More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7253 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 346 aa  687    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  57.83 
 
 		 309 aa  339  4e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  40.06 
 
 		 346 aa  216  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  39.3 
 
 		 293 aa  199  7.999999999999999e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  38.46 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  38.87 
 
 		 304 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  34.74 
 
 		 298 aa  190  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  38.49 
 
 		 353 aa  190  4e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  35.13 
 
 		 326 aa  189  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  34.49 
 
 		 317 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  35.99 
 
 		 325 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  34.19 
 
 		 301 aa  187  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  35.69 
 
 		 298 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  36.04 
 
 		 298 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  37.1 
 
 		 294 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  38.52 
 
 		 307 aa  186  5e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  38.11 
 
 		 313 aa  185  8e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  35.92 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0623  periplasmic solute binding protein  35.35 
 
 		 299 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.917925 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5324  periplasmic solute binding protein  35.33 
 
 		 302 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0773  periplasmic solute binding protein  33.02 
 
 		 335 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  36.77 
 
 		 309 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0800  periplasmic solute binding protein  32.7 
 
 		 335 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.043708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  36.4 
 
 		 371 aa  179  5.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  32.49 
 
 		 303 aa  179  7e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  36.61 
 
 		 309 aa  178  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  35.92 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  38.01 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  34.1 
 
 		 319 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  33.1 
 
 		 292 aa  177  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  34.21 
 
 		 325 aa  176  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  37.54 
 
 		 313 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0678  periplasmic solute binding protein  34.08 
 
 		 299 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0630556 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  31.86 
 
 		 344 aa  173  3.9999999999999995e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  31.33 
 
 		 311 aa  173  5e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  35.29 
 
 		 316 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  31.47 
 
 		 292 aa  171  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  37.06 
 
 		 309 aa  170  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  31.82 
 
 		 292 aa  170  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3392  periplasmic solute binding protein  38.38 
 
 		 320 aa  169  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00563427  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  30.99 
 
 		 292 aa  169  8e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  30.89 
 
 		 292 aa  169  9e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  32.28 
 
 		 292 aa  168  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  34.19 
 
 		 333 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1597  periplasmic solute binding protein  36.7 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0467055 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  34.15 
 
 		 307 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1341  ABC transporter substrate-binding protein  36.14 
 
 		 291 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328207 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2575  Mn transporter MntC  31.35 
 
 		 313 aa  166  5.9999999999999996e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1312  periplasmic solute binding protein  36.4 
 
 		 306 aa  165  9e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2472  periplasmic solute binding protein  35.09 
 
 		 311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5591  periplasmic solute binding protein  37.62 
 
 		 339 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2998  periplasmic solute binding protein  35.96 
 
 		 311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0528665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3046  periplasmic solute binding protein  37.46 
 
 		 336 aa  162  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205239  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  33.99 
 
 		 327 aa  162  8.000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  29.05 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  29.06 
 
 		 328 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3624  periplasmic solute binding protein  35 
 
 		 303 aa  160  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3728  periplasmic solute binding protein  35.33 
 
 		 303 aa  159  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  35.76 
 
 		 317 aa  159  5e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  28.23 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  28.23 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02035  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  33.68 
 
 		 303 aa  158  2e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  33.78 
 
 		 301 aa  157  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0845  periplasmic solute binding protein  37.46 
 
 		 289 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0688938 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0328  periplasmic solute binding protein  35.25 
 
 		 323 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.22 
 
 		 315 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  28.23 
 
 		 311 aa  155  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0701  periplasmic solute binding protein  31.08 
 
 		 313 aa  155  7e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000705514  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  28.87 
 
 		 303 aa  155  9e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  29.57 
 
 		 308 aa  155  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3980  periplasmic solute binding protein  30.33 
 
 		 354 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.749936 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  32.16 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10491  ABC transporter substrate-binding protein  28.94 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.232212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1278  periplasmic solute binding protein  34.93 
 
 		 315 aa  153  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  32.39 
 
 		 301 aa  153  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1591  periplasmic solute binding protein  40.88 
 
 		 497 aa  152  8e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  35.64 
 
 		 306 aa  152  8e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30 
 
 		 313 aa  152  8.999999999999999e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1316  Mn transporter MntC  32.67 
 
 		 345 aa  152  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.832277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  30.39 
 
 		 341 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  35.99 
 
 		 310 aa  151  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  32.86 
 
 		 349 aa  150  2e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1207  periplasmic solute binding protein  32.98 
 
 		 324 aa  150  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773922  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1164  periplasmic solute binding protein  34.72 
 
 		 321 aa  149  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0282  periplasmic solute binding protein  28.83 
 
 		 346 aa  150  5e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000440667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3560  periplasmic solute binding protein  32.39 
 
 		 307 aa  149  6e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.24573 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18691  ABC transporter substrate-binding protein  30.38 
 
 		 287 aa  149  8e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.349553 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4030  periplasmic solute binding protein  33.1 
 
 		 305 aa  149  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0298524  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  28.18 
 
 		 339 aa  149  9e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  33.78 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3280  periplasmic solute binding protein  32.72 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.956978  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1226  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  28.53 
 
 		 312 aa  147  3e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1258  periplasmic solute binding protein  39.46 
 
 		 494 aa  147  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00438687  decreased coverage  0.000164305 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3282  periplasmic solute binding protein  31.83 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1794  hypothetical protein  32.64 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2853  periplasmic solute binding protein  34.49 
 
 		 321 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3070  periplasmic solute binding protein  34.38 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1815  periplasmic solute binding protein  29.87 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.566125  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0822  periplasmic solute binding protein  29.34 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000237297  normal  0.0439411 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0222  periplasmic solute binding protein  28.48 
 
 		 306 aa  144  3e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>