More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0008 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0007  sensory box histidine kinase  49.08 
 
 
762 aa  695  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0008  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
755 aa  1545  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865749 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  58.27 
 
 
758 aa  895  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0009  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.7 
 
 
763 aa  679  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.508031  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  92.19 
 
 
754 aa  1425  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.57 
 
 
944 aa  222  2e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 
590 aa  211  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 
458 aa  207  6e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
444 aa  207  9e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 
612 aa  204  4e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0530317 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0336  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
612 aa  204  5e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.84228  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  34.46 
 
 
1629 aa  204  6e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 
885 aa  203  8e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  29.23 
 
 
621 aa  202  2e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.39 
 
 
2161 aa  201  6e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.354922 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 
594 aa  200  1e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.43993e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.83 
 
 
1002 aa  199  2e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.4 
 
 
609 aa  198  2e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
571 aa  197  5e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 
608 aa  196  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0020  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 
621 aa  193  9e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1987  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 
577 aa  192  3e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 
625 aa  191  6e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 
555 aa  189  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18999  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 
587 aa  189  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.43 
 
 
611 aa  189  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.3 
 
 
1207 aa  188  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0857  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 
698 aa  187  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0897898 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 
2153 aa  187  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4104  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.71 
 
 
557 aa  187  6e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3278  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 
645 aa  187  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.179777 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  26.07 
 
 
613 aa  187  7e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  7.19997e-07  hitchhiker  9.90225e-13 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.96 
 
 
619 aa  186  2e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.1 
 
 
612 aa  185  2e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.7 
 
 
933 aa  185  2e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  3.59369e-05 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 
1021 aa  184  5e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 
489 aa  183  8e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  26.11 
 
 
599 aa  183  9e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 
584 aa  183  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 
599 aa  183  1e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.54 
 
 
453 aa  183  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 
596 aa  182  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  28.66 
 
 
581 aa  182  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.65 
 
 
1043 aa  181  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 
884 aa  181  6e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0068  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.8 
 
 
604 aa  181  6e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 
589 aa  181  7e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 
584 aa  180  7e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 
1291 aa  179  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2503  ATP-binding region ATPase domain protein  27.19 
 
 
586 aa  180  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.626629  normal  0.221976 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.94 
 
 
597 aa  179  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1949  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.08 
 
 
623 aa  179  2e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  28.23 
 
 
581 aa  178  3e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 
581 aa  178  3e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 
593 aa  178  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 
590 aa  178  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4463  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 
839 aa  178  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5588  sensory box histidine kinase YycG  26.27 
 
 
613 aa  178  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.8382  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5614  sensory box histidine kinase YycG  26.27 
 
 
613 aa  177  5e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5162  sensor histidine kinase  26.27 
 
 
613 aa  177  6e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5571  sensory box histidine kinase YycG  26.27 
 
 
613 aa  177  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51773e-30 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5146  sensor histidine kinase  26.27 
 
 
613 aa  177  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5318  sensory box histidine kinase YycG  26.27 
 
 
613 aa  177  7e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.84 
 
 
597 aa  177  7e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5714  sensory box histidine kinase YycG  26.27 
 
 
613 aa  177  7e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5649  sensory box histidine kinase YycG  26.27 
 
 
613 aa  177  7e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0306249  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 
607 aa  176  1e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 
608 aa  176  1e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.81 
 
 
633 aa  176  1e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 
456 aa  176  2e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1982  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 
658 aa  174  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.826724 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17681  two-component sensor histidine kinase  27.13 
 
 
689 aa  173  9e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.335797  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 
880 aa  173  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
3470 aa  172  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0443  Signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 
475 aa  173  1e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3226  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  27.45 
 
 
650 aa  173  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1628  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 
1026 aa  173  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677715  normal  0.19967 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0053  two component sensor histidine kinase  30.19 
 
 
867 aa  172  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
2783 aa  172  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 
581 aa  172  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 
600 aa  172  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
905 aa  171  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2621  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.31 
 
 
610 aa  171  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.272408  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 
701 aa  171  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0780  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.12 
 
 
669 aa  171  5e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00391757  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 
595 aa  171  6e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.437679  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0912  two-component sensor histidine kinase  26.94 
 
 
689 aa  171  6e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
718 aa  171  7e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3814  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.51 
 
 
1131 aa  170  8e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.257486 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 
1060 aa  170  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 
592 aa  170  9e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  1.1549e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 
1319 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 
725 aa  169  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209286  normal  0.144143 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1400  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 
591 aa  170  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0263941  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0212  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.68 
 
 
953 aa  169  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2533  sensory box histidine kinase YycG  28.54 
 
 
610 aa  169  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2541  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 
874 aa  169  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 
460 aa  168  3e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.52 
 
 
582 aa  168  3e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.37 
 
 
799 aa  168  3e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.976806  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>