More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2685 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 120 aa  244  4e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  94.17 
 
 		 120 aa  231  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  65.93 
 
 		 116 aa  128  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  63.54 
 
 		 113 aa  128  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  61.29 
 
 		 123 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  62.39 
 
 		 123 aa  127  6e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  64.44 
 
 		 104 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  64.29 
 
 		 118 aa  123  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  68.35 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  61.9 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  60.2 
 
 		 112 aa  120  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  65.17 
 
 		 183 aa  120  9e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  60 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  58.49 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  60.44 
 
 		 125 aa  117  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  60.44 
 
 		 125 aa  117  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  60.44 
 
 		 125 aa  117  7e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  68.54 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  57.78 
 
 		 119 aa  113  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  64.29 
 
 		 105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  60.47 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  55.91 
 
 		 124 aa  111  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  58.06 
 
 		 127 aa  111  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  57.61 
 
 		 129 aa  110  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  55.43 
 
 		 131 aa  110  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  53.76 
 
 		 123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  59.52 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  51.52 
 
 		 336 aa  107  7.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  54.22 
 
 		 349 aa  102  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  52.75 
 
 		 132 aa  101  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  55.42 
 
 		 347 aa  100  8e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  51.55 
 
 		 116 aa  100  9e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  59.74 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  55.7 
 
 		 125 aa  99.4  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 125 aa  99  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  57.89 
 
 		 127 aa  97.8  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  57.5 
 
 		 137 aa  97.4  5e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  44.66 
 
 		 337 aa  97.4  5e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  54.43 
 
 		 125 aa  97.1  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  52.94 
 
 		 337 aa  96.7  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  53.85 
 
 		 116 aa  96.7  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  57.5 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  53.33 
 
 		 95 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  55.7 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 136 aa  94.7  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  57.33 
 
 		 127 aa  94  7e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  58.9 
 
 		 116 aa  93.2  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  47.13 
 
 		 120 aa  93.2  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  56.1 
 
 		 124 aa  90.9  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  53.01 
 
 		 127 aa  90.9  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  49.46 
 
 		 120 aa  87  8e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  46.81 
 
 		 121 aa  87  9e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  53.25 
 
 		 117 aa  86.7  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  44.32 
 
 		 109 aa  86.7  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  49.37 
 
 		 120 aa  85.5  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 119 aa  82.8  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  46.34 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.87 
 
 		 93 aa  80.9  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  48.24 
 
 		 120 aa  80.5  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  47.73 
 
 		 97 aa  78.2  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0788  regulatory protein ArsR  47.44 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1390  transcriptional regulator, ArsR family  43.21 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000534285  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12658  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2532  ArsR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76201  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  46.91 
 
 		 92 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  38.38 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2679  regulatory protein ArsR  46.15 
 
 		 120 aa  73.9  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00320886  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0711  ArsR family transcriptional regulator  62 
 
 		 68 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3045  ArsR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  45.24 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3189  arsenical resistance operon repressor  46.27 
 
 		 101 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3014  ArsR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0824395  normal  0.0135705 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3210  arsenical resistence operon repressor ArsR  44.78 
 
 		 101 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.14764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2974  arsenical resistance operon repressor  44.78 
 
 		 101 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00402764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2966  arsenical resistance operon repressor  44.78 
 
 		 101 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2901  arsenical resistance operon repressor  44.78 
 
 		 101 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3224  arsenical resistance operon repressor  44.78 
 
 		 101 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.336922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3199  arsenical resistance operon repressor  44.78 
 
 		 101 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2922  ArsR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 101 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2999  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 130 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3204  arsenical resistance operon repressor  41.89 
 
 		 101 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 105 aa  71.2  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  51.47 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2426  ArsR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 97 aa  70.9  0.000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.575206  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  43.02 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2059  arsenical resistance operon repressor  44.78 
 
 		 101 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  43.04 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0492  transcriptional regulator, ArsR family  46.03 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483938  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1652  regulatory protein, ArsR  47.44 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000800297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2767  ArsR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  43.59 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  34.83 
 
 		 90 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>