More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0973 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 318 aa  629  1e-179  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  58.66 
 
 		 291 aa  290  3e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  50.47 
 
 		 327 aa  260  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  46.43 
 
 		 325 aa  250  2e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  47.71 
 
 		 368 aa  248  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  49.43 
 
 		 370 aa  230  3e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2986  NLP/P60 protein  47.1 
 
 		 216 aa  140  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120192 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  55.56 
 
 		 270 aa  135  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  48.99 
 
 		 235 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  43.33 
 
 		 191 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  48.95 
 
 		 200 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  46.48 
 
 		 222 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  57.27 
 
 		 438 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  55.26 
 
 		 280 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  54.24 
 
 		 217 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  53.33 
 
 		 217 aa  129  6e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  55.38 
 
 		 199 aa  129  7.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  48.78 
 
 		 273 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  55.28 
 
 		 206 aa  128  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  49.59 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  48.91 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  56.3 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  58.49 
 
 		 211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  57.52 
 
 		 202 aa  126  6e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  46.76 
 
 		 202 aa  124  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  53.33 
 
 		 199 aa  124  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  46.3 
 
 		 208 aa  124  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  52.8 
 
 		 244 aa  123  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  55.45 
 
 		 228 aa  123  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  48.25 
 
 		 207 aa  122  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  47.58 
 
 		 174 aa  122  6e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  53.98 
 
 		 245 aa  122  7e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1886  lytic transglycosylase, catalytic  53.45 
 
 		 189 aa  122  7e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.158781  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  41.4 
 
 		 1048 aa  122  8e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  40.53 
 
 		 362 aa  122  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3807  lytic transglycosylase, catalytic  53.45 
 
 		 215 aa  122  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1871  lytic transglycosylase, catalytic  48.78 
 
 		 281 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000100876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  49.64 
 
 		 197 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  49.63 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2959  lytic transglycosylase catalytic  56.25 
 
 		 280 aa  121  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  53.78 
 
 		 261 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  44.83 
 
 		 245 aa  120  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  53.51 
 
 		 196 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  48.18 
 
 		 251 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  50.43 
 
 		 215 aa  120  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  48.18 
 
 		 251 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9819  type IV system transglycosylase  51.3 
 
 		 362 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  48.18 
 
 		 251 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  45.45 
 
 		 216 aa  119  7e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  48.15 
 
 		 239 aa  119  7e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  48.15 
 
 		 239 aa  119  7e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  48.15 
 
 		 239 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1424  lytic transglycosylase, catalytic  52.17 
 
 		 191 aa  118  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0284128  normal  0.0259883 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1380  Lytic transglycosylase catalytic  47.5 
 
 		 234 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033505 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  48.15 
 
 		 197 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  49.18 
 
 		 188 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  53.85 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  53.15 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  52.1 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  48.15 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  44.44 
 
 		 261 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  48.15 
 
 		 218 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  52.99 
 
 		 206 aa  116  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  50.85 
 
 		 195 aa  116  6e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  46.72 
 
 		 299 aa  116  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  51.28 
 
 		 204 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0452  lytic transglycosylase, catalytic  48.7 
 
 		 204 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  48.8 
 
 		 249 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3973  lytic transglycosylase catalytic  61.22 
 
 		 204 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  43.59 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  42.74 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  42.74 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  42.74 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  43.59 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  42.74 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3638  lytic transglycosylase catalytic  59.6 
 
 		 206 aa  114  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.237 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  42.74 
 
 		 261 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  36.7 
 
 		 189 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  42.74 
 
 		 259 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  52.99 
 
 		 212 aa  113  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  56.19 
 
 		 204 aa  112  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3565  Lytic transglycosylase catalytic  53.51 
 
 		 158 aa  113  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  45.65 
 
 		 307 aa  112  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  44.44 
 
 		 238 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  50.4 
 
 		 296 aa  112  9e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  42.74 
 
 		 261 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  47.97 
 
 		 217 aa  111  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  51.28 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0440  lytic transglycosylase, catalytic  51.4 
 
 		 204 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  49.6 
 
 		 296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1794  putative lytic transglycosylase  51.4 
 
 		 204 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.391793  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  55.66 
 
 		 194 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  44.93 
 
 		 442 aa  111  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2022  NLP/P60 protein  47.86 
 
 		 242 aa  110  4.0000000000000004e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.321386 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  45.99 
 
 		 247 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3822  lytic transglycosylase, catalytic  56.57 
 
 		 204 aa  109  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.539253  normal  0.0346403 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  52.29 
 
 		 329 aa  109  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  43.85 
 
 		 265 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  50.4 
 
 		 285 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  51.89 
 
 		 198 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>