More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4774 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4774  major facilitator transporter  100 
 
 		 443 aa  859    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33800  Major Facilitator Superfamily transporter  53.13 
 
 		 505 aa  423  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.714924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0499  major facilitator superfamily MFS_1  55.04 
 
 		 436 aa  405  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0294365  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2608  major facilitator superfamily MFS_1  51.45 
 
 		 426 aa  391  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.669442  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  46.85 
 
 		 445 aa  331  2e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1264  major facilitator superfamily MFS_1  44.82 
 
 		 422 aa  323  3e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62642  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4618  major facilitator transporter  46.52 
 
 		 426 aa  319  6e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0850  major facilitator superfamily MFS_1  46.57 
 
 		 408 aa  319  7.999999999999999e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.427056  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1007  hypothetical protein  44.09 
 
 		 415 aa  273  5.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.767675  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0063  major facilitator superfamily protein  44.01 
 
 		 419 aa  263  4e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.586585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0836  major facilitator superfamily MFS_1  42.66 
 
 		 443 aa  263  6e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2780  major facilitator superfamily MFS_1  40.86 
 
 		 423 aa  255  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.018642 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1719  major facilitator superfamily MFS_1  39.1 
 
 		 447 aa  251  2e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0425  major facilitator transporter  42.34 
 
 		 430 aa  248  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4653  major facilitator superfamily MFS_1  41.4 
 
 		 438 aa  245  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  38.9 
 
 		 449 aa  245  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0513  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 430 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000815548 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0832  major facilitator superfamily MFS_1  42.79 
 
 		 443 aa  228  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533006  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0261  major facilitator superfamily MFS_1  38.26 
 
 		 438 aa  222  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0905059 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3075  major facilitator transporter  42.09 
 
 		 423 aa  221  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10460  Major Facilitator Superfamily transporter  36.41 
 
 		 450 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.283421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  35.99 
 
 		 422 aa  208  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6079  hypothetical protein  35.7 
 
 		 420 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.533874  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3197  major facilitator superfamily MFS_1  39.86 
 
 		 427 aa  203  6e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000392196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1693  major facilitator superfamily MFS_1  36.77 
 
 		 422 aa  201  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00531073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  28.81 
 
 		 428 aa  168  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2356  major facilitator superfamily MFS_1  36.27 
 
 		 426 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4356  major facilitator superfamily MFS_1  34.69 
 
 		 388 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4368  major facilitator superfamily permease  34.01 
 
 		 431 aa  159  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1388  hypothetical protein  30.15 
 
 		 404 aa  151  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1608  hypothetical protein  30.39 
 
 		 404 aa  149  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  31.28 
 
 		 415 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 524 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2863  major facilitator superfamily MFS_1  38.48 
 
 		 445 aa  141  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  32.47 
 
 		 415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  31.6 
 
 		 421 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  31.55 
 
 		 403 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  31.74 
 
 		 403 aa  123  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1861  enterobactin exporter EntS  31.58 
 
 		 443 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2622  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 411 aa  120  6e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0980  major facilitator transporter  30 
 
 		 413 aa  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2733  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 415 aa  119  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.862267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1327  enterobactin exporter EntS  28.15 
 
 		 424 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00590508  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  29.72 
 
 		 412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10048  putative transporter  26.43 
 
 		 424 aa  118  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0118  major facilitator superfamily MFS_1  24.04 
 
 		 425 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  29.31 
 
 		 415 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1498  enterobactin exporter EntS  28.07 
 
 		 432 aa  116  8.999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.201643  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5805  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  28.94 
 
 		 419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.774942 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3729  enterobactin exporter EntS  28.97 
 
 		 426 aa  114  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.818592  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2812  hypothetical protein  28.07 
 
 		 399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287004  normal  0.40248 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 451 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 406 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2940  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 		 422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 		 406 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 406 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2160  major facilitator superfamily permease  28.29 
 
 		 427 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.797788 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0124  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 403 aa  112  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 		 440 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1069  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 421 aa  111  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3450  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 418 aa  111  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 416 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17670  protein of unknown function (DUF894)  34.66 
 
 		 343 aa  109  9.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 410 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 499 aa  108  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  28.81 
 
 		 479 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 416 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 416 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 416 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0591  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 427 aa  107  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.584321  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1952  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 		 418 aa  106  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 416 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1281  major facilitator superfamily transporter  31.05 
 
 		 415 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  26.38 
 
 		 442 aa  105  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 416 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4201  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 		 432 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4311  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 		 432 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  26.57 
 
 		 420 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4386  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 411 aa  103  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.291842 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  29.01 
 
 		 446 aa  103  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  29.84 
 
 		 360 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4751  major facilitator superfamily protein  27.3 
 
 		 421 aa  102  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.092373  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  27.12 
 
 		 453 aa  102  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1046  major facilitator transporter  28.13 
 
 		 437 aa  102  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5278  hypothetical protein  28.14 
 
 		 408 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306023  normal  0.251543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0372  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 		 416 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.862207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 415 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1342  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 		 401 aa  100  6e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000002456 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 		 417 aa  100  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  26.24 
 
 		 420 aa  100  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2102  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 427 aa  99.8  8e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0117925  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 		 412 aa  99.8  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3371  major facilitator transporter  29.09 
 
 		 413 aa  98.6  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 447 aa  98.2  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  25.18 
 
 		 436 aa  98.6  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  26.41 
 
 		 411 aa  97.1  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0309  drug:proton antiporter  26.19 
 
 		 414 aa  97.1  6e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>