More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2548 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1625  aminotransferase class V  72.34 
 
 		 499 aa  781    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2548  aminotransferase class V  100 
 
 		 499 aa  1038    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2795  aminotransferase, class V  53.93 
 
 		 495 aa  581  1e-164  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3175  aminotransferase class V  57.11 
 
 		 492 aa  562  1.0000000000000001e-159  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3990  aminotransferase, class V  54.91 
 
 		 494 aa  555  1e-157  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.941199  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2014  aminotransferase, class V  54.37 
 
 		 502 aa  554  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3637  aminotransferase class V  42.47 
 
 		 570 aa  377  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2695  aminotransferase, class V  42.92 
 
 		 570 aa  377  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.370695  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3433  aminotransferase class V  43.86 
 
 		 568 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3497  aminotransferase class V  43.86 
 
 		 573 aa  356  5e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3351  aminotransferase, putative  43.64 
 
 		 570 aa  353  4e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3419  aminotransferase class V  41.51 
 
 		 571 aa  346  7e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.421633  normal  0.0439943 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0469  aminotransferase, class V  42.61 
 
 		 551 aa  340  2e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1443  aminotransferase class V  40 
 
 		 557 aa  335  1e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2103  aminotransferase, class V  38.99 
 
 		 474 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1389  aminotransferase class V  37.26 
 
 		 491 aa  300  3e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0409  aminotransferase, class V  37.1 
 
 		 473 aa  271  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.950818 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0634  aminotransferase class V  35.8 
 
 		 421 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39592  predicted protein  36.35 
 
 		 495 aa  256  5e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.342463  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0160  putative aminotransferase  34.39 
 
 		 442 aa  250  4e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0398  tetrahydrodipicolinate N-succinyltransferase  34.09 
 
 		 442 aa  246  9.999999999999999e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0214  putative aminotransferase  31.77 
 
 		 441 aa  228  2e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0593  conserved hypothetical protein, putative NifS-like aminotransferase  31.37 
 
 		 421 aa  220  3.9999999999999997e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000269729  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1236  putative aminotransferase  30.7 
 
 		 426 aa  219  6e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1221  aminotransferase, putative  31.84 
 
 		 422 aa  213  4.9999999999999996e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2656  Cysteine desulfurase  31 
 
 		 501 aa  210  4e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.596375  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0812  aminotransferase, putative  31.13 
 
 		 422 aa  207  4e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.4562  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0882  aminotransferase, putative  30.9 
 
 		 422 aa  206  5e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0080  putative aminotransferase  29.43 
 
 		 433 aa  200  3.9999999999999996e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0692072  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0811  Cysteine desulfurase  30.71 
 
 		 452 aa  170  7e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20010  Cysteine desulfurase  28.76 
 
 		 442 aa  162  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000584034  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0201  aminotransferase, class V  26.43 
 
 		 485 aa  140  4.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.4286 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.93 
 
 		 406 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.95 
 
 		 406 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  27.6 
 
 		 408 aa  133  6e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.09 
 
 		 412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2429  cysteine desulfurase  27.33 
 
 		 470 aa  130  5.0000000000000004e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  27.78 
 
 		 421 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3674  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.74 
 
 		 419 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  27.91 
 
 		 420 aa  126  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  26.52 
 
 		 413 aa  124  3e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.14 
 
 		 417 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  28.37 
 
 		 405 aa  121  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0546  Cysteine desulfurase  27.56 
 
 		 429 aa  120  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.53 
 
 		 413 aa  120  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.53 
 
 		 413 aa  120  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.64 
 
 		 419 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  31.29 
 
 		 417 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  26.95 
 
 		 682 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  27.48 
 
 		 414 aa  118  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  27.96 
 
 		 395 aa  118  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.76 
 
 		 406 aa  118  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.11 
 
 		 444 aa  118  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1720  aminotransferase, class V  26.69 
 
 		 428 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.116446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  27.51 
 
 		 406 aa  117  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  27.51 
 
 		 406 aa  117  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2439  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.69 
 
 		 417 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2484  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.69 
 
 		 417 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.585611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  27.51 
 
 		 406 aa  117  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2475  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.43 
 
 		 417 aa  117  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659693  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  27.51 
 
 		 406 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  27.51 
 
 		 406 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1448  aminotransferase, class V  26.69 
 
 		 428 aa  116  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  27.25 
 
 		 406 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.23 
 
 		 662 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.51 
 
 		 406 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  27.25 
 
 		 406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  27.25 
 
 		 406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  27.25 
 
 		 406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.36 
 
 		 414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  27.22 
 
 		 688 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.75 
 
 		 411 aa  114  5e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.46 
 
 		 414 aa  113  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2736  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.87 
 
 		 415 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.03 
 
 		 657 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  30.03 
 
 		 879 aa  113  9e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5150  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.34 
 
 		 425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5682  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.7 
 
 		 560 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.11 
 
 		 413 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  30.12 
 
 		 393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.4 
 
 		 415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.68 
 
 		 425 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.52 
 
 		 414 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.99 
 
 		 885 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4001  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.35 
 
 		 666 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.077192 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.56 
 
 		 404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2656  cysteine desulfurase  26.88 
 
 		 470 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.35 
 
 		 650 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0488  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.41 
 
 		 774 aa  111  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.34 
 
 		 404 aa  111  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  29.41 
 
 		 896 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1675  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.46 
 
 		 449 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  27.2 
 
 		 429 aa  110  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2389  Cysteine desulfurase  26.81 
 
 		 472 aa  110  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000376862 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2622  cysteine desulphurases, SufS  27.08 
 
 		 666 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  27.62 
 
 		 410 aa  110  7.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  27.37 
 
 		 626 aa  110  8.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.18 
 
 		 451 aa  109  9.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.97 
 
 		 414 aa  109  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  27.91 
 
 		 661 aa  109  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.493291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>