100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2539 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2539  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 
398 aa  829  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2918  Saccharopine dehydrogenase  86.18 
 
 
398 aa  701  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1676  Saccharopine dehydrogenase  92.46 
 
 
398 aa  768  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0203222  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2607  saccharopine dehydrogenase  89.7 
 
 
398 aa  754  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0902  saccharopine dehydrogenase  94.72 
 
 
397 aa  787  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  1.68136e-06 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0981  saccharopine dehydrogenase  90.45 
 
 
398 aa  742  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0620633  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1307  Saccharopine dehydrogenase  86.18 
 
 
399 aa  709  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.84986e-15 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2095  saccharopine dehydrogenase-like protein  85.71 
 
 
399 aa  728  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1597  Acyl carrier protein (ACP)  72.89 
 
 
399 aa  600  1e-170  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30891  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2320  Saccharopine dehydrogenase  70.89 
 
 
396 aa  595  1e-169  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2516  saccharopine dehydrogenase  72.15 
 
 
396 aa  582  1e-165  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.558897  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0148  Saccharopine dehydrogenase  70.26 
 
 
409 aa  582  1e-165  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1535  Saccharopine dehydrogenase  70.38 
 
 
396 aa  575  1e-163  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.82797 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0572  saccharopine dehydrogenase  68.46 
 
 
398 aa  572  1e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0125  Saccharopine dehydrogenase  70.6 
 
 
403 aa  559  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3052  saccharopine dehydrogenase  63.75 
 
 
399 aa  535  1e-151  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1790  saccharopine dehydrogenase  63.85 
 
 
401 aa  531  1e-150  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4440  saccharopine dehydrogenase  64.56 
 
 
401 aa  529  1e-149  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1555  Saccharopine dehydrogenase  63.24 
 
 
401 aa  525  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.42738e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1201  saccharopine dehydrogenase  64.71 
 
 
402 aa  526  1e-148  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.150944  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1922  saccharopine dehydrogenase  66.06 
 
 
392 aa  524  1e-147  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00339893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3519  Saccharopine dehydrogenase  63.17 
 
 
405 aa  518  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368548  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1128  Saccharopine dehydrogenase  63.5 
 
 
399 aa  521  1e-146  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.785881  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0677  saccharopine dehydrogenase  62.53 
 
 
397 aa  515  1e-145  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.10466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2888  Saccharopine dehydrogenase  62.92 
 
 
403 aa  513  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.120454 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0748  saccharopine dehydrogenase  61.06 
 
 
400 aa  513  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0999  saccharopine dehydrogenase  62.18 
 
 
405 aa  510  1e-143  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0445398  hitchhiker  0.00533099 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6504  Saccharopine dehydrogenase  65.32 
 
 
395 aa  510  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.752719  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0747  saccharopine dehydrogenase  61.54 
 
 
403 aa  504  1e-141  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  4.18334e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03351  Carboxynorspermidine dehydrogenase  61.32 
 
 
400 aa  504  1e-141  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00142848  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2142  Saccharopine dehydrogenase  60.25 
 
 
404 aa  493  1e-138  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0415  saccharopine dehydrogenase  59.7 
 
 
405 aa  488  1e-137  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1081  saccharopine dehydrogenase  59.95 
 
 
399 aa  489  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.706576  normal  0.0928318 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0061  saccharopine dehydrogenase  58.23 
 
 
403 aa  487  1e-136  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0285  saccharopine dehydrogenase  58.73 
 
 
404 aa  483  1e-135  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1181  saccharopine dehydrogenase  58.91 
 
 
394 aa  484  1e-135  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.886294  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0208  saccharopine dehydrogenase  57.72 
 
 
401 aa  481  1e-134  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.69447  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0165  saccharopine dehydrogenase  57.47 
 
 
401 aa  478  1e-133  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0186  saccharopine dehydrogenase  57.47 
 
 
401 aa  478  1e-133  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0458  saccharopine dehydrogenase  56.96 
 
 
401 aa  476  1e-133  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003102  carboxynorspermidine dehydrogenase putative  45.2 
 
 
414 aa  352  7e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1380  saccharopine dehydrogenase  44.39 
 
 
412 aa  347  1e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000104449  normal  0.291708 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02740  hypothetical protein  44.95 
 
 
417 aa  347  2e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1231  hypothetical protein  43.94 
 
 
414 aa  345  1e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.292e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2884  saccharopine dehydrogenase  44.78 
 
 
412 aa  343  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0352  hypothetical protein  44.14 
 
 
413 aa  341  2e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0126  saccharopine dehydrogenase  44.91 
 
