31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0018 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0018  hypothetical protein  100 
 
 
550 aa  1093  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.830051  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17350  CRISPR-associated protein, Cse1 family  44.85 
 
 
567 aa  418  1e-115  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1535  Cse1 family CRISPR-associated protein  34.04 
 
 
568 aa  197  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1600  CRISPR-associated Cse1 family protein  34.92 
 
 
555 aa  196  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214237  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2680  CRISPR-associated protein, Cse1 family  35.08 
 
 
561 aa  192  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00401114  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0988  CRISPR-associated protein, Cse1 family  34.6 
 
 
540 aa  187  6e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1281  CRISPR-associated protein, Cse1 family  36.07 
 
 
573 aa  178  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3054  CRISPR-associated protein, Cse1 family  31.45 
 
 
555 aa  176  9e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.044999  decreased coverage  9.2711e-05 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3909  CRISPR-associated protein, Cse1 family  33.41 
 
 
1540 aa  175  2e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0587749  normal  0.0865606 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2573  CRISPR-associated Cse1 family protein  30.89 
 
 
560 aa  155  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1896  CRISPR-associated protein, Cse1 family  30.93 
 
 
533 aa  130  9e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2342  CRISPR-associated Cse1 family protein  26.86 
 
 
506 aa  113  9e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0650  CRISPR-associated Cse1 family protein  27.68 
 
 
525 aa  100  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2825  CRISPR-associated Cse1 family protein  28.49 
 
 
517 aa  100  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3019  Cse1 family CRISPR-associated protein  28.57 
 
 
516 aa  97.4  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  3.06277e-06  normal  0.0835975 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1230  CRISPR-associated protein, Cse1 family  29.39 
 
 
561 aa  96.3  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  2.14368e-06  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2439  CRISPR-associated protein, Cse1 family  24.26 
 
 
525 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17180  hypothetical protein  28.78 
 
 
516 aa  87.4  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0760  CRISPR system CASCADE complex protein CasA  27.61 
 
 
556 aa  84  6e-15  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0334414 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2630  CRISPR-associated Cse1 family protein  28.65 
 
 
573 aa  82.8  2e-14  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1972  CRISPR-associated Cse1 family protein  26.7 
 
 
495 aa  73.6  9e-12  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.355127  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3760  CRISPR-associated Cse1 family protein  26.65 
 
 
525 aa  66.6  1e-09  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.33895 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1592  CRISPR-associated Cse1 family protein  30.39 
 
 
549 aa  64.3  6e-09  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.440854  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4093  CRISPR-associated protein, Cse1 family  24.23 
 
 
518 aa  63.5  9e-09  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0923  CRISPR-associated protein, Cse1 family  26.09 
 
 
540 aa  57  9e-07  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2671  CRISPR-associated protein, Cse1 family  24.56 
 
 
507 aa  55.5  3e-06  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13870  CRISPR-associated protein, Cse1 family  25.4 
 
 
484 aa  55.1  3e-06  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.578004  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0942  CRISPR-associated protein, Cse1 family  28.38 
 
 
722 aa  53.5  1e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0911  CRISPR-associated protein, Cse1 family  23.68 
 
 
507 aa  52  3e-05  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0827  CRISPR-associated Cse1 family protein  26 
 
 
545 aa  50.1  9e-05  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17140  CRISPR-associated protein, Cse1 family  27.48 
 
 
525 aa  49.7  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>