More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2009 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 294 aa  609  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2117  alpha/beta hydrolase fold protein  78.91 
 
 		 300 aa  499  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2101  alpha/beta hydrolase fold  78.57 
 
 		 300 aa  496  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.933589  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  73.81 
 
 		 296 aa  463  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  72.45 
 
 		 298 aa  455  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  64.21 
 
 		 318 aa  402  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  63.64 
 
 		 301 aa  404  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  63.45 
 
 		 339 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  63.45 
 
 		 339 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  64.21 
 
 		 291 aa  403  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  64.89 
 
 		 320 aa  402  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  62.76 
 
 		 308 aa  399  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  63.51 
 
 		 297 aa  395  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  62.81 
 
 		 290 aa  395  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  63.48 
 
 		 302 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  63.83 
 
 		 302 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  64.18 
 
 		 303 aa  394  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  63.83 
 
 		 302 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  63.96 
 
 		 297 aa  394  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  63.48 
 
 		 302 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  60.21 
 
 		 293 aa  385  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  62.19 
 
 		 295 aa  384  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1183  alpha/beta fold family hydrolase  56.94 
 
 		 310 aa  350  2e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2638  alpha/beta hydrolase fold protein  51.81 
 
 		 294 aa  311  5.999999999999999e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0168  alpha/beta hydrolase fold  53.07 
 
 		 296 aa  305  5.0000000000000004e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03953  haloalkane dehalogenase  52.9 
 
 		 300 aa  300  2e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1007  haloalkane dehalogenase  49.66 
 
 		 301 aa  285  9e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0490132  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0885  alpha/beta hydrolase fold  49.66 
 
 		 301 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  45.17 
 
 		 296 aa  271  7e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2009  alpha/beta hydrolase fold  47.2 
 
 		 299 aa  268  5e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0552  alpha/beta hydrolase fold protein  46.69 
 
 		 294 aa  259  4e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2625  alpha/beta hydrolase  36.54 
 
 		 314 aa  193  4e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.981028  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2462  AMP-dependent synthetase and ligase  34.23 
 
 		 861 aa  153  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4241  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 		 875 aa  146  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.727325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  33.9 
 
 		 289 aa  145  9e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36600  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.59 
 
 		 922 aa  143  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.478291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1849  Alpha/beta hydrolase  31.46 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542461  normal  0.272584 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4184  alpha/beta hydrolase fold  32.01 
 
 		 307 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3335  alpha/beta hydrolase fold  32.01 
 
 		 307 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4182  alpha/beta hydrolase fold  32.01 
 
 		 307 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250212  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0447  AMP-dependent synthetase and ligase  30.97 
 
 		 927 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  35.94 
 
 		 922 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0417779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  31.13 
 
 		 304 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.901488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3885  alpha/beta hydrolase fold  31.13 
 
 		 304 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345695  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  30.56 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13240  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.04 
 
 		 978 aa  126  4.0000000000000003e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1907  alpha/beta hydrolase fold protein  32.96 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1915  haloalkane dehalogenase  29.53 
 
 		 306 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1370  haloalkane dehalogenase  30.18 
 
 		 293 aa  120  3.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.59212e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  29.96 
 
 		 302 aa  119  4.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0008  haloalkane dehalogenase  32.41 
 
 		 304 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.717639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2973  haloalkane dehalogenase  31.08 
 
 		 302 aa  116  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6821  alpha/beta hydrolase fold protein  30.85 
 
 		 300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17450  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.31 
 
 		 899 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17047  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2056  haloalkane dehalogenase  29.63 
 
 		 302 aa  112  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3680  haloalkane dehalogenase  31 
 
 		 302 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 		 323 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2475  alpha/beta hydrolase fold protein  40.88 
 
 		 287 aa  110  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1777  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3197  haloalkane dehalogenase  30.85 
 
 		 310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  30.15 
 
 		 915 aa  109  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0151795  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2428  haloalkane dehalogenase  28.67 
 
 		 299 aa  109  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2384  haloalkane dehalogenase  29.93 
 
 		 298 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00566343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0257  alpha/beta hydrolase fold protein  30.45 
 
 		 300 aa  106  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2620  haloalkane dehalogenase  28.28 
 
 		 330 aa  105  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.198111  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1611  haloalkane dehalogenase  33.49 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2671  haloalkane dehalogenase  30.56 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.731283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  29.15 
 
 		 323 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0582  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 		 336 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  29.53 
 
 		 329 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  28.66 
 
 		 321 aa  102  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7423  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3721  Alpha/beta hydrolase  29.97 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.305299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5150  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 324 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0685525  normal  0.697415 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  27.65 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4949  haloalkane dehalogenase  29.62 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00300745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5037  haloalkane dehalogenase  29.62 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5330  haloalkane dehalogenase  29.62 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1253  haloalkane dehalogenase  28.81 
 
 		 303 aa  100  4e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4733  alpha/beta hydrolase fold  28.23 
 
 		 294 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1919  alpha/beta hydrolase fold  25.16 
 
 		 309 aa  99  8e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0665  alpha/beta hydrolase fold  39.72 
 
 		 405 aa  99  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.910637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.33 
 
 		 639 aa  98.6  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0548  Alpha/beta hydrolase fold-1  30.8 
 
 		 334 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12319  haloalkane dehalogenase  29.66 
 
 		 300 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.62 
 
 		 461 aa  98.2  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3658  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 311 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6373  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 		 303 aa  97.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1031  alpha/beta hydrolase fold protein  29.49 
 
 		 300 aa  96.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  0.157173 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3479  alpha/beta hydrolase fold protein  25.45 
 
 		 296 aa  96.3  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0956  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 		 337 aa  96.3  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  24.48 
 
 		 275 aa  96.3  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 		 291 aa  95.5  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 		 291 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0136  alpha/beta hydrolase fold protein  27.52 
 
 		 289 aa  95.1  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  40.5 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0178  alpha/beta hydrolase  24.64 
 
 		 323 aa  94.7  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2886  alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 		 290 aa  94  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12599  haloalkane dehalogenase  26.9 
 
 		 300 aa  94  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.365341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4848  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 287 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>