More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1729 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1849  extracellular solute-binding protein  62.23 
 
 		 614 aa  782    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000095247  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0475  4-phytase  54.98 
 
 		 614 aa  721    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0460  4-phytase  55.14 
 
 		 615 aa  726    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1729  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 615 aa  1247    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000266848  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0348  extracellular solute-binding protein  68.23 
 
 		 617 aa  894    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.663793  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1575  extracellular solute-binding protein  48.54 
 
 		 617 aa  625  1e-178  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000589717  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04900  extracellular solute-binding protein family 5  46.29 
 
 		 601 aa  543  1e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016301  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0133  extracellular solute-binding protein  37.6 
 
 		 576 aa  405  1e-111  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2122  extracellular solute-binding protein  33.04 
 
 		 573 aa  301  2e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.973923 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0554  extracellular solute-binding protein  29.95 
 
 		 581 aa  264  3e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1255  extracellular solute-binding protein family 5  30.15 
 
 		 566 aa  242  1e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  27.9 
 
 		 515 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2203  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 		 872 aa  154  2.9999999999999998e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000826446 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 		 535 aa  151  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  24.68 
 
 		 535 aa  150  9e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  24.68 
 
 		 535 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  24.68 
 
 		 535 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  24.68 
 
 		 535 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  24.68 
 
 		 535 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  24.68 
 
 		 535 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  24.96 
 
 		 526 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  24.68 
 
 		 535 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  24.96 
 
 		 526 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  24.68 
 
 		 535 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  24.96 
 
 		 526 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  24.96 
 
 		 526 aa  148  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  24.66 
 
 		 534 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  24.8 
 
 		 526 aa  147  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  24.78 
 
 		 520 aa  145  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  25.56 
 
 		 535 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  24.63 
 
 		 520 aa  141  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  24.02 
 
 		 535 aa  141  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  24.02 
 
 		 535 aa  141  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  24.02 
 
 		 535 aa  141  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3888  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  24.79 
 
 		 550 aa  140  8.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.799639  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  24.19 
 
 		 535 aa  139  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0973  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 		 532 aa  139  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  25.88 
 
 		 524 aa  139  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2532  extracellular solute-binding protein family 5  25.87 
 
 		 525 aa  138  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  23.35 
 
 		 532 aa  138  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0925  extracellular solute-binding protein family 5  26.27 
 
 		 523 aa  137  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.30323 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  24.24 
 
 		 541 aa  136  9e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  23.6 
 
 		 535 aa  134  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  24.19 
 
 		 535 aa  133  7.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  24.88 
 
 		 509 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  23.91 
 
 		 535 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  24.03 
 
 		 535 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58360  putative binding protein component of ABC transpor  24.59 
 
 		 532 aa  132  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5111  ABC transporter periplasmic binding protein  25.09 
 
 		 532 aa  131  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.914948  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1906  extracellular solute-binding protein  25.04 
 
 		 543 aa  131  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0377443  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  22.85 
 
 		 526 aa  130  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1248  extracellular solute-binding protein  23.38 
 
 		 537 aa  129  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.710714 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2107  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 532 aa  129  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2816  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 545 aa  128  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.54552  normal  0.0589435 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  22.64 
 
 		 501 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0038  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 532 aa  127  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.216937  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3231  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  25.33 
 
 		 532 aa  126  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3969  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 532 aa  126  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  22.74 
 
 		 521 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.74 
 
 		 521 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3283  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 		 545 aa  125  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  22.74 
 
 		 521 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 		 528 aa  126  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  25.76 
 
 		 532 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2998  extracellular solute-binding protein family 5  23.71 
 
 		 610 aa  125  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.869563  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  22.74 
 
 		 521 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  24.21 
 
 		 530 aa  125  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1917  extracellular solute-binding protein  26.49 
 
 		 518 aa  125  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2326  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 		 546 aa  124  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.294702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  25.93 
 
 		 544 aa  124  4e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  24.13 
 
 		 516 aa  124  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  24.51 
 
 		 532 aa  124  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0244  extracellular solute-binding protein family 5  22.99 
 
 		 575 aa  124  7e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.794885  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4180  extracellular solute-binding protein family 5  25.79 
 
 		 547 aa  123  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3431  extracellular solute-binding protein  23.49 
 
 		 531 aa  122  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000878954 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  22.35 
 
 		 501 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  26.88 
 
 		 540 aa  122  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3867  extracellular solute-binding protein family 5  23.29 
 
 		 536 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1855  twin-arginine translocation pathway signal  24.26 
 
 		 540 aa  120  7.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686889  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6149  extracellular solute-binding protein family 5  26.7 
 
 		 566 aa  120  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.784749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1690  extracellular solute-binding protein  24.28 
 
 		 532 aa  120  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23662  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  23.23 
 
 		 516 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 528 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 		 516 aa  118  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0484  extracellular solute-binding protein  24.64 
 
 		 523 aa  118  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.036637  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 		 525 aa  118  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0389  extracellular solute-binding protein  24.04 
 
 		 527 aa  118  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000716553  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2065  extracellular solute-binding protein family 5  23 
 
 		 543 aa  118  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  23.26 
 
 		 529 aa  118  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  25.43 
 
 		 495 aa  118  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  25.77 
 
 		 540 aa  117  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  23.27 
 
 		 516 aa  117  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3852  extracellular solute-binding protein family 5  24.92 
 
 		 547 aa  117  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0372  extracellular solute-binding protein  23.33 
 
 		 529 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.132597  normal  0.149219 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  24.32 
 
 		 546 aa  117  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  23.27 
 
 		 516 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  23.27 
 
 		 516 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  23.1 
 
 		 516 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2930  extracellular solute-binding protein family 5  22.98 
 
 		 531 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 		 540 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>