154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_5024 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  100 
 
 		 571 aa  1127    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  40.4 
 
 		 564 aa  310  4e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0220  TAP domain protein  38.65 
 
 		 551 aa  281  2e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712779 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2970  TAP domain protein  37.09 
 
 		 542 aa  271  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32712  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0644  hypothetical protein  32.96 
 
 		 597 aa  259  7e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  34.85 
 
 		 643 aa  258  2e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  38.98 
 
 		 506 aa  257  4e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1065  TAP domain protein  31.91 
 
 		 544 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  35.44 
 
 		 527 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  36.36 
 
 		 485 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2442  TAP domain protein  34.1 
 
 		 597 aa  216  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000431609  normal  0.057711 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  35.56 
 
 		 500 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  34.33 
 
 		 525 aa  213  7e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2656  TAP domain protein  34.35 
 
 		 535 aa  210  6e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0201051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  31.4 
 
 		 522 aa  210  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  32.95 
 
 		 495 aa  205  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  32.85 
 
 		 521 aa  204  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  31.67 
 
 		 545 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  33.33 
 
 		 541 aa  201  3e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  32.21 
 
 		 546 aa  200  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  36.12 
 
 		 508 aa  195  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  32.62 
 
 		 540 aa  193  6e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  33.96 
 
 		 515 aa  188  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  31.01 
 
 		 524 aa  188  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  30.5 
 
 		 476 aa  186  7e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1946  TAP domain protein  34.52 
 
 		 518 aa  186  8e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0350254  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  33.2 
 
 		 521 aa  184  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  33.47 
 
 		 538 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  29.36 
 
 		 518 aa  182  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0185  TAP domain protein  31.64 
 
 		 551 aa  181  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.696189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  30.82 
 
 		 525 aa  180  4.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8392  TAP domain protein  31.38 
 
 		 537 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258609  normal  0.179275 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  33.2 
 
 		 515 aa  174  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5935  TAP domain protein  31.34 
 
 		 518 aa  174  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235476  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  33.4 
 
 		 521 aa  171  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3316  TAP domain protein  34.44 
 
 		 484 aa  171  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0266981  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1488  TAP domain-containing protein  32.23 
 
 		 522 aa  170  7e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00026814 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  32.6 
 
 		 515 aa  169  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  30.31 
 
 		 542 aa  168  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  33.05 
 
 		 505 aa  167  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25020  alpha/beta hydrolase family protein  31.13 
 
 		 542 aa  167  5e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  33.98 
 
 		 505 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  30.96 
 
 		 523 aa  164  4.0000000000000004e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  32.12 
 
 		 535 aa  163  6e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  30.7 
 
 		 507 aa  163  9e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  32.77 
 
 		 533 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  30.89 
 
 		 511 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  32.77 
 
 		 508 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  30.89 
 
 		 511 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  32.77 
 
 		 508 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  30.89 
 
 		 511 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  29.57 
 
 		 486 aa  160  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  29.55 
 
 		 499 aa  160  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  30.53 
 
 		 506 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  31.36 
 
 		 520 aa  159  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  31.4 
 
 		 532 aa  158  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  29.59 
 
 		 532 aa  156  9e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4414  hypothetical protein  32.75 
 
 		 505 aa  155  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.694835  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  30.92 
 
 		 520 aa  151  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3160  TAP domain protein  32.3 
 
 		 527 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  26.02 
 
 		 504 aa  147  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4710  TAP domain protein  32.11 
 
 		 504 aa  146  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  30 
 
 		 495 aa  144  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2980  TAP domain protein  31.4 
 
 		 557 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.085257  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1723  TAP domain protein  32.57 
 
 		 536 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00370292  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11121  conserved hypothetical protein  28.99 
 
 		 555 aa  140  7e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0230414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1966  hypothetical protein  30.39 
 
 		 530 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4973  TAP domain protein  30.83 
 
 		 522 aa  139  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39691  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  26.36 
 
 		 504 aa  139  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  29.18 
 
 		 516 aa  134  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  25.92 
 
 		 505 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4117  TAP domain-containing protein  30.77 
 
 		 556 aa  134  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6092  TAP domain-containing protein  25.83 
 
 		 478 aa  131  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2212  TAP domain-containing protein  28.79 
 
 		 520 aa  127  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0750  putative secreted peptidase  30.04 
 
 		 521 aa  126  9e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  36.23 
 
 		 300 aa  126  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2276  putative protease  29.57 
 
 		 524 aa  125  2e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.494839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  28.6 
 
 		 547 aa  124  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3257  TAP domain-containing protein  27.74 
 
 		 499 aa  123  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.590122  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3616  TAP domain protein  31.06 
 
 		 546 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  27.63 
 
 		 505 aa  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4882  TAP domain-containing protein  27.98 
 
 		 493 aa  118  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08498  proteinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01350)  27.07 
 
 		 678 aa  118  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.726549  normal  0.616517 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0481  TAP domain protein  30.02 
 
 		 539 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24000  alpha/beta hydrolase family protein  29.18 
 
 		 514 aa  117  7.999999999999999e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0638812 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4190  TAP domain-containing protein  26.79 
 
 		 519 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6090  TAP domain-containing protein  25.67 
 
 		 508 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4219  alpha/beta hydrolase fold protein  28.17 
 
 		 486 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2785  TAP domain protein  35.68 
 
 		 480 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000127217  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  25.22 
 
 		 494 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3059  hypothetical protein  29.86 
 
 		 459 aa  110  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1310  TAP domain protein  29.58 
 
 		 566 aa  108  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.330733  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2839  TAP domain protein  29.79 
 
 		 517 aa  107  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350131  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0722  alpha/beta fold family hydrolase  26.33 
 
 		 480 aa  105  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  27.16 
 
 		 750 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0472  alpha/beta hydrolase fold protein  32.36 
 
 		 525 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0071  alpha/beta fold family hydrolase  24.8 
 
 		 539 aa  99.8  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1577  TAP domain protein  26.32 
 
 		 514 aa  98.2  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3544  TAP domain protein  28.87 
 
 		 524 aa  95.9  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000370838  hitchhiker  0.00997148 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7397  TAP domain-containing protein  32.84 
 
 		 613 aa  93.2  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312183  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>