More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0790 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0790  dienelactone hydrolase  100 
 
 
269 aa  543  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2536  dienelactone hydrolase family protein  73.36 
 
 
270 aa  364  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0914  dienelactone hydrolase  60.8 
 
 
263 aa  316  3e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0661  dienelactone hydrolase  56.97 
 
 
263 aa  289  3e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4242  dienelactone hydrolase  53.54 
 
 
263 aa  276  4e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194983  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3611  dienelactone hydrolase  51.5 
 
 
267 aa  275  5e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000690208  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0480  dienelactone hydrolase family protein  57.2 
 
 
260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0425  dienelactone hydrolase  50 
 
 
268 aa  273  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.18094  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33270  Dienelactone hydrolase protein  53.97 
 
 
261 aa  272  5.000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49330  hypothetical protein  55.46 
 
 
262 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.295044  normal  0.0937035 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0163  dienelactone hydrolase  54.58 
 
 
318 aa  266  2.9999999999999995e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4214  hypothetical protein  52.23 
 
 
262 aa  265  5e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4232  dienelactone hydrolase  53.44 
 
 
263 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.215176  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3711  dienelactone hydrolase  51.14 
 
 
262 aa  260  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138504 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1677  dienelactone hydrolase family protein  50.38 
 
 
262 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1196  dienelactone hydrolase  52.61 
 
 
263 aa  258  8e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372002  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1184  dienelactone hydrolase  53.82 
 
 
265 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00788305  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1214  dienelactone hydrolase  53.41 
 
 
263 aa  255  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.602009  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  52.63 
 
 
263 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2350  dienelactone hydrolase  52.14 
 
 
259 aa  244  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1399  dienelactone hydrolase  46.47 
 
 
250 aa  228  9e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0347  dienelactone hydrolase  47.1 
 
 
262 aa  221  9e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.971139  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2218  dienelactone hydrolase  47.21 
 
 
264 aa  221  9.999999999999999e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000562202  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0499  dienelactone hydrolase  43.39 
 
 
261 aa  213  2.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1370  dienelactone hydrolase  43.2 
 
 
280 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1920  dienelactone hydrolase  45.78 
 
 
264 aa  204  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0940  dienelactone hydrolase  45.97 
 
 
279 aa  202  6e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2303  dienelactone hydrolase  44.58 
 
 
264 aa  198  9e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0014  dienelactone hydrolase  43.37 
 
 
273 aa  194  9e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332863  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1219  carboxymethylenebutenolidase  40.25 
 
 
258 aa  191  1e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0189806  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1264  dienelactone hydrolase family protein  40 
 
 
237 aa  185  6e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1803  dienelactone hydrolase family protein  40.66 
 
 
239 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.100178  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2719  hypothetical protein  38.89 
 
 
238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2592  hypothetical protein  38.46 
 
 
238 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1093  dienelactone hydrolase  41.67 
 
 
237 aa  176  3e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1497  dienelactone hydrolase  40.66 
 
 
246 aa  170  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1980  dienelactone hydrolase  36.29 
 
 
245 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.228213 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2281  dienelactone hydrolase  35.44 
 
 
245 aa  162  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187081 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0170  dienelactone hydrolase  36.62 
 
 
246 aa  159  4e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135133  normal  0.545513 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2612  hypothetical protein  35.86 
 
 
238 aa  159  5e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02015  dienelactone hydrolase  37.6 
 
 
264 aa  158  9e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2739  hypothetical protein  35.02 
 
 
238 aa  155  9e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4157  dienelactone hydrolase  38.96 
 
 
237 aa  154  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138582  normal  0.0101627 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2104  dienelactone hydrolase  41.53 
 
 
234 aa  153  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0464175  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2163  dienelactone hydrolase  37.78 
 
 
237 aa  151  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163998  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2490  dienelactone hydrolase  38.78 
 
 
262 aa  149  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2018  dienelactone hydrolase  33.88 
 
 
242 aa  149  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.426068  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1626  dienelactone hydrolase  36.55 
 
 
242 aa  149  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0197057 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43840  hypothetical protein  37.89 
 
 
241 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1525  dienelactone hydrolase  36.33 
 
 
241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2209  dienelactone hydrolase family protein  33.88 
 
 
242 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.670258  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1015  dienelactone hydrolase  35.92 
 
 
261 aa  146  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0264245  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3677  hypothetical protein  37.89 
 
 
241 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3134  dienelactone hydrolase  39.09 
 
 
234 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0587579  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3656  dienelactone hydrolase  38.56 
 
 
263 aa  145  9e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0597  dienelactone hydrolase family protein  39.34 
 
 
243 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0612  dienelactone hydrolase family protein  39.34 
 
 
243 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1245  dienelactone hydrolase  36.28 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00955102  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  36.44 
 
 
254 aa  140  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0787  dienelactone hydrolase family protein  37.2 
 
 
356 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307266  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1805  dienelactone hydrolase  33.58 
 
 
245 aa  136  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.0741289 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4133  dienelactone hydrolase  36.51 
 
 
237 aa  135  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.850524  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0501  dienelactone hydrolase family protein  38.02 
 
 
242 aa  135  8e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.821381  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1690  dienelactone hydrolase  32.87 
 
 
241 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0305937  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3749  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 
241 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3501  dienelactone hydrolase  34.26 
 
 
241 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.572778  normal  0.863924 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4659  dienelactone hydrolase  33.2 
 
 
257 aa  133  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7419  hypothetical protein  36.49 
 
 
234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4178  dienelactone hydrolase  32.41 
 
 
241 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119095  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3045  dienelactone hydrolase  39.32 
 
 
249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4947  dienelactone hydrolase  37.98 
 
 
241 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.316291  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4080  dienelactone hydrolase  38.22 
 
 
244 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240265  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0694  dienelactone hydrolase  35.09 
 
 
271 aa  124  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.115096  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0569  dienelactone hydrolase  32.92 
 
 
267 aa  120  3e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000352652  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0559  dienelactone hydrolase  32.93 
 
 
265 aa  117  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  32.44 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3032  dienelactone hydrolase  31.8 
 
 
296 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.345773 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2775  dienelactone hydrolase  33.2 
 
 
269 aa  108  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  30.94 
 
 
290 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  30.49 
 
 
290 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  31.09 
 
 
227 aa  102  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2650  dienelactone hydrolase  35.64 
 
 
265 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2621  dienelactone hydrolase  35.64 
 
 
265 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2665  dienelactone hydrolase  35.64 
 
 
265 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal  0.690988 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  28.29 
 
 
247 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4373  dienelactone hydrolase  30.65 
 
 
256 aa  97.1  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.68292 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  27.73 
 
 
248 aa  97.1  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  28.5 
 
 
214 aa  95.1  9e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  28.69 
 
 
246 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  27.91 
 
 
247 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  29.18 
 
 
248 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  30.17 
 
 
227 aa  93.6  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1386  Carboxymethylenebutenolidase  32.28 
 
 
224 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6385  carboxymethylenebutenolidase  32.37 
 
 
234 aa  89.4  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2303  putative carboxymethylenebutenolidase  29.05 
 
 
224 aa  89.4  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  28.74 
 
 
251 aa  88.6  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4378  carboxymethylenebutenolidase  32.19 
 
 
230 aa  88.2  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112691 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1202  carboxymethylenebutenolidase  30.39 
 
 
224 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  34.15 
 
 
241 aa  87.8  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  30.86 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>