222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1166 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  100 
 
 		 105 aa  206  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  84.62 
 
 		 104 aa  184  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  71.43 
 
 		 105 aa  155  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3054  protein of unknown function YGGT  60.2 
 
 		 99 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.649035  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1665  protein of unknown function YGGT  52.53 
 
 		 99 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.905288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0415  protein of unknown function YGGT  56.84 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000337721  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0149  protein of unknown function YGGT  51 
 
 		 100 aa  106  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.041214 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1696  protein of unknown function YGGT  51.52 
 
 		 100 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.471282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1492  protein of unknown function YGGT  53.49 
 
 		 109 aa  97.8  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290091  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2724  protein of unknown function YGGT  53.49 
 
 		 109 aa  97.8  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0020  protein of unknown function YGGT  61.97 
 
 		 94 aa  97.1  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310945  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2172  hypothetical protein  47.87 
 
 		 100 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0505653  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0615  hypothetical protein  54.67 
 
 		 93 aa  91.3  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.8017800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0106  yggt family protein  46.46 
 
 		 99 aa  89.4  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1547  riboflavin synthase alpha subunit  44.79 
 
 		 97 aa  87.4  5e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.836777  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3637  protein of unknown function YGGT  51.9 
 
 		 94 aa  87.4  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.160206  normal  0.479955 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0405  protein of unknown function YGGT  45.45 
 
 		 97 aa  83.6  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  46.99 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0439  yggt family protein  45.16 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000131375  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1379  yggt family protein  42.71 
 
 		 97 aa  80.5  0.000000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1901  protein of unknown function YGGT  45 
 
 		 100 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0679  protein of unknown function YGGT  42.11 
 
 		 98 aa  80.5  0.000000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345775  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0327  yggt family protein  46.59 
 
 		 97 aa  79.3  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0261  protein of unknown function YGGT  42.42 
 
 		 99 aa  77.4  0.00000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0438  protein of unknown function YGGT  42.17 
 
 		 92 aa  76.3  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0261  YGGT family protein  42.17 
 
 		 92 aa  76.3  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.634053  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  44.16 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  37.35 
 
 		 89 aa  72.8  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  40.48 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  39.29 
 
 		 196 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  39.29 
 
 		 196 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  42.5 
 
 		 85 aa  70.5  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  40.26 
 
 		 196 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2973  protein of unknown function YGGT  43.96 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0718  conserved hypothetical integral membrane protein, YGGT family  55.17 
 
 		 95 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.338437  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  45 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1060  hypothetical protein  38.75 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.040258  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1355  protein of unknown function YGGT  36.73 
 
 		 100 aa  67.4  0.00000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  33.33 
 
 		 197 aa  67  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1093  protein of unknown function YGGT  33.67 
 
 		 98 aa  66.2  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.869762  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0057  protein of unknown function YGGT  45.56 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1027  protein of unknown function YGGT  33.67 
 
 		 98 aa  66.2  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0931  YGGT family protein  41.76 
 
 		 93 aa  66.2  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0989  protein of unknown function YGGT  42.53 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0860  YGGT family protein  41.76 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.151332  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  33.71 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1838  hypothetical protein  38.89 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000231673  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3720  protein of unknown function YGGT  44.05 
 
 		 180 aa  64.3  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0508  protein of unknown function YGGT  40.96 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1085  protein of unknown function YGGT  33.77 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000150484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0271  hypothetical protein  45.12 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3042  hypothetical protein  49.21 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.390306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0947  protein of unknown function YGGT  40 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0714  protein of unknown function YGGT  40.85 
 
 		 84 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.674624  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3355  hypothetical protein  45.68 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1191  protein of unknown function YGGT  44.83 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0253033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1192  protein of unknown function YGGT  45.98 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal  0.653735 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  42.42 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0993  YGGT family protein  48.44 
 
 		 93 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0346912  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2689  protein of unknown function YGGT  44.58 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.885228  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3042  protein of unknown function YGGT  43.37 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245532  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3185  protein of unknown function YGGT  43.37 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000491839  normal  0.0847291 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1336  protein of unknown function YGGT  43.37 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000680586  hitchhiker  0.0000219253 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2684  protein of unknown function YGGT  43.21 
 
 		 184 aa  62  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000426882  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  29.81 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1540  protein of unknown function YGGT  34.34 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.180759  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2862  protein of unknown function YGGT  43.42 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0177844  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3027  protein of unknown function YGGT  43.37 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000050243  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1262  protein of unknown function YGGT  43.68 
 
 		 182 aa  60.8  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0091593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  28.85 
 
 		 197 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2479  protein of unknown function YGGT  40.7 
 
 		 182 aa  60.5  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.619107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0933  protein of unknown function YGGT  32 
 
 		 85 aa  60.5  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3056  protein of unknown function YGGT  34.74 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.502077  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1411  protein of unknown function YGGT  35.9 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000759704  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2655  protein of unknown function YGGT  43.53 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666885  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1360  hypothetical protein  44.05 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4027  protein of unknown function YGGT  43.62 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03300  hypothetical protein  39.47 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3706  protein of unknown function YGGT  46.15 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.535312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3938  protein of unknown function YGGT  46.27 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0028  protein of unknown function YGGT  44.05 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.242413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0478  hypothetical protein  42.22 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4076  protein of unknown function YGGT  38.64 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3001  hypothetical protein  49.02 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3629  protein of unknown function YGGT  44.78 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3782  protein of unknown function YGGT  38.64 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.402098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4038  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0607  protein of unknown function YGGT  42.22 
 
 		 96 aa  57  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0018  protein of unknown function YGGT  42.86 
 
 		 95 aa  57  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292831  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  28.41 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2158  hypothetical protein  37.93 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.101701  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  28.41 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  41.67 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1230  protein of unknown function YGGT  43.04 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000825612  normal  0.409234 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1125  protein of unknown function YGGT  42.17 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000165213  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0751  YGGT family membrane protein  37.93 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3609  protein of unknown function YGGT  35 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2028  YGGT family membrane protein  37.93 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3111  hypothetical protein  37.93 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3083  YGGT family membrane protein  37.93 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>