170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2996 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2996  rhamnosyltransferase  100 
 
 		 321 aa  654    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2177  rhamnosyltransferase  36.36 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0541  rhamnosyltransferase  36.33 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.524826  normal  0.174898 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0882  rhamnosyltransferase  34.53 
 
 		 298 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0629  rhamnosyltransferase  34.8 
 
 		 308 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2315  rhamnosyltransferase  35.76 
 
 		 303 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.10741 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0964  glycosyl transferase family protein  29.47 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.281177  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1610  glycosyl transferase family protein  32.67 
 
 		 295 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.151878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3054  glycosyltransferase-like protein  31.21 
 
 		 303 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0393  rhamnosyltransferase  33.09 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0875  rhamnosyltransferase  33.09 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0846  rhamnosyltransferase  33.09 
 
 		 299 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0700283 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03053  Rhamnosyltransferase  28.96 
 
 		 292 aa  120  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.753306  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3205  rhamnosyltransferase  28.81 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.363372  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2685  glycosyl transferase family protein  30.06 
 
 		 299 aa  100  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0288  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 		 329 aa  97.8  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5332  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 		 321 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1148  glycosyltransferase  27.36 
 
 		 293 aa  96.7  5e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000022742  hitchhiker  0.00000000318064 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1411  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.3 
 
 		 282 aa  91.7  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  26.98 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2565  glycosyl transferase family 2  29.08 
 
 		 322 aa  90.5  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2416  glycosyl transferase family 2  27.43 
 
 		 309 aa  90.1  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.518239 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5218  rhamnosyltransferase  25.16 
 
 		 305 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8183  glycosyl transferase family 2  28.48 
 
 		 295 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.123553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0814  rhamnosyltransferase  28.63 
 
 		 335 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0467732  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1917  rhamnosyltransferase II  28.63 
 
 		 335 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0281332  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0371  rhamnosyltransferase II  28.74 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110599  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0462  rhamnosyltransferase II  28.74 
 
 		 331 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.103528  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0923  rhamnosyltransferase family protein  28.74 
 
 		 331 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0852562  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2097  rhamnosyltransferase II  28.74 
 
 		 331 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0099449  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0459  rhamnosyltransferase family protein  28.74 
 
 		 331 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0720  rhamnosyltransferase II  28.74 
 
 		 331 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000325438  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1079  rhamnosyltransferase family protein  28.69 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0415995  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1877  rhamnosyltransferase family protein  28.69 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.303567  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0728  rhamnosyltransferase  28.34 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1829  rhamnosyltransferase  28.34 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0189  dTDP-rhamnosyl transferase rfbf protein  28.34 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1016  rhamnosyltransferase II  28.34 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.940523  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1419  rhamnosyltransferase family protein  28.34 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646273  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1990  rhamnosyltransferase II  28.34 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00265591  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1200  WbwY  24.01 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.771047  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 		 455 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  25.12 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49760  rhamnosyltransferase 2  26.42 
 
 		 325 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5951  rhamnosyltransferase  28.86 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831298  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5030  rhamnosyltransferase  26.23 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.990279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5189  rhamnosyltransferase  27.05 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4930  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.17 
 
 		 289 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.356982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8185  glycosyl transferase family 2  24.67 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  26.94 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0560  rhamnosyltransferase  26.64 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3275  rhamnosyltransferase  27.05 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0196034  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5093  rhamnosyltransferase  27.05 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.491648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  25.32 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1578  rhamnosyltransferase  25.89 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.700972 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3720  putative glycosyl transferase  27.34 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4505  rhamnosyltransferase  26.64 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.661015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3502  rhamnosyltransferase  35.71 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.099616 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  26.13 
 
 		 311 aa  71.6  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3625  rhamnosyltransferase  28.62 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.896499  normal  0.372836 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3302  rhamnosyltransferase  35.45 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  23.63 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0633  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.26 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0687  dTDP-rhamnosyl transferase rfbf protein  27.27 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  21.75 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  27.23 
 
 		 284 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  25.58 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6236  rhamnosyltransferase  25 
 
 		 294 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6405  rhamnosyltransferase  25 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6638  rhamnosyltransferase  25 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.204482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  24.59 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3397  rhamnosyltransferase  24.07 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385877  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 314 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8190  glycosyl transferase family 2  24.04 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  23.97 
 
 		 300 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0313  rhamnosyl transferase related protein  24.86 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0691397 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  23.74 
 
 		 320 aa  62.4  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2023  family 2 glycosyl transferase  26.35 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  22.73 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1694  glycosyl transferase family protein  25.79 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.128471  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2264  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.503819  normal  0.135779 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1643  glycosyl transferase family 2  24.08 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  24 
 
 		 489 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  25.59 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4452  glycosyl transferase family 2  23.86 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1468  glycosyl transferase family protein  24.58 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0257921 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0081  glycosyl transferase family 2  23.17 
 
 		 340 aa  57  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2648  glycosyl transferase family protein  25.43 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.747467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  26.94 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 		 322 aa  55.8  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0078  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.38 
 
 		 327 aa  55.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.780673  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  25.62 
 
 		 1435 aa  55.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1399  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 		 315 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  25.61 
 
 		 329 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  22.26 
 
 		 290 aa  53.5  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  26.55 
 
 		 722 aa  53.1  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0693  glycosyl transferase family 2  22.27 
 
 		 277 aa  53.1  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>