More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4735 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_7043  replicative DNA helicase  65.95 
 
 		 772 aa  972    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3688  replicative DNA helicase  59.72 
 
 		 1118 aa  796    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5366  DnaB helicase-like protein  65.24 
 
 		 782 aa  999    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4735  replicative DNA helicase  100 
 
 		 749 aa  1522    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4657  DnaB domain-containing protein  56.66 
 
 		 824 aa  825    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.186052  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5455  DnaB domain-containing protein  65.24 
 
 		 782 aa  999    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.049604  normal  0.0110505 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0878  DnaB domain-containing protein  63 
 
 		 879 aa  513  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6030  DnaB domain-containing protein  63.44 
 
 		 863 aa  510  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5063  replicative DNA helicase  62.7 
 
 		 871 aa  463  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.946946  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4838  replicative DNA helicase  61.84 
 
 		 865 aa  445  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5363  replicative DNA helicase  75.43 
 
 		 832 aa  443  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4942  replicative DNA helicase  63.43 
 
 		 939 aa  421  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4164  replicative DNA helicase  84.21 
 
 		 469 aa  408  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39470  primary replicative DNA helicase  84.07 
 
 		 459 aa  395  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0340273  normal  0.250985 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5742  replicative DNA helicase  81.42 
 
 		 460 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1893  DnaB domain-containing protein  33.33 
 
 		 807 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  0.0000000100629  unclonable  0.0000000000808467 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3033  DnaB-like helicase-like  32.3 
 
 		 821 aa  383  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.00000237623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5469  replicative DNA helicase  77.92 
 
 		 448 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.430835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5868  replicative DNA helicase  77.92 
 
 		 464 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10057  replicative DNA helicase  79.3 
 
 		 874 aa  372  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.66357e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5558  replicative DNA helicase  77.63 
 
 		 464 aa  372  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9348  replicative DNA helicase  74.78 
 
 		 451 aa  359  9.999999999999999e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0424  DnaB domain-containing protein  32.04 
 
 		 831 aa  357  3.9999999999999996e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000384079  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0019  primary replicative DNA helicase  75 
 
 		 449 aa  354  2.9999999999999997e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3553  replicative DNA helicase  74.34 
 
 		 454 aa  352  2e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.520185 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3350  replicative DNA helicase  73.33 
 
 		 453 aa  350  5e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02520  primary replicative DNA helicase  73.25 
 
 		 455 aa  348  2e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7308  replicative DNA helicase  73.89 
 
 		 452 aa  348  3e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036629  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0332  replicative DNA helicase  71.86 
 
 		 460 aa  347  5e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37750  primary replicative DNA helicase  72.89 
 
 		 461 aa  343  5.999999999999999e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4552  replicative DNA helicase  71.49 
 
 		 468 aa  343  9e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.355354  normal  0.656762 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4518  primary replicative DNA helicase  71.68 
 
 		 452 aa  340  7e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0137  replicative DNA helicase  73.45 
 
 		 474 aa  338  1.9999999999999998e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174045  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4175  replicative DNA helicase  70.93 
 
 		 457 aa  338  1.9999999999999998e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23150  primary replicative DNA helicase  69.16 
 
 		 462 aa  336  1e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.749598  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2083  primary replicative DNA helicase  69.91 
 
 		 452 aa  335  2e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2519  replicative DNA helicase  68.44 
 
 		 457 aa  330  7e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.662901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4110  primary replicative DNA helicase  67.7 
 
 		 460 aa  327  6e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3883  replicative DNA helicase  67.56 
 
 		 461 aa  326  1e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000215257 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03060  primary replicative DNA helicase  65.93 
 
 		 480 aa  311  2e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.602347  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4333  replicative DNA helicase  69.86 
 
 		 903 aa  304  3.0000000000000004e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00796105  normal  0.47145 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5064  replicative DNA helicase  63.93 
 
 		 844 aa  295  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360056 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0075  replicative DNA helicase  64.44 
 
 		 481 aa  295  3e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000995062 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1232  replicative DNA helicase  64 
 
 		 509 aa  292  1e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  43.89 
 
 		 449 aa  232  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  44.27 
 
 		 449 aa  231  5e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  47.35 
 
 		 445 aa  226  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  45.58 
 
 		 444 aa  226  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  46.82 
 
 		 481 aa  225  3e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  36.59 
 
 		 446 aa  224  3e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  43.35 
 
 		 449 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  44.25 
 
 		 442 aa  222  1.9999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  43.08 
 
 		 441 aa  222  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  47.47 
 
 		 481 aa  221  3.9999999999999997e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0330  DnaB helicase  45.9 
 
 		 450 aa  219  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.850269  normal  0.345432 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  45.13 
 
 		 442 aa  219  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1693  replicative DNA helicase  45.85 
 
 		 470 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  37.58 
 
 		 449 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  35.34 
 
 		 453 aa  218  4e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  37.58 
 
 		 453 aa  217  5e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  37.27 
 
 		 453 aa  217  7e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  37.27 
 
 		 453 aa  217  7e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  37.27 
 
 		 453 aa  217  7e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  37.27 
 
 		 453 aa  217  7e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  37.27 
 
 		 453 aa  217  7e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  37.27 
 
 		 453 aa  217  7e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  37.27 
 
 		 453 aa  217  8e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  41.15 
 
 		 440 aa  217  8e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5618  replicative DNA helicase  45.37 
 
 		 318 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000715712  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0006  replicative DNA helicase  44.23 
 
 		 471 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  47.14 
 
 		 454 aa  216  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  46.7 
 
 		 454 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  37.79 
 
 		 458 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  44.05 
 
 		 444 aa  214  5.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  49.33 
 
 		 456 aa  214  7e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6265  replicative DNA helicase  49.56 
 
 		 441 aa  213  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0852  primary replicative DNA helicase  47.23 
 
 		 443 aa  212  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5914  replicative DNA helicase  43.86 
 
 		 453 aa  212  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  45.13 
 
 		 471 aa  211  3e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  45.13 
 
 		 471 aa  211  3e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1325  primary replicative DNA helicase  43.86 
 
 		 454 aa  210  6e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  44.84 
 
 		 448 aa  210  7e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  44.1 
 
 		 447 aa  210  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0972  replicative DNA helicase  44.49 
 
 		 456 aa  209  1e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  44.21 
 
 		 460 aa  209  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  48.18 
 
 		 456 aa  208  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  48.17 
 
 		 456 aa  207  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1916  replicative DNA helicase  46.9 
 
 		 529 aa  207  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  42.17 
 
 		 442 aa  207  7e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  43.93 
 
 		 456 aa  207  7e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  43.81 
 
 		 476 aa  207  8e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  43.81 
 
 		 476 aa  206  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2442  replicative DNA helicase  44.93 
 
 		 457 aa  206  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3095  replicative DNA helicase  44.83 
 
 		 446 aa  206  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0322768  normal  0.184151 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  44.93 
 
 		 457 aa  206  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0948  hypothetical protein  43.53 
 
 		 509 aa  206  2e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  33.84 
 
 		 453 aa  205  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  46.63 
 
 		 456 aa  205  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000016213  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0655  replicative DNA helicase  45.85 
 
 		 447 aa  205  3e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.329356  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1349  primary replicative DNA helicase  41.88 
 
 		 513 aa  204  4e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00606931  normal  0.114778 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>