein  61.51 
 
 		 243 aa  295  6e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  57.94 
 
 		 264 aa  295  7e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0490  ABC transporter related  61 
 
 		 243 aa  294  8e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.858965  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1176  ABC transporter, ATP-binding protein  57.56 
 
 		 241 aa  294  1e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  59.49 
 
 		 244 aa  293  2e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  58.23 
 
 		 243 aa  293  2e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  57.56 
 
 		 241 aa  293  2e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4542  ABC transporter, ATP-binding protein  57.85 
 
 		 246 aa  292  3e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  57.74 
 
 		 241 aa  292  3e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  58.61 
 
 		 262 aa  292  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  59.24 
 
 		 244 aa  292  3e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  59.41 
 
 		 241 aa  291  5e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  57.98 
 
 		 241 aa  291  5e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0428  ABC transporter related  60.09 
 
 		 241 aa  291  5e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.02513 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0716  ABC transporter related  60.67 
 
 		 243 aa  291  6e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0818834  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1661  ABC transporter, ATPase subunit  60.25 
 
 		 242 aa  291  6e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  57.56 
 
 		 241 aa  291  6e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  58.23 
 
 		 243 aa  291  9e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000937515 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4486  ABC transporter related  58.06 
 
 		 268 aa  291  9e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  57.98 
 
 		 244 aa  290  2e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0898  hypothetical protein  60.08 
 
 		 241 aa  290  2e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0867  hypothetical protein  60.08 
 
 		 241 aa  290  2e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0973  ABC transporter related  59.92 
 
 		 240 aa  289  3e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.156124  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  56.54 
 
 		 240 aa  289  3e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  59.66 
 
 		 244 aa  289  3e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3087  ABC transporter, ATP-binding protein  60.67 
 
 		 243 aa  289  3e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187467  normal  0.113266 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3709  ABC transporter related  57.09 
 
 		 265 aa  289  3e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.320955  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  60.34 
 
 		 310 aa  288  4e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  58.82 
 
 		 241 aa  288  4e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3615  ABC transporter related  60.25 
 
 		 243 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0117606  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2170  ABC transporter-related protein  60.92 
 
 		 244 aa  288  5.0000000000000004e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.529851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  58.97 
 
 		 241 aa  288  6e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1196  ABC transporter related protein  56.54 
 
 		 243 aa  288  6e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  58.16 
 
 		 241 aa  288  7e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3310  ABC transporter-related protein  60.92 
 
 		 243 aa  287  1e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000131342  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  58.2 
 
 		 258 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  58.82 
 
 		 244 aa  287  1e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0727  ABC transporter-related protein  60.17 
 
 		 243 aa  287  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.12728 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  58.2 
 
 		 261 aa  287  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  58.2 
 
 		 258 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3669  ABC transporter, ATP-binding protein  56.9 
 
 		 245 aa  287  1e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  58.2 
 
 		 258 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0193  ABC transporter related  57.72 
 
 		 267 aa  286  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.572314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4239  ABC transporter related  59.83 
 
 		 243 aa  286  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000891993 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0418  ABC transporter-related protein  58.02 
 
 		 263 aa  286  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0597  ABC transporter related  58.2 
 
 		 261 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0435549 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2850  ABC transporter related  58.61 
 
 		 258 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2708  ABC transporter related  58.61 
 
 		 258 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0148157 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  55.17 
 
 		 246 aa  285  4e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0577  ABC transporter related  57.6 
 
 		 256 aa  285  4e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3814  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.74 
 
 		 241 aa  285  5e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6120  ABC transporter, ATPase subunit  58.2 
 
 		 258 aa  285  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0525  ABC transporter related  58.2 
 
 		 258 aa  285  5e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0291  ABC transporter related  58.02 
 
 		 262 aa  284  7e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.342823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0327  ABC transporter related  58.2 
 
 		 260 aa  285  7e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0264  ABC transporter related  58.02 
 
 		 262 aa  284  7e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3656  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.32 
 
 		 241 aa  284  9e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.875085  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0644  ABC transporter, ATP-binding protein  58.8 
 
 		 245 aa  284  1.0000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00234663  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0871  ABC transporter related  57.98 
 
 		 241 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818606  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  57.61 
 
 		 262 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0727  ABC transporter related  58.82 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  57.33 
 
 		 240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  56.97 
 
 		 258 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4957  ABC transporter related  57.87 
 
 		 256 aa  282  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0075  ABC transporter, ATP-binding protein  56.97 
 
 		 258 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0582  ABC transporter, ATP-binding protein  56.97 
 
 		 258 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3107  ABC transporter, ATP-binding protein  56.97 
 
 		 258 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2943  ABC transporter, ATP-binding protein  56.97 
 
 		 258 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0766  ABC transporter system, ATP-binding protein  56.97 
 
 		 258 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0598  ABC transporter, ATP-binding protein  56.97 
 
 		 258 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  56.97 
 
 		 258 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  56 
 
 		 255 aa  281  8.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  57.44 
 
 		 249 aa  281  9e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3637  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.32 
 
 		 241 aa  281  9e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.671496  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4366  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.74 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254909  normal  0.374938 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4262  ABC transporter related  57.74 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1770  ATPase  60.34 
 
 		 240 aa  280  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.464592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>