More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3418 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3418  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 373 aa  749    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2685  hypothetical protein  77.15 
 
 		 373 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1505  ABC-2 type transporter  73.39 
 
 		 373 aa  553  1e-156  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.366767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0626  ABC-2 type transporter  73.92 
 
 		 373 aa  530  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2362  ABC-2 type transporter  70.92 
 
 		 382 aa  524  1e-148  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0759041  normal  0.863187 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1496  ABC-2 type transporter  70.65 
 
 		 382 aa  522  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.679397  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1349  ABC transporter, permease protein, putative  71.04 
 
 		 370 aa  514  1.0000000000000001e-145  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1825  ABC-2 type transporter  70.77 
 
 		 370 aa  508  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0526143  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1307  putative ABC transporter, permease protein  70.49 
 
 		 370 aa  510  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4914  ABC-2 type transporter  68.58 
 
 		 370 aa  506  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1951  ABC-2 type transporter  68.82 
 
 		 373 aa  503  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3447  ABC-2 type transporter  68.29 
 
 		 376 aa  502  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0565648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0758  ABC-2 type transporter  69.92 
 
 		 376 aa  491  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3854  ABC transporter ATP-binding protein  68.21 
 
 		 374 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3787  ABC transporter, ATP-binding protein  68.21 
 
 		 374 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3777  ABC transporter ATP-binding protein  68.02 
 
 		 374 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.439357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0169  hypothetical protein  66.49 
 
 		 371 aa  484  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3957  ABC transporter ATP-binding protein  68.21 
 
 		 374 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3576  hypothetical protein  64.85 
 
 		 370 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3897  ABC transporter ATP-binding protein  67.93 
 
 		 374 aa  484  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0166  hypothetical protein  66.67 
 
 		 374 aa  484  1e-135  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000154077 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2181  ABC-2 type transporter  66.4 
 
 		 374 aa  478  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64312  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4687  ABC-2 type transporter  65.94 
 
 		 370 aa  480  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.696171  normal  0.325536 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03335  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  66.03 
 
 		 374 aa  475  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0229  ABC-2 type transporter  66.03 
 
 		 374 aa  475  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3967  ABC transporter, ATP-binding protein  66.3 
 
 		 374 aa  476  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03287  hypothetical protein  66.03 
 
 		 374 aa  475  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16770  ABC-2 type transporter, permease component  61.52 
 
 		 372 aa  474  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00841824  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4830  ABC transporter, ATP-binding protein  66.03 
 
 		 374 aa  474  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3774  ABC transporter, ATP-binding protein  66.3 
 
 		 374 aa  476  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3837  ABC transporter, ATP-binding protein  66.03 
 
 		 374 aa  475  1e-133  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3684  ABC transporter, ATP-binding protein  65.76 
 
 		 374 aa  473  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0230  ABC-2 type transporter  65.76 
 
 		 374 aa  473  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1308  ABC transporter, permease protein  66.58 
 
 		 374 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0138  ABC transporter, permease  66.58 
 
 		 374 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0164  ABC transporter, permease protein  66.58 
 
 		 374 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0920361  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4663  hypothetical protein  67.85 
 
 		 370 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.736815  normal  0.215518 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1683  multidrug ABC transporter permease component  66.12 
 
 		 397 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0017586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3659  putative ABC transporter (permease protein)  65.57 
 
 		 370 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00759514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69060  putative permease of ABC transporter  64.88 
 
 		 374 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1040  ABC transporter, permease  66.04 
 
 		 374 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0437  ABC transporter, permease  66.04 
 
 		 374 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5973  ABC transporter permease  64.88 
 
 		 374 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0171  hypothetical protein  66.67 
 
 		 375 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2777  ABC-type multidrug transport system, permease component  66.31 
 
 		 374 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2634  ABC transporter, permease protein  66.31 
 
 		 374 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2341  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  64.96 
 
 		 374 aa  456  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.612393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0315  ABC-2 type transporter  67.75 
 
 		 374 aa  442  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1431  hypothetical protein  61.41 
 
 		 371 aa  440  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6205  ABC-2 type transporter  63.34 
 
 		 374 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.261883 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5884  ABC-2 type transporter  64.58 
 
 		 374 aa  421  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00132  putative ABC transport protein  56.72 
 
 		 373 aa  419  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0988  hypothetical protein  57.57 
 
 		 374 aa  417  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.564547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1150  ABC-2 type transporter  58.15 
 
 		 412 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.13202  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0811  ABC-2 type transporter  54.74 
 
 		 375 aa  394  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0019  ABC-2 type transporter  56.4 
 
 		 373 aa  392  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7848  putative ABC transporter (permease protein)  56.75 
 
 		 376 aa  388  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00792305  normal  0.174905 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5116  ABC-2 type transporter  52.16 
 
 		 370 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.75858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5269  ABC-2 type transporter  51.89 
 
 		 370 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139137  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5208  ABC transporter  51.89 
 
 		 370 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3789  ABC-2 type transporter  52.57 
 
 		 390 aa  371  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0566  ABC-2 type transporter  53.41 
 
 		 399 aa  371  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0501  ABC-2 type transporter  53.41 
 
 		 399 aa  371  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0537  ABC-2 type transporter  53.41 
 
 		 398 aa  365  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5443  hypothetical protein  52.16 
 
 		 372 aa  362  6e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889571 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4844  ABC-2 type transporter  50.96 
 
 		 375 aa  362  8e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0699099 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1562  ABC-2 type transporter  48.91 
 
 		 374 aa  360  3e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.986622  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2949  ABC-2 type transporter  53.65 
 
 		 382 aa  359  5e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1742  ABC-2 type transporter  51.09 
 
 		 401 aa  359  6e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00338931 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0557  hypothetical protein  51.47 
 
 		 379 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0080  ABC-2 type transporter  53.41 
 
 		 379 aa  349  5e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0879828  normal  0.577589 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0750  ABC-2 type transporter  48.63 
 
 		 375 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212958  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5749  ABC-2 type transporter  48.21 
 
 		 375 aa  341  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.166668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1613  ABC-2 type transporter  46.63 
 
 		 374 aa  339  5e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0209  ABC-2 type transporter  49.86 
 
 		 393 aa  338  7e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9218  ABC transporter  43.99 
 
 		 374 aa  328  8e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.797463  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3879  ABC transporter  47.98 
 
 		 350 aa  308  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3215  hypothetical protein  40.76 
 
 		 374 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3157  ABC transporter, inner membrane subunit  42.62 
 
 		 374 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00527406  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3895  ABC-2 type transporter  42.35 
 
 		 374 aa  281  9e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.505485  normal  0.0804287 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1136  hypothetical protein  32.53 
 
 		 381 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  32.22 
 
 		 378 aa  157  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  30.03 
 
 		 377 aa  157  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  31.64 
 
 		 376 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  29.29 
 
 		 377 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1910  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  30.79 
 
 		 376 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170149  normal  0.0809617 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  28.23 
 
 		 376 aa  140  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  29.81 
 
 		 372 aa  139  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  27.05 
 
 		 375 aa  139  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  28.07 
 
 		 376 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  27.79 
 
 		 376 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  27.79 
 
 		 376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  29.87 
 
 		 368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  26.43 
 
 		 376 aa  134  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  30.98 
 
 		 369 aa  134  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  29.51 
 
 		 370 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  29.33 
 
 		 376 aa  133  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  31.16 
 
 		 376 aa  132  7.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  29.22 
 
 		 373 aa  132  9e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  26.72 
 
 		 368 aa  129  7.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>