 
412 aa  339  6e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.281282 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1475  saccharopine dehydrogenase family protein  44.91 
 
 
412 aa  339  6e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0335  hypothetical protein  43.89 
 
 
413 aa  337  1e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2289  saccharopine dehydrogenase  44.33 
 
 
405 aa  338  1e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.772575  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5844  hypothetical protein  43.64 
 
 
413 aa  337  2e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0438  saccharopine dehydrogenase  43.14 
 
 
426 aa  335  7e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0417875  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2137  saccharopine dehydrogenase  43.18 
 
 
414 aa  335  7e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0299628  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0988  saccharopine dehydrogenase  42.43 
 
 
413 aa  330  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  5.77497e-06 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2764  saccharopine dehydrogenase  42.18 
 
 
414 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114818  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2928  saccharopine dehydrogenase  42.18 
 
 
414 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0028  saccharopine dehydrogenase  41.79 
 
 
412 aa  325  1e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4157  saccharopine dehydrogenase  41.77 
 
 
413 aa  322  5e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152115  normal  0.83779 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0914  putative saccharopine dehydrogenase family protein  42.57 
 
 
424 aa  315  9e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.867111  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1715  saccharopine dehydrogenase  42.36 
 
 
422 aa  315  1e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  6.59439e-10  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1501  saccharopine dehydrogenase  42.33 
 
 
424 aa  313  5e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2844  saccharopine dehydrogenase  40.82 
 
 
399 aa  308  1e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.241943 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2125  saccharopine dehydrogenase  40.82 
 
 
399 aa  308  1e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530272  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2955  saccharopine dehydrogenase  40.95 
 
 
407 aa  297  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1950  hypothetical protein  32.66 
 
 
408 aa  206  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3221  saccharopine dehydrogenase  31.76 
 
 
407 aa  198  2e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4946  saccharopine dehydrogenase  30.5 
 
 
407 aa  183  4e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5034  saccharopine dehydrogenase  30.5 
 
 
407 aa  183  4e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5327  saccharopine dehydrogenase  30.5 
 
 
407 aa  182  7e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0356987  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3295  Saccharopine dehydrogenase  30.42 
 
 
403 aa  179  6e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.886794  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4677  Saccharopine dehydrogenase  31.69 
 
 
401 aa  169  9e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  23.86 
 
 
398 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  25.26 
 
 
415 aa  93.2  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  23.99 
 
 
384 aa  82.4  1e-14  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  27.75 
 
 
367 aa  79.7  8e-14  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  26.03 
 
 
378 aa  79  1e-13  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1202  saccharopine dehydrogenase  23.78 
 
 
403 aa  73.2  7e-12  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  25.19 
 
 
385 aa  72  2e-11  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  30.9 
 
 
376 aa  71.2  3e-11  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  6.91069e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3399  Saccharopine dehydrogenase  26.74 
 
 
350 aa  67.8  3e-10  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  23.88 
 
 
384 aa  66.2  8e-10  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5058  saccharopine dehydrogenase  21.82 
 
 
369 aa  60.1  7e-08  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34724  predicted protein  26.3 
 
 
454 aa  57.4  4e-07  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227294  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1941  Saccharopine dehydrogenase  25.54 
 
 
446 aa  55.5  2e-06  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  20.54 
 
 
413 aa  50.1  7e-05  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1242  saccharopine dehydrogenase  23.49 
 
 
394 aa  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0633  hypothetical protein  24.43 
 
 
367 aa  47.8  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.419888  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  28.93 
 
 
748 aa  47.8  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3712  saccharopine dehydrogenase  24.43 
 
 
367 aa  47.8  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1342  hypothetical protein  22.55 
 
 
394 aa  47  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1416  hypothetical protein  22.55 
 
 
394 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.572078 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1241  hypothetical protein  22.55 
 
 
394 aa  47  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1217  saccharopine dehydrogenase, NADP+, L-lysine forming; L-lysine dehydrogenase  22.55 
 
 
394 aa  47  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1219  saccharopine dehydrogenase, NADP+, L-lysine forming; L-lysine dehydrogenase  21.25 
 
 
394 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.182404  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1424  potassium efflux system protein  27.37 
 
 
371 aa  47  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1441  hypothetical protein  23.35 
 
 
394 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001157  putative integral membrane protein  29.5 
 
 
360 aa  46.2  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1482  hypothetical protein  26.06 
 
 
394 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0657  saccharopine dehydrogenase  22.91 
 
 
346 aa  43.5  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3965  hypothetical protein  21.64 
 
 
394 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>