More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1998 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 172 aa  351  2.9999999999999997e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  51.74 
 
 		 393 aa  168  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  59.56 
 
 		 831 aa  159  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  52.5 
 
 		 684 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  45.58 
 
 		 245 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  48.03 
 
 		 557 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  43.11 
 
 		 448 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  41.82 
 
 		 235 aa  125  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  46.92 
 
 		 961 aa  124  6e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  40.83 
 
 		 303 aa  124  9e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  39.39 
 
 		 489 aa  122  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  39.16 
 
 		 241 aa  120  8e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  48.85 
 
 		 329 aa  120  8e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  42.13 
 
 		 252 aa  120  8e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  46.55 
 
 		 267 aa  119  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  42.77 
 
 		 425 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  47.24 
 
 		 255 aa  118  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  48.31 
 
 		 789 aa  117  7e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  35.42 
 
 		 246 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.35 
 
 		 270 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.12 
 
 		 341 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  43.41 
 
 		 416 aa  114  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  51.38 
 
 		 117 aa  114  6e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  50 
 
 		 1402 aa  114  6.9999999999999995e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  47.93 
 
 		 2413 aa  114  6.9999999999999995e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.42 
 
 		 528 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  41.21 
 
 		 271 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1127  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.9 
 
 		 272 aa  111  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111937  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  47.24 
 
 		 256 aa  111  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.83 
 
 		 318 aa  111  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  43.04 
 
 		 376 aa  110  8.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  46.27 
 
 		 274 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  47.79 
 
 		 490 aa  108  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  45.67 
 
 		 1032 aa  108  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  50 
 
 		 185 aa  108  3e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 		 223 aa  108  4.0000000000000004e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  40.13 
 
 		 376 aa  108  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  44.12 
 
 		 380 aa  107  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  38.46 
 
 		 380 aa  108  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  41.46 
 
 		 232 aa  108  5e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  46.9 
 
 		 685 aa  108  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  40.67 
 
 		 305 aa  107  6e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  41.61 
 
 		 208 aa  107  6e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  39.24 
 
 		 490 aa  107  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  42.75 
 
 		 1493 aa  107  7.000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  37.11 
 
 		 181 aa  107  7.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  45 
 
 		 1002 aa  104  5e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.63 
 
 		 380 aa  104  6e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  40.29 
 
 		 342 aa  103  8e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.24 
 
 		 346 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3097  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.86 
 
 		 163 aa  101  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  51.11 
 
 		 552 aa  101  5e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0019  Hsp12 variant C  34.57 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.1 
 
 		 255 aa  100  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  43.2 
 
 		 373 aa  99.4  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  37.98 
 
 		 221 aa  99.4  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  36.47 
 
 		 193 aa  99.4  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  41.01 
 
 		 315 aa  99.8  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  43.09 
 
 		 731 aa  99  3e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  35.57 
 
 		 254 aa  98.6  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0015  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.93 
 
 		 209 aa  98.6  4e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.492258  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  37.86 
 
 		 264 aa  98.6  4e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  39.02 
 
 		 1037 aa  97.4  8e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  45.22 
 
 		 260 aa  97.4  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4151  Sel1 domain-containing protein  47.22 
 
 		 365 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.216978  normal  0.586602 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.13 
 
 		 222 aa  97.1  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  42.4 
 
 		 373 aa  96.7  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1992  Sel1 repeat-containing protein  34.62 
 
 		 233 aa  96.3  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.722061  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  40.13 
 
 		 976 aa  96.3  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1107  Sel1 domain-containing protein  41.41 
 
 		 234 aa  95.5  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.747543 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6466  Sel1 repeat-containing protein  35.37 
 
 		 258 aa  94.7  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2652  Sel1 domain-containing protein  36.84 
 
 		 410 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4119  Sel1 domain-containing protein  32.24 
 
 		 175 aa  94.7  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  43.09 
 
 		 838 aa  94.7  6e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2501  Sel1 repeat-containing protein  35.37 
 
 		 250 aa  94.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3115  Sel1 domain-containing protein  35.37 
 
 		 250 aa  94.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.420121  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0117  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.86 
 
 		 294 aa  94.4  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0117  hypothetical protein  42.86 
 
 		 294 aa  94.4  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  36.08 
 
 		 509 aa  94  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  36.08 
 
 		 509 aa  94  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1627  hypothetical protein  33.14 
 
 		 647 aa  93.6  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.543561 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  36.08 
 
 		 509 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  36.08 
 
 		 509 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0472  hypothetical protein  43.81 
 
 		 1796 aa  94  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0668  hypothetical protein  36.9 
 
 		 184 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2447  hypothetical protein  36.67 
 
 		 247 aa  93.2  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2998  Sel1 domain-containing protein  36.9 
 
 		 184 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0737  hypothetical protein  36.9 
 
 		 184 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.574637 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  38.69 
 
 		 359 aa  93.2  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0675  hypothetical protein  39.86 
 
 		 184 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2175  hypothetical protein  35.61 
 
 		 156 aa  92.4  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.340086  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3131  Sel1 domain-containing protein  34.69 
 
 		 250 aa  92.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.705283 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.11 
 
 		 1261 aa  92.4  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  33.96 
 
 		 680 aa  92  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2979  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.31 
 
 		 184 aa  91.3  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  41.27 
 
 		 839 aa  91.7  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3112  Sel1 domain-containing protein  34.69 
 
 		 257 aa  91.3  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.73458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0951  hypothetical protein  41.67 
 
 		 1141 aa  90.9  7e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04700  hypothetical protein  39.68 
 
 		 328 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  32.74 
 
 		 344 aa  91.3  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>